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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G203130
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 53096262-53099376 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2483 bp · TkA08G203130|TK1151|cDNA

CACACATAGAAACATGGTATTTAACATAACCTCGGTTAAGACATCATCAGATGGAGTGTGGCAAGGCAATAACCCTCTTCACTATGCATTTCCATTGTTGATACTTCAAACTACAATGGTTATCTTTATCAGTAGATTGCTCGCATTTTTCCTCAAACCTCTTCGACAACCTAAAGTCATCGCAGAGATACTCGGTGGAATTCTACTAGGGCCATCGGGTTTAGGCAGGAACAAGGAATTTATGCTATGGGTTTTCCCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2316 bp · TkA08G203130|TK1151|CDS

ATGGTATTTAACATAACCTCGGTTAAGACATCATCAGATGGAGTGTGGCAAGGCAATAACCCTCTTCACTATGCATTTCCATTGTTGATACTTCAAACTACAATGGTTATCTTTATCAGTAGATTGCTCGCATTTTTCCTCAAACCTCTTCGACAACCTAAAGTCATCGCAGAGATACTCGGTGGAATTCTACTAGGGCCATCGGGTTTAGGCAGGAACAAGGAATTTATGCTATGGGTTTTCCCGTCATGGAGCACGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

771 aa · TkA08G203130|TK1151|PROTEIN

MVFNITSVKTSSDGVWQGNNPLHYAFPLLILQTTMVIFISRLLAFFLKPLRQPKVIAEILGGILLGPSGLGRNKEFMLWVFPSWSTPILETVASIGLLFFLFLVGLELDLISIRRSGKKALAIASAGILLPFVFGVGITVLLLKAVSGADKVGYIQCFLFMGVSLSITAFPVLARILAELKLLTTSVGETAMAAAAFNDIAAWVLLALAVALAGGSHQNLLASLWVLLSGVGFVIFMVVVVRPTMDRIATRCSNHGQVEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G203130
TK1151 IDTkA08G203130
OH-1004 IDLXL04_032748
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.458
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G203130
位置Chr08:53096262-53099376 (-)
描述Similar to CHX20: Cation/H(+) antiporter 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g53720 可能作为 K⁺/H⁺ 反向转运蛋白，维持保卫细胞的 K⁺ 稳态并调节 pH。
Participation of endomembrane cation/H+ exchanger AtCHX20 in osmoregulation of guard cells.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.092155
At3g17630 可能作为阳离子／H⁺反向转运蛋白发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g41610 可能作为阳离子／H⁺反向转运蛋白发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g23700 作为K(+)/H⁺反向转运蛋白，控制K(+)的获取和稳态。
Characterization of AtCHX17, a member of the cation/H+ exchangers, CHX family, from Arabidopsis thaliana suggests a role in K+ homeostasis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02177.x
Arabidopsis thaliana CHX17 gene complements the kha1 deletion phenotypes in Saccharomyces cerevisiae.2006 · DOI: 10.1002/yea.1424
At1g64170 可能作为阳离子／H⁺反向转运蛋白发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032748 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0006885 regulation of pH 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005770 late endosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64170
ath:AT3G17630
ath:AT3G53720
ath:AT4G23700
ath:AT5G41610
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.736
排名 1 · TkA08G203130 · TK1151
内质网0.121
排名 2 · TkA08G203130 · TK1151
溶酶体／液泡0.085
排名 3 · TkA08G203130 · TK1151
细胞质0.064
排名 4 · TkA08G203130 · TK1151
高尔基体0.045
排名 5 · TkA08G203130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00999Na_H_Exchanger37-422 aa
PF28153VraH262-282 aa
PF28153VraH394-422 aa
PF23256CHX17_2nd490-598 aa
PF06434Aconitase_2_N499-562 aa
PF00582Usp542-593 aa
PF23259CHX17_C607-752 aa
PF00582Usp607-709 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G203130PF00999Na_H_Exchanger374226.4e-61207.0
TkA08G203130PF28153VraH2622820.6210.6
TkA08G203130PF28153VraH3944220.6210.6
TkA08G203130PF23256CHX17_2nd4905984.8e-2382.4
TkA08G203130PF06434Aconitase_2_N4995620.2411.8
TkA08G203130PF00582Usp5425930.0001323.3
TkA08G203130PF23259CHX17_C6077522e-2487.1
TkA08G203130PF00582Usp6077090.0001323.3
TkA08G203130PF28806PIM16496910.05714.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M353拟南芥sp|Q9M353|CHX20_ARATH Cation/H(+) antiporter 2057.100%Swiss-Prot高置信
Q9LUN4拟南芥sp|Q9LUN4|CHX19_ARATH Cation/H(+) antiporter 1948.100%Swiss-Prot中等置信
Q9FFR9拟南芥sp|Q9FFR9|CHX18_ARATH Cation/H(+) antiporter 1847.100%Swiss-Prot中等置信
Q9SUQ7拟南芥sp|Q9SUQ7|CHX17_ARATH Cation/H(+) antiporter 1745.400%Swiss-Prot中等置信
Q1HDT3拟南芥sp|Q1HDT3|CHX16_ARATH Cation/H(+) antiporter 1645.200%Swiss-Prot中等置信

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