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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G351800
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 90198817-90199482 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

666 bp · TkA08G351800|TK1151|cDNA

ATGCATCCTTGTGTCTTCATAGTTTTCTCACTTCTCTTGCTCTGTATTGAGGCTACAACTACTGGCAACCAATTGGTAGCAATGAGAGGAGGAAATAATACTAATGCTGTTATGAACAAGTGTCTGGATAAAGAGAGACATGCTCTCCTTCATTTTAAAACTCATTTTCAAGACCTCGATGATTGTCTCTCTACATGGACAACTAAAGAAGATGAGTGTTGTAAATGGTTTGGAGTCGCGTGTGACAATCAAACAGGTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

666 bp · TkA08G351800|TK1151|CDS

ATGCATCCTTGTGTCTTCATAGTTTTCTCACTTCTCTTGCTCTGTATTGAGGCTACAACTACTGGCAACCAATTGGTAGCAATGAGAGGAGGAAATAATACTAATGCTGTTATGAACAAGTGTCTGGATAAAGAGAGACATGCTCTCCTTCATTTTAAAACTCATTTTCAAGACCTCGATGATTGTCTCTCTACATGGACAACTAAAGAAGATGAGTGTTGTAAATGGTTTGGAGTCGCGTGTGACAATCAAACAGGTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

221 aa · TkA08G351800|TK1151|PROTEIN

MHPCVFIVFSLLLLCIEATTTGNQLVAMRGGNNTNAVMNKCLDKERHALLHFKTHFQDLDDCLSTWTTKEDECCKWFGVACDNQTGHVTRLEISMCAILGEISDSLLNLSYLTHLDLSFNYFHGMFPRFVGSLTKLRFLNLAGNSLYGTIPAEFGNLTNLETLVLRDVGWCRVDNLKWSHLPQLEELVMDGISLATVNNWVDVVLSIRKLSFLSLTGCDLS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G351800
TK1151 IDTkA08G351800
OH-1004 IDLXL04_004356
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)69.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.783 / OH-1004 22.084
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G351800
位置Chr08:90198817-90199482 (-)
描述Similar to EIX2: Receptor-like protein EIX2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06940 可能失活的富含亮氨酸重复结构受体样蛋白激酶 At5g06940。 暂无已核实直接文献
At3g05650 受体样蛋白32。 暂无已核实直接文献
At2g24130 推定的富含亮氨酸重复的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24130。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004356 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71400
ath:AT4G04220
ath:AT5G46330
sly:543900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.759
排名 1 · TkA08G351800 · TK1151
内质网0.122
排名 2 · TkA08G351800 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA08G351800 · TK1151
细胞外0.061
排名 4 · TkA08G351800 · TK1151
细胞核0.051
排名 5 · TkA08G351800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_243-82 aa
PF23211LRR_LRWD184-122 aa
PF25013LRR_Zer-187-136 aa
PF13516LRR_687-98 aa
PF13855LRR_888-146 aa
PF00560LRR_188-109 aa
PF12799LRR_490-120 aa
PF23598LRR_14105-167 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G351800PF08263LRRNT_243826.5e-1039.8
TkA08G351800PF23211LRR_LRWD1841228.4e-0523.1
TkA08G351800PF25013LRR_Zer-1871360.000123.2
TkA08G351800PF13516LRR_687980.009516.6
TkA08G351800PF13855LRR_8881461e-1145.1
TkA08G351800PF00560LRR_1881091.4e-0936.9
TkA08G351800PF12799LRR_4901202.1e-0628.5
TkA08G351800PF23598LRR_141051671.7e-0834.3
TkA08G351800PF13516LRR_61101200.009516.6
TkA08G351800PF13855LRR_81111661e-1145.1
TkA08G351800PF00560LRR_11121331.4e-0936.9
TkA08G351800PF23211LRR_LRWD11242108.4e-0523.1
TkA08G351800PF13516LRR_61331440.009516.6
TkA08G351800PF12799LRR_41341652.1e-0628.5
TkA08G351800PF00560LRR_11351571.4e-0936.9
TkA08G351800PF14580LRR_91532150.1712.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FL51拟南芥sp|Q9FL51|Y5694_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g0694040.200%Swiss-Prot低置信
Q9M9X0拟南芥sp|Q9M9X0|RLP32_ARATH Receptor-like protein 3233.300%Swiss-Prot低置信
Q9ZUI0拟南芥sp|Q9ZUI0|Y2241_ARATH Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g2413039.500%Swiss-Prot低置信

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