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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G203880
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 53317853-53319370 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1476 bp · TkA08G203880|TK1151|cDNA

ATGTTACGGTCAACTCACGTTAAGAAACGTCATGTACACAATGCCTGTAGCCTTCCGGTTACAACCGATGAACAAATCGCGGTACAGTATCCGTCCACAGTCCGGGGTCATTTCACCACTGACAACTGTTACTATCGAAATCACATACGATTTCCCCAAAATTCAACTCTCCCAGGGTCAATCCCGTACTCTGATGACTCGTTCTTGTTACACAGTGTTGTGGTCCCAGGTGCATCTGCCACCTCAACTAATGACTCGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1476 bp · TkA08G203880|TK1151|CDS

ATGTTACGGTCAACTCACGTTAAGAAACGTCATGTACACAATGCCTGTAGCCTTCCGGTTACAACCGATGAACAAATCGCGGTACAGTATCCGTCCACAGTCCGGGGTCATTTCACCACTGACAACTGTTACTATCGAAATCACATACGATTTCCCCAAAATTCAACTCTCCCAGGGTCAATCCCGTACTCTGATGACTCGTTCTTGTTACACAGTGTTGTGGTCCCAGGTGCATCTGCCACCTCAACTAATGACTCGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

491 aa · TkA08G203880|TK1151|PROTEIN

MLRSTHVKKRHVHNACSLPVTTDEQIAVQYPSTVRGHFTTDNCYYRNHIRFPQNSTLPGSIPYSDDSFLLHSVVVPGASATSTNDSVPSDWFTTRKKQVFVDSGIRVMFGGSIVMTRLVKNGAINEIREVLEKSDPSWNAINSVDSEGQTLLHLAVSQSRPDLVQLLLEFEPDIDGRNWSGASPLEAAAGSGQTLIVELLLAHRASMERLETSTWGAVHLAAGGGHVDVLKLLLLRGASVNSLTKDGNTALHLAVEERRR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G203880
TK1151 IDTkA08G203880
OH-1004 IDLXL04_032774
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.817 / OH-1004 86.338
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G203880
位置Chr08:53317853-53319370 (+)
描述Similar to VPY: Protein VAPYRIN
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032774 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0009609 response to symbiotic bacterium 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0010247 detection of phosphate ion 生物过程
GO:0010564 regulation of cell cycle process 生物过程
GO:0036377 arbuscular mycorrhizal association 生物过程
GO:0071300 cellular response to retinoic acid 生物过程
GO:0085020 protein K6-linked ubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
hsa:255239
mtr:11415982
mtr:25495843
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.419
排名 1 · TkA08G203880 · TK1151
细胞质0.403
排名 2 · TkA08G203880 · TK1151
细胞膜0.110
排名 3 · TkA08G203880 · TK1151
线粒体0.078
排名 4 · TkA08G203880 · TK1151
内质网0.054
排名 5 · TkA08G203880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00334NDK29-41 aa
PF00334NDK89-143 aa
PF12796Ank_2120-207 aa
PF13637Ank_4127-168 aa
PF13857Ank_5141-186 aa
PF18418AnkUBD142-168 aa
PF24521Ank_KRIT1146-204 aa
PF13606Ank_3147-175 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G203880PF00334NDK29410.1612.6
TkA08G203880PF00334NDK891430.1612.6
TkA08G203880PF12796Ank_21202072.1e-61205.2
TkA08G203880PF13637Ank_41271688.7e-46153.6
TkA08G203880PF13857Ank_51411861.7e-43146.9
TkA08G203880PF18418AnkUBD1421680.002318.8
TkA08G203880PF24521Ank_KRIT11462041.1e-1558.3
TkA08G203880PF13606Ank_31471757.2e-46149.0
TkA08G203880PF00023Ank1481782.9e-57188.1
TkA08G203880PF23745ANK_LRRK21602011.8e-0525.3
TkA08G203880PF00023Ank1812072.9e-57188.1
TkA08G203880PF13606Ank_31812047.2e-46149.0
TkA08G203880PF13857Ank_51812211.7e-43146.9
TkA08G203880PF24521Ank_KRIT11832371.1e-1558.3
TkA08G203880PF13637Ank_41862348.7e-46153.6
TkA08G203880PF12796Ank_22142752.1e-61205.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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