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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G279000
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 72523791-72531544 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2554 bp · TkA08G279000|TK1151|cDNA

CACATGTGCTCCGTTTACAAAGGTAACGCTAATAATCGTAAAGTTGCACAGCTCCACGGCGTTCTACGCCCGTACCGAATAGCCTAACAGTGGTGGTAATCCTCTCCACGCTACTACTCTACAGTTGCACAGCTCCTCAGAAGCCCTATATCAAGCAACTGCCAAAGCGAAGTTTAGAACTGCTATCGATTTGGCGTTTCTTTTGCGGTTTTGTCGATCTAATAATCGTTCAGAAATCATGGCCGAGTTGATCCCAATAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2082 bp · TkA08G279000|TK1151|CDS

ATGGCCGAGTTGATCCCAATAGAAGACAAAGCGGCTCGTTTAAACATAGATTTGGCATCAGTTGATTGGAACTCTGTTAATCTCCCTGCCGGTGAAGACTTTGGTATCAAAAGTGATGATGATGATCTTAACGAGGAAGATCCTTTGGAATTCGATCCTGGATTTGCAAATATCATTGTTGTTGATAACCTGCCAGTTGTCCCTCGTGAGAAATTTGAAAAGCTCGAAGGTGTAGTTCGTAAAATCTACAGCCAAATTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

693 aa · TkA08G279000|TK1151|PROTEIN

MAELIPIEDKAARLNIDLASVDWNSVNLPAGEDFGIKSDDDDLNEEDPLEFDPGFANIIVVDNLPVVPREKFEKLEGVVRKIYSQIGVIKENGLWMPVEEDTGKTLGYCFIEYNTPQEAELAKEKTNGYKLDRAHIFAVSMFDEIDKFMKVPDEWAPPEIKPYTPGENLQQWLTDEKGRDQFVIRAGSDTEVLWNDARQVKADPVYKRPKVLCSGPHWGPTVHRQGAAVWGGASTFNRLMRYAHPQVKLIDFSPGEKYLV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G279000
TK1151 IDTkA08G279000
OH-1004 IDLXL04_011474
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)21.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 57.864 / OH-1004 77.237
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G279000
位置Chr08:72523791-72531544 (-)
描述Similar to eif2a: Eukaryotic translation initiation factor 2A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27640 真核翻译起始因子 3 (eIF-3) 复合体的 RNA 结合组分，参与一类特殊 mRNA 的蛋白质合成，并且与其他起始因子一起促进 mRNA 和甲硫氨酰-tRNAi 与40S核糖体的结合。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011474 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002183 cytoplasmic translational initiation 生物过程
GO:0006412 translation 生物过程
GO:0006413 translational initiation 生物过程
GO:0006417 regulation of translation 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009967 positive regulation of signal transduction 生物过程
GO:0032933 SREBP signaling pathway 生物过程
GO:0042255 ribosome assembly 生物过程
GO:1990928 response to amino acid starvation 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005850 eukaryotic translation initiation factor 2 complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ddi:DDB_G0284267
dre:573991
gga:425042
mmu:229317
spo:2540999
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.664
排名 1 · TkA08G279000 · TK1151
细胞核0.181
排名 2 · TkA08G279000 · TK1151
高尔基体0.160
排名 3 · TkA08G279000 · TK1151
细胞膜0.125
排名 4 · TkA08G279000 · TK1151
内质网0.099
排名 5 · TkA08G279000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05970PIF157-86 aa
PF00076RRM_179-133 aa
PF08662eIF2A234-265 aa
PF24814WD40_Prp19235-264 aa
PF23381Beta-prop_IFT122_1st236-265 aa
PF00400WD40243-262 aa
PF25174Beta-prop_THOC3245-293 aa
PF24817WD40_WDHD1_1st246-263 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G279000PF05970PIF157860.3211.3
TkA08G279000PF00076RRM_1791333.4e-0730.8
TkA08G279000PF08662eIF2A2342651.6e-63214.9
TkA08G279000PF24814WD40_Prp192352640.01714.9
TkA08G279000PF23381Beta-prop_IFT122_1st2362655.4e-0833.2
TkA08G279000PF00400WD402432620.009817.1
TkA08G279000PF25174Beta-prop_THOC32452937.8e-1038.9
TkA08G279000PF24817WD40_WDHD1_1st2462630.0009419.2
TkA08G279000PF26550Tricorn_2nd2502894.6e-0523.0
TkA08G279000PF24814WD40_Prp192772980.01714.9
TkA08G279000PF12894ANAPC4_WD402782983e-0731.3
TkA08G279000PF25174Beta-prop_THOC33073687.8e-1038.9
TkA08G279000PF25460Beta-prop_Aladin3203640.001418.5
TkA08G279000PF24817WD40_WDHD1_1st3243640.0009419.2
TkA08G279000PF24814WD40_Prp193243640.01714.9
TkA08G279000PF23389Beta-prop_WDR19_1st3253680.004616.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C5Z1拟南芥sp|Q9C5Z1|EIF3B_ARATH Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B68.700%Swiss-Prot高置信

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