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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G345160
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 88481886-88485528 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1584 bp · TkA08G345160|TK1151|cDNA

GTAAAATGTCACAAAGTTTCGCCTCCATATTCCGTATGTGCAGGCCGAAGCACAAACAAATTGAAATCCCCAAAGAAAATTTGTTAAATTGGTCAAAACACACGCACTCTCTCTCGAATCTTCTTCGATTACTTCAAAGTAAGCAAGTACAGACAAAGCCTGGAAGTTGTAATTCAAAACAAGTTCGAAATCGAGGTTTGTTTCGCTGATTGAAGCAACTTAACCAATAAAAAGAAGTCTTTGACGCGATCTTAGAAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1098 bp · TkA08G345160|TK1151|CDS

ATGGAGGAAGTGCAACAACAGCCGGATCAATCAATTGATGGTGAACCAGAGATTGTGACAGAAGGGTCGTCATTTGTGCATGGAGGAGCTTCTCAAGAAGATAAAGGTCCTCCCAAATTGGATACCAAAGTGGAAGTCCTTCATGAAAAGGTTTCAAAGCAAATTATTAAGGAAGGTCATGGTGACAAGCCTTCAAAATATTCCACTTGCTTTTTGCACTACAAAGCATGGACTGAAAGTACCAAACATAAGTTTGAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

365 aa · TkA08G345160|TK1151|PROTEIN

MEEVQQQPDQSIDGEPEIVTEGSSFVHGGASQEDKGPPKLDTKVEVLHEKVSKQIIKEGHGDKPSKYSTCFLHYKAWTESTKHKFEDTWQELQLVELVLGKEKKEMSGLAIGLTSMKSGERALLHVGYELGYGEEGNFSFPNVPPKANIIYEVELVGFDETKEGKARSDMTVEERISAADRRRMDGNSLFKEEKLELAMQQYEMAIAYMGDDFMFQLFGKYQDMALAVKNPCHLNIAACLIKLKRYEEAIAQCAIVLAED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G345160
TK1151 IDTkA08G345160
OH-1004 IDLXL04_034050
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G345160
位置Chr08:88481886-88485528 (-)
描述Similar to FKBP42: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP42
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g21640 PPI酶加速蛋白质折叠（通过相似性）。
TWISTED DWARF1, a unique plasma membrane-anchored immunophilin-like protein, interacts with Arabidopsis multidrug resistance-like transporters AtPGP1 and AtPGP19.2003 · DOI: 10.1091/mbc.e02-10-0698
The ULTRACURVATA2 gene of Arabidopsis encodes an FK506-binding protein involved in auxin and brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.032524
Arabidopsis immunophilin-like TWD1 functionally interacts with vacuolar ABC transporters.2004 · DOI: 10.1091/mbc.e03-11-0831
Immunophilin-like TWISTED DWARF1 modulates auxin efflux activities of Arabidopsis P-glycoproteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m604604200
The ER-localized TWD1 immunophilin is necessary for localization of multidrug resistance-like proteins required for polar auxin transport in Arabidopsis roots.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.078360
Arabidopsis TWISTED DWARF1 regulates stamen elongation by differential activation of ABCB1,19-mediated auxin transport.2022 · DOI: 10.1093/jxb/erac185
Loss of Multiple ABCB Auxin Transporters Recapitulates the Major twisted dwarf 1 Phenotypes in Arabidopsis thaliana .2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.840260

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034050 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010928 regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0048229 gametophyte development 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0048439 flower morphogenesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G21640
ath:AT3G25230
ath:AT5G48570
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.598
排名 1 · TkA08G345160 · TK1151
细胞核0.375
排名 2 · TkA08G345160 · TK1151
线粒体0.138
排名 3 · TkA08G345160 · TK1151
细胞膜0.119
排名 4 · TkA08G345160 · TK1151
内质网0.092
排名 5 · TkA08G345160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00254FKBP_C63-156 aa
PF07719TPR_2186-209 aa
PF00515TPR_1186-207 aa
PF13414TPR_11186-208 aa
PF13432TPR_16186-208 aa
PF13428TPR_14189-207 aa
PF14559TPR_19192-209 aa
PF13174TPR_6194-206 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G345160PF00254FKBP_C631563e-1660.2
TkA08G345160PF07719TPR_21862096.1e-1039.1
TkA08G345160PF00515TPR_11862071.4e-0938.1
TkA08G345160PF13414TPR_111862082.7e-0524.5
TkA08G345160PF13432TPR_161862080.01716.3
TkA08G345160PF13428TPR_141892070.001519.7
TkA08G345160PF14559TPR_191922090.000222.4
TkA08G345160PF13174TPR_61942069.7e-0523.5
TkA08G345160PF16528Exo84_C1952930.2112.1
TkA08G345160PF13424TPR_121962080.005817.5
TkA08G345160PF12895ANAPC31972080.03915.0
TkA08G345160PF13181TPR_81982083.2e-0730.7
TkA08G345160PF12895ANAPC32312510.03915.0
TkA08G345160PF07719TPR_22322636.1e-1039.1
TkA08G345160PF00515TPR_12322621.4e-0938.1
TkA08G345160PF12968DUF38562322980.08513.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDC0拟南芥sp|Q9LDC0|FKB42_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4270.700%Swiss-Prot高置信

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