TkA08G407700 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G407700

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 103790952-103800051 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1975 bp · TkA08G407700|TK1151|cDNA

TTGCTTCTTTACATTGACCCCAAATACGATGCCAAGAACCATTAAAGGTCCACCCAAATCATCAACATTTTTACACCTTTTTTATTAACATTTCTTTGTAATCTTCTTGTTATTTTTCACGGACAAATTTGAATAAAAGTAGAAATAATCTGCGTACAATCTTGAATTTATCTCTCTCGTCCTCTGTTTTCTCTCCAACCCTGAACAGATTCTTGATGGTGAGAGAAGAAGAGAGATTGAGATAAATAGTTTCATTAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1356 bp · TkA08G407700|TK1151|CDS

ATGCTATCGGGGCCTTCAGAAGATCCTCTTCACAAAGACCAAGGACTTGATGACAATGGTATCAACACAAATCCATATACAAACAAGCGCGGCGCTCTAAGCCCAACTCCCAAGAAATTGATTTCAGATACCGATGCATTTAGGGAAACAAGGTCTACTGCAAAGCGATTCTCATCTCCGCAACTTGAAAGAGTAGAACGCGAAGAAGATTATATAGAGAAACAATTAGTTCGTAGAAAATCAATGCTTGATTTGAGGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

451 aa · TkA08G407700|TK1151|PROTEIN

MLSGPSEDPLHKDQGLDDNGINTNPYTNKRGALSPTPKKLISDTDAFRETRSTAKRFSSPQLERVEREEDYIEKQLVRRKSMLDLRSPLICNPSLKRYNSTKLYDKRIRKRATSWSKLFDCVGGRVTSADIDDSLVVNLSELFLGFRFAHGAHSQLHHGVYKEEPVAVKIIRVRNEDENEELGIRLENQFVREVALLSRLHHQNVIKFVAARRQPAVFFVVTEYLSKGSLRGYLNKFEDKSVKDKEILSFKKIIKMALDI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G407700`
TK1151 ID	TkA08G407700
OH-1004 ID	LXL04_027015
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	47.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 65.410 / OH-1004 77.273 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G407700

位置 Chr08:103790952-103800051 (-)

描述 Similar to HT1: Serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g62400`	丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶，参与响应CO(2)的气孔运动控制。	暂无已核实直接文献
`At2g24360`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可磷酸化丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基上的蛋白质。	Genome-wide analysis and experimentation of plant serine/ threonine/tyrosine-specific protein kinases.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-4109-7
`At4g38470`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。	A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200 The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
`At4g35780`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。	A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200 The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
`At2g17700`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。	A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200 The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027015 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程

GO:0010344 seed oilbody biogenesis 生物过程

GO:0045995 regulation of embryonic development 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0071244 cellular response to carbon dioxide 生物过程

GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程

GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程

GO:2000030 regulation of response to red or far red light 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G62400

ath:AT2G17700

ath:AT2G24360

ath:AT4G35780

ath:AT4G38470

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.594

排名 1 · TkA08G407700 · TK1151

细胞核0.303

排名 2 · TkA08G407700 · TK1151

细胞膜0.239

排名 3 · TkA08G407700 · TK1151

高尔基体0.045

排名 4 · TkA08G407700 · TK1151

线粒体0.041

排名 5 · TkA08G407700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr149-403 aa

PF03109ABC1151-172 aa

PF00069Pkinase162-400 aa

PF06293Kdo189-288 aa

PF14531Kinase-like257-296 aa

PF03109ABC1264-298 aa

PF03109ABC1362-412 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G407700	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	149	403	2.5e-57	194.9
TkA08G407700	`PF03109`	ABC1	151	172	0.0079	16.1
TkA08G407700	`PF00069`	Pkinase	162	400	1.6e-51	176.0
TkA08G407700	`PF06293`	Kdo	189	288	0.0031	17.7
TkA08G407700	`PF14531`	Kinase-like	257	296	0.038	14.0
TkA08G407700	`PF03109`	ABC1	264	298	0.0079	16.1
TkA08G407700	`PF03109`	ABC1	362	412	0.0079	16.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q2MHE4`	拟南芥	sp\|Q2MHE4\|HT1_ARATH Serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT1	46.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9ZQ31`	拟南芥	sp\|Q9ZQ31\|STY13_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY13	43.900%	Swiss-Prot	中等置信
`F4JTP5`	拟南芥	sp\|F4JTP5\|STY46_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY46	39.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8RWL6`	拟南芥	sp\|Q8RWL6\|STY17_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY17	35.700%	Swiss-Prot	中等置信
`O22558`	拟南芥	sp\|O22558\|STY8_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY8	36.100%	Swiss-Prot	中等置信

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