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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G374190
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 95700386-95703965 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2884 bp · TkA08G374190|TK1151|cDNA

AGACACTGACCTGCGGGTAGTCACTCGACCGTAGACAAATGAAAACCGTTTCTCATCGTCTCCCTTTCTTCCTCCTGTCGACTTACAGCTTTCGCACCGTCATCGTTCTCGGTCTCATCGCCGTTCTATTCTCGCCTATTCAGGTCTCGTTGTCGTTCTGTAGGTGATCGAAATTTCCATTCAAATTACTTTTGTTTAGCGTTATATGTCAATTCGTTTTAAATGATAAACACAATGGGAAATATTTTTGATTTCTCGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2268 bp · TkA08G374190|TK1151|CDS

ATGACAGTTCTCACAGAAAACAATTCAGCTTCATCAATTCATGGTCATATATATGACGTGTTCTTAAGTTTTAGAGGTGTCGACACTCGTCATAGTTTCACTAATCACCTTTATAAAGCCTTCCTGGATGCCAAAATCACTACCTTCTTAGATGATGAAGAGATTGAAATCGGTGAAGATCTGAAACCGGAATTGGGGATAGCAATTAAATCATCTAGGGCTTCTGTTATCGTGTTGTCTAAGAATTATGCTTCTTCCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

755 aa · TkA08G374190|TK1151|PROTEIN

MTVLTENNSASSIHGHIYDVFLSFRGVDTRHSFTNHLYKAFLDAKITTFLDDEEIEIGEDLKPELGIAIKSSRASVIVLSKNYASSTWCLDELVLILEQSKSSNHVVYPIFYHVDPTHVRKQQSSFGDAMAKHRRYMEAESDANKRSQWVQRMEGWNKALIEVADLKGNDVNGSSRKETGVIEEIVNDIYNKLRISSRTPSPQLIGMESSIKLVTSWLKEASSHTTDILTIFGIGGIGKTTLAKYVYALHCCEFHTSSYI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G374190
TK1151 IDTkA08G374190
OH-1004 IDLXL04_034164
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G374190
位置Chr08:95700386-95703965 (+)
描述Similar to RUN1: Disease resistance protein RUN1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12010 参与植物防御的 TIR-NB-LRR 受体样蛋白。
Matching NLR Immune Receptors to Autoimmunity in camta3 Mutants Using Antimorphic NLR Alleles.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.03.005

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034164 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G12010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.406
排名 1 · TkA08G374190 · TK1151
细胞膜0.399
排名 2 · TkA08G374190 · TK1151
细胞核0.221
排名 3 · TkA08G374190 · TK1151
内质网0.084
排名 4 · TkA08G374190 · TK1151
细胞外0.045
排名 5 · TkA08G374190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01582TIR18-197 aa
PF13676TIR_220-116 aa
PF12076CER1-like_C68-122 aa
PF13173AAA_14150-175 aa
PF13191AAA_16204-320 aa
PF00931NB-ARC209-387 aa
PF24883NPHP3_N214-248 aa
PF01637ATPase_2220-326 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G374190PF01582TIR181975.2e-44150.9
TkA08G374190PF13676TIR_2201168.9e-1556.0
TkA08G374190PF12076CER1-like_C681220.1612.5
TkA08G374190PF13173AAA_141501750.04914.3
TkA08G374190PF13191AAA_162043200.001120.2
TkA08G374190PF00931NB-ARC2093873.3e-1350.3
TkA08G374190PF24883NPHP3_N2142480.007117.3
TkA08G374190PF01637ATPase_22203260.0001622.2
TkA08G374190PF13401AAA_222253220.02615.6
TkA08G374190PF20720nSTAND32252530.08613.2
TkA08G374190PF13173AAA_142273290.04914.3
TkA08G374190PF05729NACHT2303810.1412.7
TkA08G374190PF25013LRR_Zer-12893020.006717.3
TkA08G374190PF12076CER1-like_C3053420.1612.5
TkA08G374190PF23282WHD_ROQ14575281e-1971.1
TkA08G374190PF25019LRR_R13L1-DRL216086390.212.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZ66拟南芥sp|Q9SZ66|DSC1_ARATH Disease resistance-like protein DSC131.500%Swiss-Prot中等置信

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