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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G254640
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 66433983-66437474 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

780 bp · TkA08G254640|TK1151|cDNA

ATGAAAGGATTAAGACTCGCATCTGAGGATAAAGAAAACCGTCCCTCCGATGCAAAGGAGATTGATCTCCAATTTTCACGGGAAGACCTCGAGACCATCAAAGTCATTGGAAAAGGAAGCGGAAGTATCGTTCAACTTGTTCGCCATAAATGGATCGGAAGACTGTTCGCTTTGAAGGTAATCCAGATGAACATACAAGAAGACATCCGCAAACAAATCGTTCAAGAACTTAAAATCAACCAAGCATCTCAATGCCCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

780 bp · TkA08G254640|TK1151|CDS

ATGAAAGGATTAAGACTCGCATCTGAGGATAAAGAAAACCGTCCCTCCGATGCAAAGGAGATTGATCTCCAATTTTCACGGGAAGACCTCGAGACCATCAAAGTCATTGGAAAAGGAAGCGGAAGTATCGTTCAACTTGTTCGCCATAAATGGATCGGAAGACTGTTCGCTTTGAAGGTAATCCAGATGAACATACAAGAAGACATCCGCAAACAAATCGTTCAAGAACTTAAAATCAACCAAGCATCTCAATGCCCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

259 aa · TkA08G254640|TK1151|PROTEIN

MKGLRLASEDKENRPSDAKEIDLQFSREDLETIKVIGKGSGSIVQLVRHKWIGRLFALKVIQMNIQEDIRKQIVQELKINQASQCPNIVVYYQSFYHNGAISLVFEYMDRGSLTDVIRQLKTILERYFAVLCKQVLQGLVYLHHERHVIHRDIKPSNLLANQKGQVKITDFGVSAMLSNSMRVSSLLEWLHNHTYELLSADMDQQSDIGNETPFLCLKTSQQHQQVYPNQNKNLKFQTPCLHQGGACEAPISFLIVGDF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G254640
TK1151 IDTkA08G254640
OH-1004 IDLXL04_002480
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 69.884 / OH-1004 37.552
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G254640
位置Chr08:66433983-66437474 (+)
描述Similar to MKK6: Mitogen-activated protein kinase kinase 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g56580 ANPs-MKK6-MPK4 模块参与减数分裂和有丝分裂过程中植物胞质分裂的调节。
NQK1/NtMEK1 is a MAPKK that acts in the NPK1 MAPKKK-mediated MAPK cascade and is required for plant cytokinesis.2003 · DOI: 10.1101/gad.1071103
The Arabidopsis thaliana MEK AtMKK6 activates the MAP kinase AtMPK13.2004 · DOI: 10.1016/j.febslet.2004.08.051
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
The MAP kinase MPK4 is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.077164
AtMPK4 is required for male-specific meiotic cytokinesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04642.x
AtMKK6 and AtMPK13 are required for lateral root formation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.4161/psb.6.10.17089
At4g29810 MEKK1、MKK1/MKK2 和 MPK4 在信号通路中发挥作用，调节响应生物和非生物胁迫的基因表达，并通过负向调节先天免疫在病原体防御中发挥重要作用。
The MKK2 pathway mediates cold and salt stress signaling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1016/j.molcel.2004.06.023
The MAP kinase kinase MKK2 affects disease resistance in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1094/mpmi-20-5-0589
Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinases MKK1 and MKK2 have overlapping functions in defense signaling mediated by MEKK1, MPK4, and MKS1.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.120006

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0510100 丝裂原活化蛋白激酶激酶1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002480 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007112 male meiosis cytokinesis 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004708 MAP kinase kinase activity 分子功能
GO:0004713 protein tyrosine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G56580
dosa:Os01g0510100
nta:107818847
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.581
排名 1 · TkA08G254640 · TK1151
细胞核0.450
排名 2 · TkA08G254640 · TK1151
线粒体0.079
排名 3 · TkA08G254640 · TK1151
细胞膜0.069
排名 4 · TkA08G254640 · TK1151
内质网0.055
排名 5 · TkA08G254640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like30-71 aa
PF00069Pkinase31-185 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr33-179 aa
PF20717DUF682964-154 aa
PF01636APH79-132 aa
PF03109ABC1103-185 aa
PF14531Kinase-like130-172 aa
PF01636APH131-166 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G254640PF14531Kinase-like30710.007416.3
TkA08G254640PF00069Pkinase311855.7e-41141.4
TkA08G254640PF07714PK_Tyr_Ser-Thr331793.5e-2279.7
TkA08G254640PF20717DUF6829641540.08412.3
TkA08G254640PF01636APH791320.007216.8
TkA08G254640PF03109ABC11031855.5e-0626.4
TkA08G254640PF14531Kinase-like1301720.007416.3
TkA08G254640PF01636APH1311660.007216.8
TkA08G254640PF07387Seadorna_VP71361720.007116.1
TkA08G254640PF20717DUF68291872110.08412.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJV0拟南芥sp|Q9FJV0|M2K6_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase 676.400%Swiss-Prot中等置信
Q9S7U9拟南芥sp|Q9S7U9|M2K2_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase 257.100%Swiss-Prot高置信
Q5QN75水稻sp|Q5QN75|M2K1_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase kinase 163.700%Swiss-Prot高置信

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