基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA08G424220
当前版本: TK1151
染色体: Chr08
坐标: 107753579-107760430
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1218 bp · TkA08G424220|TK1151|cDNA
ATGCTCCTTTTACTAAGGATGGTGGGTACGGGCACCAAACGCCGTGGAAGAAGCCTCGGTGGCAGCCGACAACGCAGGAAACCTGCGTGGAACACCGCCCCCGGGAACGCGGCGTGGGAGGGCGTCGGATATTCAACGCGTGAGAACGCGGCGTGGAGCTCCTTTTCGACCGTTGAACGGCTCCTGTTGCTTGATCCGATGCAAGAAGTTGGAGGAGGCAAGCTCCATTGTTGCAAATTGATGGAGAAGAAAGTAAAAAT...
CDS
下载 CDS FASTA1218 bp · TkA08G424220|TK1151|CDS
ATGCTCCTTTTACTAAGGATGGTGGGTACGGGCACCAAACGCCGTGGAAGAAGCCTCGGTGGCAGCCGACAACGCAGGAAACCTGCGTGGAACACCGCCCCCGGGAACGCGGCGTGGGAGGGCGTCGGATATTCAACGCGTGAGAACGCGGCGTGGAGCTCCTTTTCGACCGTTGAACGGCTCCTGTTGCTTGATCCGATGCAAGAAGTTGGAGGAGGCAAGCTCCATTGTTGCAAATTGATGGAGAAGAAAGTAAAAAT...
405 aa · TkA08G424220|TK1151|PROTEIN
MLLLLRMVGTGTKRRGRSLGGSRQRRKPAWNTAPGNAAWEGVGYSTRENAAWSSFSTVERLLLLDPMQEVGGGKLHCCKLMEKKVKILEKKRKAVEDEKAFILVIRSIAKRLGLVEQRLEYCKNWRRKAVQTCEHGSCHMDTGRVTLGHGSCPMDTGRVQCPADFEYDWIPYESLLEKAYAKLHGFHETLEGGLVQDALVDLTGGAGEEIDMRSARVQIDLANRRLWSQLLQFKQGGFLLGAGNPSSSDVHISSSRIVQG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA08G424220 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA08G424220 |
| OH-1004 ID | LXL04_010033 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 98.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 75.062 / OH-1004 29.892覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA08G424220 |
|---|---|
| 位置 | Chr08:107753579-107760430 (-) |
| 描述 | Similar to DEK1: Calpain-type cysteine protease DEK1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0001558 regulation of cell growth 生物过程 GO:0001708 cell fate specification 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程 GO:0032877 positive regulation of DNA endoreduplication 生物过程 GO:0040014 regulation of multicellular organism growth 生物过程 GO:0042127 regulation of cell population proliferation 生物过程 GO:0090392 sepal giant cell differentiation 生物过程 GO:0090628 plant epidermal cell fate specification 生物过程 GO:0097264 self proteolysis 生物过程 GO:2000011 regulation of adaxial/abaxial pattern formation 生物过程 GO:2000014 regulation of endosperm development 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G55350 dosa:Os02g0709400 osa:4330484 zma:542509 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.470
细胞核0.250
线粒体0.134
内质网0.113
细胞膜0.107
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00951Arteri_Gl100-135 aaPF28388Vertnin_mid124-132 aaPF07936Defensin_4137-157 aaPF26058DUF8019144-165 aaPF23548Zn_ribbon_FGT1_2151-162 aaPF00648Peptidase_C2173-321 aaPF00951Arteri_Gl318-353 aaPF28388Vertnin_mid342-350 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA08G424220 | PF00951 | Arteri_Gl | 100 | 135 | 0.63 | 10.6 |
| TkA08G424220 | PF28388 | Vertnin_mid | 124 | 132 | 0.17 | 12.1 |
| TkA08G424220 | PF07936 | Defensin_4 | 137 | 157 | 6.3 | 7.5 |
| TkA08G424220 | PF26058 | DUF8019 | 144 | 165 | 0.093 | 13.5 |
| TkA08G424220 | PF23548 | Zn_ribbon_FGT1_2 | 151 | 162 | 0.6 | 10.5 |
| TkA08G424220 | PF00648 | Peptidase_C2 | 173 | 321 | 7.4e-30 | 104.7 |
| TkA08G424220 | PF00951 | Arteri_Gl | 318 | 353 | 0.63 | 10.6 |
| TkA08G424220 | PF28388 | Vertnin_mid | 342 | 350 | 0.17 | 12.1 |
| TkA08G424220 | PF07936 | Defensin_4 | 355 | 375 | 6.3 | 7.5 |
| TkA08G424220 | PF26058 | DUF8019 | 362 | 383 | 0.093 | 13.5 |
| TkA08G424220 | PF23548 | Zn_ribbon_FGT1_2 | 369 | 380 | 0.6 | 10.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。