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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG001690
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 475120-483204 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2340 bp · TkAUNG001690|TK1151|cDNA

ATGGAGGTTTATCGCAAGCTTGTATTCCTCTCCATTACTATACTCCTTCTCTTCTCTTATTGTTCTGCTGCAGTAGATACTGTATATCCCAATCAACCTATCAAAGATGGCGACACCATTGTTTCTCATGGGGAGATTTACGAACTGGGTTTCTTTAGCCCCGAAAAATCCAAGAATCGTTACCTTGGGATATGGTACAAAAAGATATCAACTTTCACGGTCGTGTGGGTTGCTAATAGGGAAACACCAATCAAAGATAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2340 bp · TkAUNG001690|TK1151|CDS

ATGGAGGTTTATCGCAAGCTTGTATTCCTCTCCATTACTATACTCCTTCTCTTCTCTTATTGTTCTGCTGCAGTAGATACTGTATATCCCAATCAACCTATCAAAGATGGCGACACCATTGTTTCTCATGGGGAGATTTACGAACTGGGTTTCTTTAGCCCCGAAAAATCCAAGAATCGTTACCTTGGGATATGGTACAAAAAGATATCAACTTTCACGGTCGTGTGGGTTGCTAATAGGGAAACACCAATCAAAGATAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

779 aa · TkAUNG001690|TK1151|PROTEIN

MEVYRKLVFLSITILLLFSYCSAAVDTVYPNQPIKDGDTIVSHGEIYELGFFSPEKSKNRYLGIWYKKISTFTVVWVANRETPIKDTSGVFKVSKEGILQILSGDNSNTIIWSSSSTVSITTANPMAQLLDNGNLVVWDESQTKESPIWQSFDYPSNTLLPEMKMGKDFITGRERYLTSWKSSDDPSPGLYKVWVDPNGYPQVFERKGLVEHSRFGPWNGIGYRGFPVQSENPIYSEEFVVNENETYFRYKCKNSGFQRI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG001690
TK1151 IDTkAUNG001690
OH-1004 IDLXL04_012531
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)56.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.919 / OH-1004 49.279
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG001690
位置ChrUn:475120-483204 (-)
描述Similar to At4g27290: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27290 G型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g27290。 暂无已核实直接文献
At4g27300 G型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 SD1-1。 暂无已核实直接文献
At4g21380 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At1g65790 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
UniProt: P0DH86 自交不亲和性的雌性特异性决定因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012531 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G21380
ath:AT4G27290
ath:AT4G27300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.855
排名 1 · TkAUNG001690 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkAUNG001690 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkAUNG001690 · TK1151
细胞核0.037
排名 4 · TkAUNG001690 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkAUNG001690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29110UMAG_10076_N3-21 aa
PF01453B_lectin73-181 aa
PF00954S_locus_glycop214-320 aa
PF06363Picorna_P3A265-288 aa
PF08276PAN_2342-408 aa
PF06363Picorna_P3A390-407 aa
PF06363Picorna_P3A434-466 aa
PF05545FixQ443-473 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG001690PF29110UMAG_10076_N3210.2412.2
TkAUNG001690PF01453B_lectin731816.1e-36123.8
TkAUNG001690PF00954S_locus_glycop2143206.6e-2485.3
TkAUNG001690PF06363Picorna_P3A2652880.3111.7
TkAUNG001690PF08276PAN_23424084.3e-2072.3
TkAUNG001690PF06363Picorna_P3A3904070.3111.7
TkAUNG001690PF06363Picorna_P3A4344660.3111.7
TkAUNG001690PF05545FixQ4434730.07913.6
TkAUNG001690PF29110UMAG_10076_N4444670.2412.2
TkAUNG001690PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5067721.3e-47163.0
TkAUNG001690PF00069Pkinase5067691.4e-45156.5
TkAUNG001690PF03109ABC15115400.001318.7
TkAUNG001690PF12330Haspin_kinase6156540.1312.0
TkAUNG001690PF03109ABC16166550.001318.7
TkAUNG001690PF01636APH6206410.1112.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81832拟南芥sp|O81832|Y4729_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g2729050.300%Swiss-Prot高置信
O81833拟南芥sp|O81833|SD11_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-147.100%Swiss-Prot中等置信
O81905拟南芥sp|O81905|SD18_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-843.700%Swiss-Prot中等置信
Q39086拟南芥sp|Q39086|SD17_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-743.400%Swiss-Prot中等置信
P0DH86拟南芥sp|P0DH86|SRK_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SRK44.700%Swiss-Prot中等置信

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