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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G180600
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 47249031-47253227 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2013 bp · TkA08G180600|TK1151|cDNA

AAAAGACCTTCCCGACTTCAGTAACCCCTCACCGCCGATTTTAGCTTCCTGCTCCACAAACTCAAAACCACCATGGATCGTCTTCTTTACCAGACTGTCCTAAAAGGCGACCACGTCACTTTCCTCAAACTCATTCAAGAAAACGAAACCCTAATCACACAGACCGTGGTTGGATCATCAAACACCGTCTTGCACTTAGCAGCTCGGTTAGGCCACCTGGAACTGGTGTCGGAGATATTGAAGGTCTGCCCAGATATGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1362 bp · TkA08G180600|TK1151|CDS

ATGGATCGTCTTCTTTACCAGACTGTCCTAAAAGGCGACCACGTCACTTTCCTCAAACTCATTCAAGAAAACGAAACCCTAATCACACAGACCGTGGTTGGATCATCAAACACCGTCTTGCACTTAGCAGCTCGGTTAGGCCACCTGGAACTGGTGTCGGAGATATTGAAGGTCTGCCCAGATATGGTTGCGGCCGAGAACTGTGACCTAGAGACGCCGTTGCATGAAGCATGCAGAGAAGGAAAGTTTGAGGTGGTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

453 aa · TkA08G180600|TK1151|PROTEIN

MDRLLYQTVLKGDHVTFLKLIQENETLITQTVVGSSNTVLHLAARLGHLELVSEILKVCPDMVAAENCDLETPLHEACREGKFEVVKVLMAADEGVVGKVNSRGESVLFAACERGKIDVVKHLIEFEWLLLHEIDAFMCSIHVAAAGGHTDIVKEILNVRPEFARKYNSEGYSALHLACIKGQLDTTRELLWWDPDLVYLRDHNGWTPLHWASMKGRVGIIGEIISINLESIELVTNHGETVLHLAVKYNQFEVLKHLKE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G180600
TK1151 IDTkA08G180600
OH-1004 IDLXL04_032478
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.130 / OH-1004 70.853
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G180600
位置Chr08:47249031-47253227 (+)
描述Similar to At5g02620: Ankyrin repeat-containing protein At5g02620
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032478 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G01680
ath:AT5G02620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.473
排名 1 · TkA08G180600 · TK1151
细胞质0.284
排名 2 · TkA08G180600 · TK1151
细胞核0.221
排名 3 · TkA08G180600 · TK1151
内质网0.081
排名 4 · TkA08G180600 · TK1151
溶酶体／液泡0.047
排名 5 · TkA08G180600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796Ank_29-91 aa
PF13637Ank_433-52 aa
PF13857Ank_534-56 aa
PF24521Ank_KRIT136-125 aa
PF00023Ank37-57 aa
PF13606Ank_337-57 aa
PF13637Ank_440-89 aa
PF13857Ank_567-93 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G180600PF12796Ank_29912.5e-44150.5
TkA08G180600PF13637Ank_433521.8e-31108.1
TkA08G180600PF13857Ank_534561.5e-29102.5
TkA08G180600PF24521Ank_KRIT1361254.6e-0936.9
TkA08G180600PF00023Ank37572.8e-42141.1
TkA08G180600PF13606Ank_337578.5e-38124.3
TkA08G180600PF13637Ank_440891.8e-31108.1
TkA08G180600PF13857Ank_567931.5e-29102.5
TkA08G180600PF00023Ank71922.8e-42141.1
TkA08G180600PF13606Ank_371918.5e-38124.3
TkA08G180600PF23745ANK_LRRK2711280.0001922.0
TkA08G180600PF13637Ank_4741241.8e-31108.1
TkA08G180600PF12796Ank_2991262.5e-44150.5
TkA08G180600PF13857Ank_51011251.5e-29102.5
TkA08G180600PF00023Ank1041242.8e-42141.1
TkA08G180600PF13606Ank_31041258.5e-38124.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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