基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA08G287210
当前版本: TK1151
染色体: Chr08
坐标: 74554762-74555794
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA468 bp · TkA08G287210|TK1151|cDNA
CAAGCAGCGGAGGAGTACGACGTGGTTGCCGAATTTGGTCAGGAACTTGAAGAAGACGATGAAGACGAGCAAAGAATTGAGAGGATTCGTAATGACGTGAGGGAGTATGGTGATGGCATCCTTGATGTTGATGTACTTGCTTCCGTTTACAACTTCCGAATTGACAAATTTCAGCGTTTAGCAATTCAAGCTTTCCTCAGAGGTTCTTCCGTTGTAGTTTCTGCACCCACAAGTGCAGGCAAAACATTAATTGCCGAAGC...
CDS
下载 CDS FASTA468 bp · TkA08G287210|TK1151|CDS
CAAGCAGCGGAGGAGTACGACGTGGTTGCCGAATTTGGTCAGGAACTTGAAGAAGACGATGAAGACGAGCAAAGAATTGAGAGGATTCGTAATGACGTGAGGGAGTATGGTGATGGCATCCTTGATGTTGATGTACTTGCTTCCGTTTACAACTTCCGAATTGACAAATTTCAGCGTTTAGCAATTCAAGCTTTCCTCAGAGGTTCTTCCGTTGTAGTTTCTGCACCCACAAGTGCAGGCAAAACATTAATTGCCGAAGC...
155 aa · TkA08G287210|TK1151|PROTEIN
QAAEEYDVVAEFGQELEEDDEDEQRIERIRNDVREYGDGILDVDVLASVYNFRIDKFQRLAIQAFLRGSSVVVSAPTSAGKTLIAEAAAVAAVARGRRLFYTTPLKALSNQKFREFCLEQLHLNKNNIEHIWYPTTNDENSYKPFQNLRCLLIGN
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA08G287210 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA08G287210 |
| OH-1004 ID | LXL04_023101 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 80.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 75.484 / OH-1004 31.818覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA08G287210 |
|---|---|
| 位置 | Chr08:74554762-74555794 (-) |
| 描述 | Similar to ISE2: DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000373 Group II intron splicing 生物过程 GO:0000712 resolution of meiotic recombination intermediates 生物过程 GO:0006397 mRNA processing 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0010497 plasmodesmata-mediated intercellular transport 生物过程 GO:0016441 post-transcriptional gene silencing 生物过程 GO:0016554 cytidine to uridine editing 生物过程 GO:0031047 regulatory ncRNA-mediated gene silencing 生物过程 GO:0070478 nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay 生物过程 GO:1901259 chloroplast rRNA processing 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G70070 mle:ML1333 msm:MSMEG_3885 mtc:MT2153 mtu:Rv2092c mtv:RVBD_2092c 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.659
细胞质0.447
线粒体0.055
细胞膜0.031
内质网0.030
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF25199nSTAND_NTPase57-26 aaPF13401AAA_228-41 aaPF18592Tho1_MOS11_C12-29 aaPF13604AAA_3055-110 aaPF00270DEAD56-116 aaPF04851ResIII56-139 aaPF01695IstB_IS2157-105 aaPF02562PhoH58-97 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA08G287210 | PF25199 | nSTAND_NTPase5 | 7 | 26 | 0.027 | 15.0 |
| TkA08G287210 | PF13401 | AAA_22 | 8 | 41 | 0.077 | 14.0 |
| TkA08G287210 | PF18592 | Tho1_MOS11_C | 12 | 29 | 0.2 | 12.4 |
| TkA08G287210 | PF13604 | AAA_30 | 55 | 110 | 0.096 | 13.2 |
| TkA08G287210 | PF00270 | DEAD | 56 | 116 | 4.9e-12 | 46.6 |
| TkA08G287210 | PF04851 | ResIII | 56 | 139 | 0.1 | 13.2 |
| TkA08G287210 | PF01695 | IstB_IS21 | 57 | 105 | 0.00026 | 21.3 |
| TkA08G287210 | PF02562 | PhoH | 58 | 97 | 0.031 | 14.5 |
| TkA08G287210 | PF13481 | AAA_25 | 60 | 103 | 0.027 | 14.8 |
| TkA08G287210 | PF20720 | nSTAND3 | 60 | 104 | 0.045 | 14.2 |
| TkA08G287210 | PF25199 | nSTAND_NTPase5 | 65 | 117 | 0.027 | 15.0 |
| TkA08G287210 | PF13401 | AAA_22 | 69 | 127 | 0.077 | 14.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
B9DFG3 | 拟南芥 | sp|B9DFG3|ISE2_ARATH DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic | 77.400% | Swiss-Prot | 中等置信 |