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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG002520
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 777643-782576 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1832 bp · TkAUNG002520|TK1151|cDNA

TTCGTCCCTTGCACTTTCTTAAATATTCAGTCAGAAAAATTACATAAAGGAAAATAGTAGAAACGACACTCTCTTCTGTCTCGTCGGTTTCCTTTTACACAACAGTCCTCTACTCAAATCCCCAAGAACCAGACCACTTCACCCAATTCACCCCTCGTCCCTGGCATCAATCAAATTTCCTTCAAATCTCTTGTTAAATATGCAAAAGCTCTGTATGTTCTTCATAGGGTTTTCTTATGCTTTCTAATTTCTTAAGTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

672 bp · TkAUNG002520|TK1151|CDS

ATGATGGCTAGGGAAAAAGTACCGATCAAAAAAATTGACAATGCCGCAGCAAGAAGGGTGACTTTCTCCAAAAGGAGAAGAGGGTTATTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTACTTTGCGATGCTGATGTTGCTATCATCATCTTCTCCTCTAATGATAAGCTCTTTCACTATTCGAGCTCAAGTATCAATGAAGTACTTGAAAGGCGTAGCTTGCACTCGAAAAATCTTGAGAAGTTGAACCAACCATCCCTTGAGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

223 aa · TkAUNG002520|TK1151|PROTEIN

MMAREKVPIKKIDNAAARRVTFSKRRRGLFKKAEELSVLCDADVAIIIFSSNDKLFHYSSSSINEVLERRSLHSKNLEKLNQPSLELQLVEDTNYANLSKEVAERTLQLRQLRGEELQGLSIEELHQIEKTLEVGLSRVVAKKGEVIMNEINHLQEKEVKLMEENNKLKQELLKISNAWKLTGDSGDDGGSSESTNISNSDGPPQDYESSGTSLKLGLPYSGV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG002520
TK1151 IDTkAUNG002520
OH-1004 IDLXL04_013426
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)40.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 76.682 / OH-1004 70.782
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG002520
位置ChrUn:777643-782576 (-)
描述Similar to Agamous-like MADS-box protein AGL8 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g22540 转录抑制因子，在自主开花途径中抑制花期转变，独立于光周期和温度。 暂无已核实直接文献
At4g24540 转录激活因子，介导植物对春化作用的花器官转变。
AGAMOUS-LIKE 24, a dosage-dependent mediator of the flowering signals.2002 · DOI: 10.1073/pnas.212624599
AGL24 acts as a promoter of flowering in Arabidopsis and is positively regulated by vernalization.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01671.x
An Arabidopsis MADS-box protein, AGL24, is specifically bound to and phosphorylated by meristematic receptor-like kinase (MRLK).2003 · DOI: 10.1093/pcp/pcg092
AGL24, SHORT VEGETATIVE PHASE, and APETALA1 redundantly control AGAMOUS during early stages of flower development in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.041798
Direct interaction of AGL24 and SOC1 integrates flowering signals in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1242/dev.020255
AGAMOUS-LIKE24 and SHORT VEGETATIVE PHASE determine floral meristem identity in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03648.x
The Arabidopsis floral meristem identity genes AP1, AGL24 and SVP directly repress class B and C floral homeotic genes.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03985.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0761000 可能的转录因子。
OsMADS22, an STMADS11-like MADS-box gene of rice, is expressed in non-vegetative tissues and its ectopic expression induces spikelet meristem indeterminacy.2005 · DOI: 10.1007/s00438-004-1093-6
Rice SVP-group MADS-box proteins, OsMADS22 and OsMADS55, are negative regulators of brassinosteroid responses.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03406.x
Os06g0217300 转录因子，充当油菜素甾醇信号传导的负调节因子。
Rice SVP-group MADS-box proteins, OsMADS22 and OsMADS55, are negative regulators of brassinosteroid responses.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03406.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013426 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000977 RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
sot:102577795
vvi:100232952
vvi:100232953
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.939
排名 1 · TkAUNG002520 · TK1151
细胞质0.130
排名 2 · TkAUNG002520 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkAUNG002520 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkAUNG002520 · TK1151
质体0.013
排名 5 · TkAUNG002520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00319SRF-TF11-58 aa
PF12436USP7_ICP0_bdg60-105 aa
PF01486K-box71-81 aa
PF01486K-box93-172 aa
PF28633LIC4_C93-111 aa
PF06156YabA97-113 aa
PF12436USP7_ICP0_bdg144-177 aa
PF06156YabA144-179 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG002520PF00319SRF-TF11581.3e-2486.0
TkAUNG002520PF12436USP7_ICP0_bdg601050.07213.2
TkAUNG002520PF01486K-box71813e-1763.3
TkAUNG002520PF01486K-box931723e-1763.3
TkAUNG002520PF28633LIC4_C931110.3511.4
TkAUNG002520PF06156YabA971135.38.4
TkAUNG002520PF12436USP7_ICP0_bdg1441770.07213.2
TkAUNG002520PF06156YabA1441795.38.4
TkAUNG002520PF28633LIC4_C1481760.3511.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FVC1拟南芥sp|Q9FVC1|SVP_ARATH MADS-box protein SVP57.100%Swiss-Prot高置信
O82794拟南芥sp|O82794|AGL24_ARATH MADS-box protein AGL2454.300%Swiss-Prot高置信
Q9XJ66水稻sp|Q9XJ66|MAD22_ORYSJ MADS-box transcription factor 2254.000%Swiss-Prot高置信
Q69TG5水稻sp|Q69TG5|MAD55_ORYSJ MADS-box transcription factor 5546.500%Swiss-Prot中等置信

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