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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G247430
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 64656617-64661342 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1969 bp · TkA08G247430|TK1151|cDNA

TTTCTAGTGGTCATTGCACACGGTCCCACTGCATCAAAGCAGCGAACCTTCTCCATCTCTGCGGTTTATAATTATATACATGTAAGCAAAAACATGTTTTGAATTCTCCATCTCAAATTAACCACGATTGCTCATCTGTCGTGGCAAATTGATATTCAAACCCTTAAATTCGGAAGGGGATTGACTTTAATTTCTCCAAGAGCAAGTAAAACCCCTACTGGAGATCAAGTTTAGTACGTTGTTCAGCTGAAGCAAGTATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1491 bp · TkA08G247430|TK1151|CDS

ATGTCGAGGAAGATGCTAATTGACGGGGATTTGGATGATACTACTGGAGATATTGATTACGATTTTGATTTGTTCGTGATTGGTGCTGGCAGTGGCGGTGTTAGGGCATCCAGATTTTCAGCTCAGTATGGAGCTAAGGTTGGGATATGCGAGCTGCCATTTCACCCAATCAGCACAGAAGTTGTAGGAGGTGTTGGAGGAACGTGTGTGATTCGTGGATGTGTTCCTAAAAAGATCTTGGTCTATGGAGCAACATTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

496 aa · TkA08G247430|TK1151|PROTEIN

MSRKMLIDGDLDDTTGDIDYDFDLFVIGAGSGGVRASRFSAQYGAKVGICELPFHPISTEVVGGVGGTCVIRGCVPKKILVYGATFGPEIQDSKEYGWKVNDNIDFDWKKLLHKKTEEIVRLNGIYKRLLSNAGVKLFEGEGRIVGPNEVEVIQLDGTKLSYSAKHILIATGSRAQRANIPGSELAITSDEALSLEELPKRVVILGGGYIAVEFASIWRGMGSTVNLCFRKELPLRGFDDEMRALVARNLEGRGIILHPQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G247430
TK1151 IDTkA08G247430
OH-1004 IDLXL04_036917
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.153 / OH-1004 80.736
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G247430
位置Chr08:64656617-64661342 (-)
描述Similar to GOR: Glutathione reductase, chloroplastic (Fragment)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g24170 催化谷胱甘肽二硫化物（GSSG）还原为还原型谷胱甘肽（GSH）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0813500 催化谷胱甘肽二硫化物（GSSG）还原为还原型谷胱甘肽（GSH）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036917 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程
GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程
GO:0045454 cell redox homeostasis 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004362 glutathione-disulfide reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0004791 thioredoxin-disulfide reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0005507 copper ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54660
gmx:547793
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.593
排名 1 · TkA08G247430 · TK1151
细胞核0.242
排名 2 · TkA08G247430 · TK1151
线粒体0.214
排名 3 · TkA08G247430 · TK1151
过氧化物酶体0.113
排名 4 · TkA08G247430 · TK1151
细胞膜0.056
排名 5 · TkA08G247430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07992Pyr_redox_222-350 aa
PF03486HI0933_like23-65 aa
PF01134GIDA23-181 aa
PF01266DAO23-51 aa
PF00070Pyr_redox24-51 aa
PF01262AlaDh_PNT_C24-51 aa
PF13738Pyr_redox_326-45 aa
PF01266DAO128-178 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G247430PF07992Pyr_redox_2223501.2e-68232.5
TkA08G247430PF03486HI0933_like23650.000520.4
TkA08G247430PF01134GIDA231810.002517.6
TkA08G247430PF01266DAO23512.18.5
TkA08G247430PF00070Pyr_redox24516.7e-2072.1
TkA08G247430PF01262AlaDh_PNT_C24510.0007119.8
TkA08G247430PF13738Pyr_redox_326454e-1246.7
TkA08G247430PF01266DAO1281782.18.5
TkA08G247430PF13738Pyr_redox_31533344e-1246.7
TkA08G247430PF01262AlaDh_PNT_C1992420.0007119.8
TkA08G247430PF00070Pyr_redox2012786.7e-2072.1
TkA08G247430PF03486HI0933_like2462960.000520.4
TkA08G247430PF01266DAO2462942.18.5
TkA08G247430PF01134GIDA2602950.002517.6
TkA08G247430PF02852Pyr_redox_dim3704794.7e-31108.0
TkA08G247430PF07992Pyr_redox_24324521.2e-68232.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P48641拟南芥sp|P48641|GSHRC_ARATH Glutathione reductase, cytosolic78.800%Swiss-Prot高置信
P48642水稻sp|P48642|GSHRC_ORYSJ Glutathione reductase, cytosolic72.000%Swiss-Prot高置信

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