RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G431140
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 109609381-109610404 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

834 bp · TkA08G431140|TK1151|cDNA

ATGGCTGATGATGATACAAAAGAAGCCTTACTTGCAAATCAAAACCAACCTCTTTTTTACCCACCACCAATTTCCACGGACCATTTTAACTTAAAGCAAGTGGCGATTATCTTGGCTGCTTACCTAACCCTAGGCACCTTGTGTTTTTCCCTCATCCAAGATGAAATCAGTGGCACGAAAACCAACAAAATCCTAGATTCCGTCTATTTCTGTGTCATCACAATGACGGCTGCAGGATACGGTGATGTAGGACCCGAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

834 bp · TkA08G431140|TK1151|CDS

ATGGCTGATGATGATACAAAAGAAGCCTTACTTGCAAATCAAAACCAACCTCTTTTTTACCCACCACCAATTTCCACGGACCATTTTAACTTAAAGCAAGTGGCGATTATCTTGGCTGCTTACCTAACCCTAGGCACCTTGTGTTTTTCCCTCATCCAAGATGAAATCAGTGGCACGAAAACCAACAAAATCCTAGATTCCGTCTATTTCTGTGTCATCACAATGACGGCTGCAGGATACGGTGATGTAGGACCCGAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

277 aa · TkA08G431140|TK1151|PROTEIN

MADDDTKEALLANQNQPLFYPPPISTDHFNLKQVAIILAAYLTLGTLCFSLIQDEISGTKTNKILDSVYFCVITMTAAGYGDVGPETKLAKSLACIFVFTGMALGGFALSKAADYIVGKQEILFVKAIHMHETYGQNEIIKEAESNKVKYKFFTILTLIIFLMTVGTFFLSLVEQLSYFEAFYCLFVYLVELWTDNRRQMLVHWVINRKLTIQDLEKADLDDDKAVSAAEYIVYKLREMGKVSNEDIAIVVEGFKNLDVD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G431140
TK1151 IDTkA08G431140
OH-1004 IDLXL04_034735
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)87.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G431140
位置Chr08:109609381-109610404 (+)
描述Similar to TPK1: Two-pore potassium channel 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55630 电压无关、大电导和钾选择性液泡膜离子通道。
TPK1 is a vacuolar ion channel different from the slow-vacuolar cation channel.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.065599
TPK1, a Ca(2+)-regulated Arabidopsis vacuole two-pore K(+) channel is activated by 14-3-3 proteins.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03255.x
At1g02510 电压无关、瞬间激活、钾选择性的质膜离子通道。 暂无已核实直接文献
At4g18160 双孔钾通道调节质子动力势（pmf），这是将光化学能转化为生理功能所必需的。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0752300 高选择性内向整流钾通道，专门位于大液泡的液泡膜中。
Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463
Os07g0108800 高选择性内向整流钾通道，特异性位于蛋白贮藏液泡的液泡膜上。
Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034735 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0071257 cellular response to electrical stimulus 生物过程
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0097623 potassium ion export across plasma membrane 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0031004 potassium ion-transporting ATPase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G01840
ath:AT5G55630
dosa:Os03g0752300
dosa:Os07g0108800
dosa:Os09g0299400
osa:4334137
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.357
排名 1 · TkA08G431140 · TK1151
细胞膜0.340
排名 2 · TkA08G431140 · TK1151
内质网0.157
排名 3 · TkA08G431140 · TK1151
细胞质0.138
排名 4 · TkA08G431140 · TK1151
高尔基体0.103
排名 5 · TkA08G431140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30185MRX9_TM29-50 aa
PF17332DUF559233-52 aa
PF20447DUF670433-85 aa
PF07885Ion_trans_236-116 aa
PF00520Ion_trans51-109 aa
PF09045L27_281-90 aa
PF17332DUF559287-110 aa
PF17332DUF559289-111 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G431140PF30185MRX9_TM29500.02515.4
TkA08G431140PF17332DUF559233520.07914.1
TkA08G431140PF20447DUF670433850.312.0
TkA08G431140PF07885Ion_trans_2361163.8e-1349.8
TkA08G431140PF00520Ion_trans511090.0004220.3
TkA08G431140PF09045L27_281900.2112.3
TkA08G431140PF17332DUF5592871100.07914.1
TkA08G431140PF17332DUF5592891110.07914.1
TkA08G431140PF03616Glt_symporter921900.000519.6
TkA08G431140PF30185MRX9_TM1301860.02515.4
TkA08G431140PF00520Ion_trans1351720.0004220.3
TkA08G431140PF17332DUF55921461930.07914.1
TkA08G431140PF20447DUF67041541700.312.0
TkA08G431140PF07885Ion_trans_21581883.8e-1349.8
TkA08G431140PF00520Ion_trans1771870.0004220.3
TkA08G431140PF13202EF-hand_52122230.04414.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LBL1拟南芥sp|Q8LBL1|KCO1_ARATH Two-pore potassium channel 143.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FWX6拟南芥sp|Q9FWX6|KCO4_ARATH Two-pore potassium channel 425.900%Swiss-Prot低置信
Q9SVV6拟南芥sp|Q9SVV6|KCO6_ARATH Two-pore potassium channel 325.200%Swiss-Prot低置信
Q850M0水稻sp|Q850M0|KCO1_ORYSJ Two pore potassium channel a42.900%Swiss-Prot中等置信
Q8LIN5水稻sp|Q8LIN5|KCO2_ORYSJ Two pore potassium channel b41.400%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看