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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG003320
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 1010163-1014515 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2078 bp · TkAUNG003320|TK1151|cDNA

CCGGAAAAGGGTTGTGGAAAGGCACAAAAACCCTTTTTATCGGAGAAGGTGTATAAATATGGACACCAGATTCTATTCATCCCCAAAATCCCCTCTCCATTCAAGGAATAATTTCCTCCCACGCCTTCTTCATCTTTCCACAGCATTTCCGGCAACCGTCTCCTCTGCCGCCGTGGCCACCACCGCGCAAATATGGACCACGCTCCTAAATAAACTTATTCCTTTAATGTTTGAAGATTCTGATAGTTCCAGATTATAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1446 bp · TkAUNG003320|TK1151|CDS

ATGAACGACGAAGCCCCCAAAAATGAAAAGGTTATAGAGATCGAAGATGGTGATGATCACGAGGACCAATCGTCTCCGAGAGGTGTGTTGGAAATCCCCGTATCAGGTTCGGATTCCGATAATCAGAGCAGCCTAAGCAGGAGCCTCAGCAGCCGCGGTTCGTCTTTCAATGATAAATCTCCGGATGGAGAAGTTGATTCGGCTACCGAGGAGGAAGGCAGCGGCGGAGCGGAGGTTGTCAACTCTTCGGCGACGGCTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

481 aa · TkAUNG003320|TK1151|PROTEIN

MNDEAPKNEKVIEIEDGDDHEDQSSPRGVLEIPVSGSDSDNQSSLSRSLSSRGSSFNDKSPDGEVDSATEEEGSGGAEVVNSSATAHGLQWRNLVDNLKWKSIKRLSALPLMAGYELSRKSLMKRLGKNQSIEDTIEGGNWAVPKPSWRNFTLEELATATDNFSSGNLVGRGGHADVYKGLLPDGQLVAVKRITKKEKKDEDRVGDFLSELGIIAHINHPNAARLIGFSSDTDLHLVLQFAPHGSLATLLHNSEERLEWG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG003320
TK1151 IDTkAUNG003320
OH-1004 IDLXL04_014016
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.376 / OH-1004 98.755
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG003320
位置ChrUn:1010163-1014515 (-)
描述Similar to RBK1: Receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10520 受体样胞质丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RBK1。 暂无已核实直接文献
At3g05140 类受体胞质丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 RBK2。 暂无已核实直接文献
At5g57670 可能的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g57670。 暂无已核实直接文献
At3g18810 推定的富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK6。 暂无已核实直接文献
At1g52290 富脯氨酸受体样蛋白激酶PERK15。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014016 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071369 cellular response to ethylene stimulus 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52290
ath:AT2G18470
ath:AT3G05140
ath:AT5G10520
ath:AT5G57670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.716
排名 1 · TkAUNG003320 · TK1151
细胞核0.223
排名 2 · TkAUNG003320 · TK1151
细胞质0.212
排名 3 · TkAUNG003320 · TK1151
内质网0.041
排名 4 · TkAUNG003320 · TK1151
高尔基体0.026
排名 5 · TkAUNG003320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03832WSK100-106 aa
PF00069Pkinase165-375 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr167-430 aa
PF03109ABC1175-194 aa
PF03109ABC1280-322 aa
PF17667Pkinase_fungal281-343 aa
PF03832WSK358-371 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG003320PF03832WSK1001062.48.7
TkAUNG003320PF00069Pkinase1653753.8e-39135.4
TkAUNG003320PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1674309.2e-41140.6
TkAUNG003320PF03109ABC11751940.006216.4
TkAUNG003320PF03109ABC12803220.006216.4
TkAUNG003320PF17667Pkinase_fungal2813430.02314.1
TkAUNG003320PF03832WSK3583712.48.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H1D6拟南芥sp|Q8H1D6|RBK1_ARATH Receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK158.500%Swiss-Prot高置信
Q8RXC8拟南芥sp|Q8RXC8|RBK2_ARATH Receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK249.200%Swiss-Prot中等置信
Q5XF57拟南芥sp|Q5XF57|Y5576_ARATH Probable receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g5767049.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LS95拟南芥sp|Q9LS95|PERK6_ARATH Putative proline-rich receptor-like protein kinase PERK640.100%Swiss-Prot中等置信
Q9C821拟南芥sp|Q9C821|PEK15_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1538.600%Swiss-Prot中等置信

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