TkA08G212110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G212110

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 55510954-55512621 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1313 bp · TkA08G212110|TK1151|cDNA

TTGTGATTACCGCAAATGAAAACCAACCCCAGCAACCAGAAGACTGTGGAGTCACCGTCTTACACAGCGTTGTGCGCACGGGAATACGCAAACCAGTGGACGAACGAAAATGGCGACGGAGAATCGGAATCCAGAAATCAGGAAAGACTCAGTCAACAACAGGCTGGTGATTCTATCACCGGCTCGATCTCGCCGGCCGTCGGACTTCAAATCCAAATCCCAAGCCAAATCCGACTCAAGCCCGAGCTCCAACGCCCAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

609 bp · TkA08G212110|TK1151|CDS

ATGGCGACGGAGAATCGGAATCCAGAAATCAGGAAAGACTCAGTCAACAACAGGCTGGTGATTCTATCACCGGCTCGATCTCGCCGGCCGTCGGACTTCAAATCCAAATCCCAAGCCAAATCCGACTCAAGCCCGAGCTCCAACGCCCAACCACAGTGTCCGTTTTGTGCCGGAAACGAGCACCAATGCGCACCGGAAATTTTCCGGTTTCCTGAAGATTCTACTTCCGATTGGAAGGTCCGAGTGATCGAAAACTTGTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

202 aa · TkA08G212110|TK1151|PROTEIN

MATENRNPEIRKDSVNNRLVILSPARSRRPSDFKSKSQAKSDSSPSSNAQPQCPFCAGNEHQCAPEIFRFPEDSTSDWKVRVIENLYPALSRELQVKSNHEEYCQATGTAVEVSLGGFGFHDVIIESPIHSVHLPDLSPAGVAVVLLAYKKRIEQLCAVDSISYIQVFKNHGATAGASMSHSHSQILALPVIPTTASIVSTP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G212110`
TK1151 ID	TkA08G212110
OH-1004 ID	LXL04_032894
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.525 / OH-1004 51.436 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G212110

位置 Chr08:55510954-55512621 (-)

描述 Similar to At5g18200: ADP-glucose phosphorylase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g18200`	催化 ADP-葡萄糖和无机磷酸盐转化为葡萄糖-1-磷酸和 ADP。	Structure and mechanism of an ADP-glucose phosphorylase from Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1021/bi052232m

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032894 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程

GO:0006006 glucose metabolic process 生物过程

GO:0006012 galactose metabolic process 生物过程

GO:0033499 galactose catabolic process via UDP-galactose, Leloir pathway 生物过程

GO:0052574 UDP-galactose biosynthetic process 生物过程

GO:0080040 positive regulation of cellular response to phosphate starvation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004335 galactokinase activity 分子功能

GO:0008108 UDP-glucose:hexose-1-phosphate uridylyltransferase activity 分子功能

GO:0008198 ferrous iron binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G18200

ecj:JW0741

eco:b0758

ecoc:C3026_03845

hin:HI_0820

spo:2541407

tma:TM1191

tmi:THEMA_08375

tmm:Tmari_1198

tmw:THMA_1217

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.519

排名 1 · TkA08G212110 · TK1151

细胞核0.383

排名 2 · TkA08G212110 · TK1151

线粒体0.209

排名 3 · TkA08G212110 · TK1151

过氧化物酶体0.076

排名 4 · TkA08G212110 · TK1151

质体0.051

排名 5 · TkA08G212110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01087GalP_UDP_transf7-193 aa

PF16268DUF492124-80 aa

PF16285DUF4931_N47-59 aa

PF19327Ap4A_phos_N73-87 aa

PF16285DUF4931_N122-189 aa

PF01230HIT124-187 aa

PF16268DUF4921161-189 aa

PF19327Ap4A_phos_N167-197 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G212110	`PF01087`	GalP_UDP_transf	7	193	1.2e-16	62.4
TkA08G212110	`PF16268`	DUF4921	24	80	2e-06	27.7
TkA08G212110	`PF16285`	DUF4931_N	47	59	2.7e-05	25.0
TkA08G212110	`PF19327`	Ap4A_phos_N	73	87	0.00056	20.2
TkA08G212110	`PF16285`	DUF4931_N	122	189	2.7e-05	25.0
TkA08G212110	`PF01230`	HIT	124	187	0.037	15.4
TkA08G212110	`PF16268`	DUF4921	161	189	2e-06	27.7
TkA08G212110	`PF19327`	Ap4A_phos_N	167	197	0.00056	20.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FK51`	拟南芥	sp\|Q9FK51\|AGLUP_ARATH ADP-glucose phosphorylase	59.200%	Swiss-Prot	高置信

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