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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G417410
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 106114592-106116550 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1483 bp · TkA08G417410|TK1151|cDNA

CATTATATATTTAGTACATTAACCCTTTTAAGGAATGCTCATAATCATTTTCTCCTAAATATAGAATTCTTTAGAGGACTGAAAGTTACCCAAAACCACAATCGCCAAAGACCTAGGTTTCTCGGAGTATATTCATCGGTCGGCGAAATTATGGCCCAATCGGAGCTTGAGATGACCAATTCATCGTCTGATGATGAAGAAGTGTCCACGGAAGGTTCCGGGTCCGAATCGGAATCGGAATCGGAATCAGATGTGACACC...

CDS

下载 CDS FASTA

1224 bp · TkA08G417410|TK1151|CDS

CATTATATATTTAGTACATTAACCCTTTTAAGGAATGCTCATAATCATTTTCTCCTAAATATAGAATTCTTTAGAGGACTGAAAGTTACCCAAAACCACAATCGCCAAAGACCTAGGTTTCTCGGAGTATATTCATCGGTCGGCGAAATTATGGCCCAATCGGAGCTTGAGATGACCAATTCATCGTCTGATGATGAAGAAGTGTCCACGGAAGGTTCCGGGTCCGAATCGGAATCGGAATCGGAATCAGATGTGACACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

407 aa · TkA08G417410|TK1151|PROTEIN

HYIFSTLTLLRNAHNHFLLNIEFFRGLKVTQNHNRQRPRFLGVYSSVGEIMAQSELEMTNSSSDDEEVSTEGSGSESESESESDVTPPALPSSRKTQPTAQSSSEESESDADSPPKSPEKANPTIKPLASKPMDDEPSKKPRPQNPISRNPPPPVKPANGKRKAAEVDDEGNKSKIVKKEVGAVSAPGPENAGEKKTLFQRLWSEEDEIVLIKGMINYVDTKGKDPMADVNAFHEFVKSSLNVDVNNAQMTAKVKRLKAK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G417410
TK1151 IDTkA08G417410
OH-1004 IDLXL04_034649
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.715 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G417410
位置Chr08:106114592-106116550 (-)
描述Similar to At4g00390: Probable transcription factor At4g00390
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g61730 可能的转录因子 At1g61730。 暂无已核实直接文献
At1g66420 可能的转录因子At1g66420。 暂无已核实直接文献
At4g00390 可能的转录因子 At4g00390。 暂无已核实直接文献
At4g25210 结合含有CryR2元件（5'-ACATAWCT-3'）启动子的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g01370 可能的转录因子 At2g01370。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034649 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0016592 mediator complex 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61730
ath:AT1G66420
ath:AT2G01370
ath:AT4G00390
ath:AT4G25210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.978
排名 1 · TkA08G417410 · TK1151
细胞质0.061
排名 2 · TkA08G417410 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA08G417410 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkA08G417410 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA08G417410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01611Filo_glycop55-107 aa
PF02724CDC4558-310 aa
PF16003DUF477663-127 aa
PF13352DUF410063-164 aa
PF04426Bul1_C76-94 aa
PF04504GeBP-like_DBD199-294 aa
PF04426Bul1_C232-333 aa
PF16003DUF4776258-332 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G417410PF01611Filo_glycop551071.98.0
TkA08G417410PF02724CDC45583100.2510.3
TkA08G417410PF16003DUF4776631270.001818.1
TkA08G417410PF13352DUF4100631645.47.7
TkA08G417410PF04426Bul1_C76949.56.3
TkA08G417410PF04504GeBP-like_DBD1992943e-30105.5
TkA08G417410PF04426Bul1_C2323339.56.3
TkA08G417410PF16003DUF47762583320.001818.1
TkA08G417410PF13352DUF41003003225.47.7
TkA08G417410PF01611Filo_glycop3383571.98.0
TkA08G417410PF22757GeBP-like_C3493920.0001822.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SYA9拟南芥sp|Q9SYA9|STKLD_ARATH Probable transcription factor At1g6173029.700%Swiss-Prot低置信
Q9C517拟南芥sp|Q9C517|STKLE_ARATH Probable transcription factor At1g6642035.400%Swiss-Prot低置信
O23063拟南芥sp|O23063|STKLP_ARATH Probable transcription factor At4g0039039.000%Swiss-Prot低置信
Q9SB42拟南芥sp|Q9SB42|STKLS_ARATH GLABROUS1 enhancer-binding protein-like29.000%Swiss-Prot低置信
Q9ZU30拟南芥sp|Q9ZU30|STKLF_ARATH Probable transcription factor At2g0137040.400%Swiss-Prot低置信

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