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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G232910
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 60660469-60664716 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1215 bp · TkA08G232910|TK1151|cDNA

ATGGCTCTATTCCTATTCCGTCTCGTCTTTCTATCTATTTTCCTGCATTTCATAGGTGCAAAACAGAGTGACGGTTCTGTATCTATTGGTGCATCACTCACCGCCGCACCCGACATCAATCCATGGGTTTCATCTTCCGGTGAATTTGCCTTTGGATTCAAACAAGTTGAAGGGAGCAATAACTTCTTGTTATCCATATGGTATGAGAAGATACCCGACAAGACCGTCATCTGGTATCCAGTAGAAGGTCGGATGGTGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1215 bp · TkA08G232910|TK1151|CDS

ATGGCTCTATTCCTATTCCGTCTCGTCTTTCTATCTATTTTCCTGCATTTCATAGGTGCAAAACAGAGTGACGGTTCTGTATCTATTGGTGCATCACTCACCGCCGCACCCGACATCAATCCATGGGTTTCATCTTCCGGTGAATTTGCCTTTGGATTCAAACAAGTTGAAGGGAGCAATAACTTCTTGTTATCCATATGGTATGAGAAGATACCCGACAAGACCGTCATCTGGTATCCAGTAGAAGGTCGGATGGTGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

404 aa · TkA08G232910|TK1151|PROTEIN

MALFLFRLVFLSIFLHFIGAKQSDGSVSIGASLTAAPDINPWVSSSGEFAFGFKQVEGSNNFLLSIWYEKIPDKTVIWYPVEGRMVPIGSRVKLLRGSGLVLTNPQGTHVWRSGSISGVASGSMNDTGNFVIFGSNSCKIWGSFDYPAHTLLPTQVMEMGGSINSTKSNTNLSGGRFQLRMLTNGNLILNTRNVLSGTPYVSYYRSDTLDDSNSTNFGEQMIFGVMGYMYILRRNGERFDLTVRGSLPSGDYYHRATLDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G232910
TK1151 IDTkA08G232910
OH-1004 IDLXL04_033119
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)72.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 50.879
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G232910
位置Chr08:60660469-60664716 (+)
描述Similar to LECRK3: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q25AG3 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
Os04g0202500 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XQD3 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
Os04g0202300 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q25AG2 似乎不参与对食草昆虫褐飞虱（N.lugens，BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033119 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G60900
dosa:Os04g0202350
dosa:Os04g0202500
osa:9266608
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.431
排名 1 · TkA08G232910 · TK1151
细胞膜0.313
排名 2 · TkA08G232910 · TK1151
内质网0.113
排名 3 · TkA08G232910 · TK1151
细胞质0.068
排名 4 · TkA08G232910 · TK1151
溶酶体／液泡0.042
排名 5 · TkA08G232910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin75-159 aa
PF01453B_lectin165-193 aa
PF00954S_locus_glycop251-324 aa
PF12662cEGF316-327 aa
PF00954S_locus_glycop368-382 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G232910PF01453B_lectin751591.2e-0939.2
TkA08G232910PF01453B_lectin1651931.2e-0939.2
TkA08G232910PF00954S_locus_glycop2513241.2e-0526.5
TkA08G232910PF12662cEGF3163270.05714.0
TkA08G232910PF00954S_locus_glycop3683821.2e-0526.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q25AG3水稻sp|Q25AG3|LERK3_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK338.300%Swiss-Prot中等置信
Q0JEU6水稻sp|Q0JEU6|LERK3_ORYSJ G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK338.300%Swiss-Prot中等置信
A2XQD3水稻sp|A2XQD3|LERK2_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK237.200%Swiss-Prot中等置信
Q7FAZ2水稻sp|Q7FAZ2|LERK2_ORYSJ G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK237.700%Swiss-Prot中等置信
Q25AG2水稻sp|Q25AG2|LERK4_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK439.500%Swiss-Prot中等置信

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