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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG020090
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 5380179-5384345 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1175 bp · TkAUNG020090|TK1151|cDNA

GTTCCAGTAGTCTGCCGGAAACGGTTTCCTTCCTTCATGCTTCATTCATGTAGCACAGTAGCAGCAGCAAGCCGACTAAATTCCGTTCACTCAACTACTAGATTCCCTCTTCAGATGGCAGGTGGTCGTAAGTTGTTAGCAGCAGCGGTGGCGGTCGGAATAGTTTCGGCAGTGTTGAAGGTCAAAGGACCATCGATATGGGACAAAGACGCGGTCGTCGATTTCTTCAGAAACATGTCTGATCGATTGGGTAATTGGGC...

1497 bp · TkAUNG020090|TK1151|CDS

ATGAAAGAATTACCTTTGAATTTGCTGAGGGGATGGGAGAAGACGAAGGAAGCAATATTTTTCGGATTCGCCATTACCGCCCTAAATTATGAGAAAGCGAGTCTCAAGCCTTTCAACTACTTGGATTTACACTGTAAGAATTATGAGTTCAAACTTCAAAGTGACATGATAATTGATTCGGTGGTGCATCTACTTGGTGCTGCTGAGGAAAAAAGAAATTACAAAATCATCAGGGATGATATTGAGGATGGCGACGAGGA...

498 aa · TkAUNG020090|TK1151|PROTEIN

MKELPLNLLRGWEKTKEAIFFGFAITALNYEKASLKPFNYLDLHCKNYEFKLQSDMIIDSVVHLLGAAEEKRNYKIIRDDIEDGDEDEGEGEDLFNDNYIEDYRGMEEHDQYESVGLDDSLEDERDLDQIMADRLCHQDFIRLYNLLLNDKLINEYSLKQLGHSIGLLVPVVCRKRFPSFMLHSCSTVAAASRLNSVHSTTRFPLQMAGGRKLLAAAVAVGIVSAVLKVKGPSIWDKDAVVDFFRNMSDRLGNWAIPVYV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG020090
TK1151 IDTkAUNG020090
OH-1004 IDLXL04_004597
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 13.855 / OH-1004 16.468
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG020090
位置ChrUn:5380179-5384345 (-)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g44900 MCM2-7 复合物的可能组成部分,可充当 DNA 解旋酶,对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BKI8 MCM2-7 复合物(MCM 复合物)的可能组成部分,可充当 DNA 解旋酶,对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
Os11g0484300 MCM2-7 复合物的可能组成部分,可充当 DNA 解旋酶,对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004597 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)暂无功能描述
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

内质网0.474
排名 1 · TkAUNG020090 · TK1151
细胞核0.153
排名 2 · TkAUNG020090 · TK1151
高尔基体0.135
排名 3 · TkAUNG020090 · TK1151
细胞质0.107
排名 4 · TkAUNG020090 · TK1151
质体0.104
排名 5 · TkAUNG020090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12619MCM2_N76-134 aa
PF09335VTT_dom272-314 aa
PF09335VTT_dom363-444 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG020090PF12619MCM2_N761349.7e-0833.2
TkAUNG020090PF09335VTT_dom2723142.3e-1867.6
TkAUNG020090PF09335VTT_dom3634442.3e-1867.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LPD9拟南芥sp|Q9LPD9|MCM2_ARATH DNA replication licensing factor MCM268.200%Swiss-Prot低置信
B8BKI8水稻sp|B8BKI8|MCM2_ORYSI DNA replication licensing factor MCM280.000%Swiss-Prot低置信
Q2R482水稻sp|Q2R482|MCM2_ORYSJ DNA replication licensing factor MCM280.000%Swiss-Prot低置信

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