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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG008750
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 2207608-2212350 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3670 bp · TkAUNG008750|TK1151|cDNA

TCGTGTGGATATTTAGTTTGGATCCATTACAAAATCAGGCCTGAATCATACATGTTAACCGTCTTCCCACCGTTAACTGCCATGTGGTTCTGTTGTACATTGCATCATCTTCGTTTTGTGTGTTTGCATACATACATACAAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATCCCGAGTCTCTCTCCTAACAAAACTCCTCTCCTCTCCTCACTCGTACTCCCATTTTTCGTTTCCAGAA...

2637 bp · TkAUNG008750|TK1151|CDS

ATGGCGGTGAATGAATGGATCAATGGGTATTTAGAGGCGATATTAAGTAGTAAACCGGCGAATATTGAAGATACGAAGGTGAATTTGCGAGACCAAGGGCATTTTAATCCGACGAAGTATTTCGTTGAAGAAGTCGTTACCGGAGTCGACGAGACTGATTTGCATCGGACATGGATCAAGGTCGTCGCTACCCGAAACACCAGAGAAAGGAGTTCCAGACTCGAAAATATGTGTTGGCGTATATGGCATCTCACTCGCAA...

878 aa · TkAUNG008750|TK1151|PROTEIN

MAVNEWINGYLEAILSSKPANIEDTKVNLRDQGHFNPTKYFVEEVVTGVDETDLHRTWIKVVATRNTRERSSRLENMCWRIWHLTRKKKQLEWEDYQRIAKRKFEREKGRNDVREDMSEDLSEAEKGDILGEPATLTSDSPKKTYQHIPSTVEVWSDDKKEKKLYIILISLHGLVRGDNMELGRDSDTGGQTKYVVELARALAKTPGVYRVDLFTRQVSSPEVDWSYGEPTEMLTVGSEDPDDNIGESSGAYIIRIPFGP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG008750
TK1151 IDTkAUNG008750
OH-1004 IDLXL04_028085
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.900 / OH-1004 79.962
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG008750
位置ChrUn:2207608-2212350 (+)
描述Similar to SPS1: Probable sucrose-phosphate synthase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g04920 在光合作用蔗糖合成中起作用,通过催化UDP-葡萄糖和果糖-6-磷酸生成蔗糖生物合成的限速步骤。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2WYE9 在光合作用蔗糖合成中起作用,通过催化UDP-葡萄糖和果糖-6-磷酸生成蔗糖生物合成的限速步骤。 暂无已核实直接文献
Os01g0919400 在光合作用蔗糖合成中起作用,通过催化UDP-葡萄糖和果糖-6-磷酸生成蔗糖生物合成的限速步骤。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_028085 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0005986 sucrose biosynthetic process 生物过程
GO:0071836 nectar secretion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0046524 sucrose-phosphate synthase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G20280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.225
排名 1 · TkAUNG008750 · TK1151
细胞质0.224
排名 2 · TkAUNG008750 · TK1151
细胞膜0.207
排名 3 · TkAUNG008750 · TK1151
内质网0.141
排名 4 · TkAUNG008750 · TK1151
高尔基体0.130
排名 5 · TkAUNG008750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08550GATA_AreA70-83 aa
PF00862GT-B_Sucrose_synth165-437 aa
PF13579Glyco_trans_4_4189-387 aa
PF13439Glyco_transf_4189-349 aa
PF14552Tautomerase_2194-228 aa
PF14552Tautomerase_2347-391 aa
PF13439Glyco_transf_4421-431 aa
PF00534Glycos_transf_1472-644 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG008750PF08550GATA_AreA70830.0009219.7
TkAUNG008750PF00862GT-B_Sucrose_synth1654373.8e-1246.4
TkAUNG008750PF13579Glyco_trans_4_41893871.7e-0629.2
TkAUNG008750PF13439Glyco_transf_41893498.9e-0626.5
TkAUNG008750PF14552Tautomerase_21942280.08513.7
TkAUNG008750PF14552Tautomerase_23473910.08513.7
TkAUNG008750PF13439Glyco_transf_44214318.9e-0626.5
TkAUNG008750PF00534Glycos_transf_14726449.9e-2484.5
TkAUNG008750PF13692Glyco_trans_1_44776331.4e-1558.5
TkAUNG008750PF20706GT4-conflict5696020.007416.0
TkAUNG008750PF13439Glyco_transf_45806028.9e-0626.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RY24拟南芥sp|Q8RY24|SPSA3_ARATH Probable sucrose-phosphate synthase 375.500%Swiss-Prot高置信
A2WYE9水稻sp|A2WYE9|SPSA1_ORYSI Probable sucrose-phosphate synthase 166.900%Swiss-Prot高置信
Q0JGK4水稻sp|Q0JGK4|SPSA1_ORYSJ Probable sucrose-phosphate synthase 166.900%Swiss-Prot高置信

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