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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG020130
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 5399865-5404336 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3110 bp · TkAUNG020130|TK1151|cDNA

CTGGAGGGTAGAGGAGAGCACACACTCACAGAACAACGCAAGACAACGAAAGAGATGGCGGGAGAAAATGCCGGTGGAGAGAACCGTTCCAATCAGTCACCTGCTTCATCAGACCAAGGCGGTAACCCCAATTCAAGCCAATTTAATGGGAATCCACCCTCTACGCCGGATTCCCCCACCTCTGCTGGATTTAATACAGATCAGCTTCCTTTCAATAGCCGCACCTCGGAAAATTACTCTGACTTCGACGACGACGAGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2895 bp · TkAUNG020130|TK1151|CDS

ATGGCGGGAGAAAATGCCGGTGGAGAGAACCGTTCCAATCAGTCACCTGCTTCATCAGACCAAGGCGGTAACCCCAATTCAAGCCAATTTAATGGGAATCCACCCTCTACGCCGGATTCCCCCACCTCTGCTGGATTTAATACAGATCAGCTTCCTTTCAATAGCCGCACCTCGGAAAATTACTCTGACTTCGACGACGACGAGGCTGCCGTTGATCCAAATATCATCAGGGATGATATTGAGGATGGCGACGAGGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

964 aa · TkAUNG020130|TK1151|PROTEIN

MAGENAGGENRSNQSPASSDQGGNPNSSQFNGNPPSTPDSPTSAGFNTDQLPFNSRTSENYSDFDDDEAAVDPNIIRDDIEDGDEDEGEGEDLFNENYIDDYRRLDEHDQYESVGLDDSLEDERDLDQIMADRRAAEIELDTREGVASRAKLPHLLNDQDTDDDSYRPSKRTRAPPGPRGGDDNDAMQSSPGRSQRNNLSGEDIPMTDATDDDQYEDDDNDEGEFEMYRVQGTLREWVTRDEVRRFIAKKFKEFLLTYEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG020130
TK1151 IDTkAUNG020130
OH-1004 IDLXL04_001754
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)32.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 66.494 / OH-1004 75.090
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG020130
位置ChrUn:5399865-5404336 (-)
描述Similar to MCM4: DNA replication licensing factor MCM4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g44900 MCM2-7 复合物的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。
The Arabidopsis MCM2 gene is essential to embryo development and its over-expression alters root meristem function.2009 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2009.02961.x
Arabidopsis thaliana MCM2 plays role(s) in mungbean yellow mosaic India virus (MYMIV) DNA replication.2013 · DOI: 10.1007/s00705-012-1563-9

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BKI8 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
Os11g0484300 MCM2-7 复合物的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。
Identification and characterization of a rice MCM2 homologue required for DNA replication.2008 · DOI: 10.5483/bmbrep.2008.41.8.581
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001754 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000727 double-strand break repair via break-induced replication 生物过程
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程
GO:0006271 DNA strand elongation involved in DNA replication 生物过程
GO:0006279 premeiotic DNA replication 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0030174 regulation of DNA-templated DNA replication initiation 生物过程
GO:0033260 nuclear DNA replication 生物过程
GO:0044786 cell cycle DNA replication 生物过程
GO:1902975 mitotic DNA replication initiation 生物过程
GO:0000347 THO complex 细胞组分
GO:0000785 chromatin 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16440
spo:2539164
xla:397843
xtr:448137
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.927
排名 1 · TkAUNG020130 · TK1151
细胞质0.159
排名 2 · TkAUNG020130 · TK1151
线粒体0.023
排名 3 · TkAUNG020130 · TK1151
细胞膜0.017
排名 4 · TkAUNG020130 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkAUNG020130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12619MCM2_N66-174 aa
PF14551MCM_N249-342 aa
PF17207MCM_OB348-475 aa
PF09723Zn_ribbon_8382-412 aa
PF12639Colicin-DNase483-531 aa
PF00493MCM516-737 aa
PF01078Mg_chelatase560-588 aa
PF00158Sigma54_activat570-685 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG020130PF12619MCM2_N661742e-0938.6
TkAUNG020130PF14551MCM_N2493425.8e-1865.8
TkAUNG020130PF17207MCM_OB3484754.6e-35120.8
TkAUNG020130PF09723Zn_ribbon_83824120.02815.2
TkAUNG020130PF12639Colicin-DNase4835310.2213.1
TkAUNG020130PF00493MCM5167378.1e-102339.8
TkAUNG020130PF01078Mg_chelatase5605882.9e-0834.1
TkAUNG020130PF00158Sigma54_activat5706850.01815.4
TkAUNG020130PF07728AAA_55726911.8e-0628.7
TkAUNG020130PF07726AAA_35736880.0005220.6
TkAUNG020130PF01078Mg_chelatase6266942.9e-0834.1
TkAUNG020130PF12619MCM2_N6426612e-0938.6
TkAUNG020130PF17855MCM_lid7748589.1e-2587.7
TkAUNG020130PF23669WHD_MCM28829589.8e-1864.8
TkAUNG020130PF30801DUF499_6th8909540.1613.1
TkAUNG020130PF00158Sigma54_activat9099290.01815.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LPD9拟南芥sp|Q9LPD9|MCM2_ARATH DNA replication licensing factor MCM274.500%Swiss-Prot高置信
B8BKI8水稻sp|B8BKI8|MCM2_ORYSI DNA replication licensing factor MCM275.700%Swiss-Prot高置信
Q2R482水稻sp|Q2R482|MCM2_ORYSJ DNA replication licensing factor MCM275.700%Swiss-Prot高置信

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