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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G420050
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 106788363-106793208 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2140 bp · TkA08G420050|TK1151|cDNA

AATAAATGTTACTTAACTTTTTATACACGCTTCATCCCCTTTGTCTATGCATAACCCAAAATAAAGTTTAGAAGGCCAAAAGTCGCATAAACCTTTCCATAGCGCCTCAAAAAAGATGTTTCTTCCCCTTCATTTGCTTTGGTTATCTGTTATTATTTCCACAGCCACATCCGCTCAATTCGATACACACTACTGTGGCTTCAACAAAACCAGCTACAAAAACACGATTTACTATATGAATCTTATCCAAGTACTAGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1929 bp · TkA08G420050|TK1151|CDS

ATGTTTCTTCCCCTTCATTTGCTTTGGTTATCTGTTATTATTTCCACAGCCACATCCGCTCAATTCGATACACACTACTGTGGCTTCAACAAAACCAGCTACAAAAACACGATTTACTATATGAATCTTATCCAAGTACTAGATTCACTTGTTTCAGAATTCATCATCAATGATATCAAATTCCTGTATAAAAGTGCTGGTAACCATCCAGACATCGCATATGCTCTCTACCTTTGTCGGGAGGACGTTCTCCCCAACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

642 aa · TkA08G420050|TK1151|PROTEIN

MFLPLHLLWLSVIISTATSAQFDTHYCGFNKTSYKNTIYYMNLIQVLDSLVSEFIINDIKFLYKSAGNHPDIAYALYLCREDVLPNDCNNCLLVARDDLKNTCQSSKDAVYWKDDCMLRYANYSINSTMNSATFVSECNKRNISEETSEQSRFWDDATGFMRGLARKAANDPKKKLAYSEISYSNNEKIYGYVQCTPDLSGVDCGQCLQVSVDRLVKFCYGKQGARVLTPSCNVRFENYKFLRFLPGKKKLSTSIIAAIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G420050
TK1151 IDTkA08G420050
OH-1004 IDLXL04_034664
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 93.997
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G420050
位置Chr08:106788363-106793208 (-)
描述Similar to CRK25: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 25
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23130 参与多种不同的防御反应。 暂无已核实直接文献
At4g23280 推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶20。 暂无已核实直接文献
At4g23230 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶15。 暂无已核实直接文献
At4g23180 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。 暂无已核实直接文献
At4g23270 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶19。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034664 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G05200
ath:AT4G23130
ath:AT4G23180
ath:AT4G23230
ath:AT4G23280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.870
排名 1 · TkA08G420050 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkA08G420050 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA08G420050 · TK1151
细胞核0.042
排名 4 · TkA08G420050 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA08G420050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung27-123 aa
PF02150Zn_ribbon_RPB987-105 aa
PF01657Stress-antifung138-239 aa
PF02150Zn_ribbon_RPB9203-217 aa
PF02439Adeno_E3_CR2254-282 aa
PF08826DMPK_coil295-319 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr319-588 aa
PF00069Pkinase319-520 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G420050PF01657Stress-antifung271231.7e-30106.3
TkA08G420050PF02150Zn_ribbon_RPB9871057.17.3
TkA08G420050PF01657Stress-antifung1382391.7e-30106.3
TkA08G420050PF02150Zn_ribbon_RPB92032177.17.3
TkA08G420050PF02439Adeno_E3_CR22542820.3811.3
TkA08G420050PF08826DMPK_coil2953190.06114.2
TkA08G420050PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3195889.7e-46156.9
TkA08G420050PF00069Pkinase3195203.6e-42145.3
TkA08G420050PF03109ABC13243480.01715.0
TkA08G420050PF03109ABC13864670.01715.0
TkA08G420050PF12330Haspin_kinase4134680.04913.4
TkA08G420050PF01636APH4334660.08513.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C5S8拟南芥sp|Q9C5S8|CRK5_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 547.300%Swiss-Prot中等置信
O65479拟南芥sp|O65479|CRK20_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 2046.400%Swiss-Prot中等置信
Q8W4G6拟南芥sp|Q8W4G6|CRK15_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1547.200%Swiss-Prot中等置信
Q8GYA4拟南芥sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1046.400%Swiss-Prot中等置信
Q8GWJ7拟南芥sp|Q8GWJ7|CRK19_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1945.500%Swiss-Prot中等置信

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