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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G215390
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 56344128-56353298 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2235 bp · TkA08G215390|TK1151|cDNA

ATGAAATCAACCAGAGTTTTTGGTCTTTTTTTGCTTCTTACACTTGCGTTAGGCCATGGAGCTAATGACAGAAAGCATTACATAGTCTACATGGGACACCACTCTAATCCAAGCTTAGAGTCAGTCGTCACAGCAAATCACGAATTGCTCACATCGCTTCTTGAAAGTCATAATGGAGCAAAAGAAACAGTGATCCATCATTACACTAAAAGTTTCAGAGGTTTTTCGGCTATGCTTACACCGAATCAGGCAACGAGACT...

CDS

下载 CDS FASTA

2235 bp · TkA08G215390|TK1151|CDS

ATGAAATCAACCAGAGTTTTTGGTCTTTTTTTGCTTCTTACACTTGCGTTAGGCCATGGAGCTAATGACAGAAAGCATTACATAGTCTACATGGGACACCACTCTAATCCAAGCTTAGAGTCAGTCGTCACAGCAAATCACGAATTGCTCACATCGCTTCTTGAAAGTCATAATGGAGCAAAAGAAACAGTGATCCATCATTACACTAAAAGTTTCAGAGGTTTTTCGGCTATGCTTACACCGAATCAGGCAACGAGACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

744 aa · TkA08G215390|TK1151|PROTEIN

MKSTRVFGLFLLLTLALGHGANDRKHYIVYMGHHSNPSLESVVTANHELLTSLLESHNGAKETVIHHYTKSFRGFSAMLTPNQATRLSENEDVVSVFESRTSQLHTTRSWRFLGVDSIPEYNKLPMDIKSDVIAGVIDTGVWPESESFNDHGLGPVPIKFKGECVPGQNFTKSNCNKKIIGARYYSKAYEAIRGPLENFNRTFFRSAGDTDGHGTHTSSTIAGSKVSNVGLHGLASGNVTGGVPSARLSIYKACWFNDCE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G215390
TK1151 IDTkA08G215390
OH-1004 IDLXL04_032945
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)79.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G215390
位置Chr08:56344128-56353298 (+)
描述Similar to SbtS: Subtilisin-like serine-protease S
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g67360 丝氨酸蛋白酶。
Ara12 subtilisin-like protease from Arabidopsis thaliana: purification, substrate specificity and tissue localization.2003 · DOI: 10.1042/bj20021125
A subtilisin-like serine protease essential for mucilage release from Arabidopsis seed coats.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03437.x
At2g04160 丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At5g59810 丝氨酸蛋白酶。
Overexpression of an Arabidopsis gene encoding a subtilase (AtSBT5.4) produces a clavata-like phenotype.2009 · DOI: 10.1007/s00425-009-0976-5
At3g14240 类胰蛋白酶样蛋白酶 SBT1.5。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032945 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0009609 response to symbiotic bacterium 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程
GO:0010037 response to carbon dioxide 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0036377 arbuscular mycorrhizal association 生物过程
GO:0080001 mucilage extrusion from seed coat 生物过程
GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:2000038 regulation of stomatal complex development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20160
ath:AT2G04160
ath:AT4G34980
ath:AT5G67360
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.567
排名 1 · TkA08G215390 · TK1151
溶酶体／液泡0.140
排名 2 · TkA08G215390 · TK1151
细胞质0.090
排名 3 · TkA08G215390 · TK1151
细胞膜0.086
排名 4 · TkA08G215390 · TK1151
内质网0.072
排名 5 · TkA08G215390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21864MORF_dom25-99 aa
PF05922Inhibitor_I927-105 aa
PF00082Peptidase_S8130-603 aa
PF21864MORF_dom240-256 aa
PF02225PA387-461 aa
PF21864MORF_dom459-481 aa
PF17766fn3_6467-486 aa
PF17766fn3_6645-739 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G215390PF21864MORF_dom25997.9e-0523.2
TkA08G215390PF05922Inhibitor_I9271051.6e-1661.5
TkA08G215390PF00082Peptidase_S81306032.6e-43149.1
TkA08G215390PF21864MORF_dom2402567.9e-0523.2
TkA08G215390PF02225PA3874616.6e-0626.9
TkA08G215390PF21864MORF_dom4594817.9e-0523.2
TkA08G215390PF17766fn3_64674863.5e-2588.8
TkA08G215390PF17766fn3_66457393.5e-2588.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65351拟南芥sp|O65351|SBT17_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.740.000%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSP5拟南芥sp|Q9ZSP5|AIR3_ARATH Subtilisin-like protease SBT5.339.500%Swiss-Prot中等置信
F4JXC5拟南芥sp|F4JXC5|SBT54_ARATH Subtilisin-like protease SBT5.438.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LUM3拟南芥sp|Q9LUM3|SBT15_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.538.600%Swiss-Prot中等置信

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