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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G173390
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 45312649-45316478 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2930 bp · TkA08G173390|TK1151|cDNA

CCAAAAAAAAACCTTCAGAGATTGGAGCACAAAACCATGTGCTAATATAAATCTCACATACACCCACATATAATTTCTTCCCCCTTTTTCTCTCTCTAAAAGTCCAAATCTTCCAAAAAATTCAGCTTCTGTTTGTTTCTATTTCTATTGATTTCCTTGAATTTGGTCTCATCTTTATGTCTAAAAATAAATAAACAATTTGGGCTTGATTCTGAAACATGAAGTTTTGTGGGTGTGATTGAGTGTTTATTTGGGGAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2079 bp · TkA08G173390|TK1151|CDS

ATGAATCTTGGTGGAGGTCAAGTAGTTAGCAAACAATCGATGATGCCTAGTTCAAGCTGTGCTTCTTGGAAGTCCACCGCTGGCGGCGGAGGTAGTGGTGGTGGCGGAGGCGACGGCGGTGTCCCTGATCAGTTTCCGGCCGGTTTACGGGTGCTTGTTGTTGATGATGACCCAACGTGTCTCATGATCTTGGAGAAGATGCTTAGAAATTGCAACTATGAAGTAACTAAATGCAACAGAGCGGAAGTTGCTTTATCGCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

692 aa · TkA08G173390|TK1151|PROTEIN

MNLGGGQVVSKQSMMPSSSCASWKSTAGGGGSGGGGGDGGVPDQFPAGLRVLVVDDDPTCLMILEKMLRNCNYEVTKCNRAEVALSHLRENKNGFDVVISDVHMPDMDGFKLLEHIGIEMDLPVIMMSADDSKSVVMKGVTHGACDYLIKPVRIEALRNIWQHVVRKRKHEWKDFEPSASADEQKPPEEPDYSSSANEGHNWKNTKRRKEEDDEAEERDDSSSLKKPRVVWSVELHQQFVAAVNQLGIDKAVPKKILELM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G173390
TK1151 IDTkA08G173390
OH-1004 IDLXL04_032417
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G173390
位置Chr08:45312649-45316478 (+)
描述Similar to ARR1: Two-component response regulator ARR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16110 特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]GATT-3' 的转录激活剂。
The response regulator ARR2: a pollen-specific transcription factor involved in the expression of nuclear genes for components of mitochondrial complex I in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1007/s004380000400
Two-component circuitry in Arabidopsis cytokinin signal transduction.2001 · DOI: 10.1038/35096500
The response regulator 2 mediates ethylene signalling and hormone signal integration in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7600337
Cytokinin-mediated control of leaf longevity by AHK3 through phosphorylation of ARR2 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0505150103
At3g16857 特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]GATT-3' 的转录激活剂。
Two-component circuitry in Arabidopsis cytokinin signal transduction.2001 · DOI: 10.1038/35096500
ARR1, a transcription factor for genes immediately responsive to cytokinins.2001 · DOI: 10.1126/science.1065201
A genetic framework for the control of cell division and differentiation in the root meristem.2008 · DOI: 10.1126/science.1164147

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XE31 可结合特定DNA序列的转录激活因子。 暂无已核实直接文献
Os03g0224200 可结合特定DNA序列的转录激活因子。 暂无已核实直接文献
Os01g0904700 可结合特定DNA序列的转录激活因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032417 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0010492 maintenance of shoot apical meristem identity 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16857
ath:AT4G16110
dosa:Os03g0224200
dosa:Os06g0183100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA08G173390 · TK1151
细胞质0.075
排名 2 · TkA08G173390 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA08G173390 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkA08G173390 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA08G173390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00072Response_reg51-159 aa
PF00072Response_reg227-256 aa
PF00249Myb_DNA-binding228-278 aa
PF22895DUF7024340-409 aa
PF22895DUF7024411-462 aa
PF22895DUF7024614-680 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G173390PF00072Response_reg511592e-2486.6
TkA08G173390PF00072Response_reg2272562e-2486.6
TkA08G173390PF00249Myb_DNA-binding2282784.1e-0833.9
TkA08G173390PF22895DUF70243404095.87.5
TkA08G173390PF22895DUF70244114625.87.5
TkA08G173390PF22895DUF70246146805.87.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZWJ9拟南芥sp|Q9ZWJ9|ARR2_ARATH Two-component response regulator ARR245.600%Swiss-Prot中等置信
Q940D0拟南芥sp|Q940D0|ARR1_ARATH Two-component response regulator ARR144.700%Swiss-Prot中等置信
A2XE31水稻sp|A2XE31|ORR21_ORYSI Two-component response regulator ORR2159.300%Swiss-Prot低置信
Q8H7S7水稻sp|Q8H7S7|ORR21_ORYSJ Two-component response regulator ORR2159.300%Swiss-Prot低置信
Q5N6V8水稻sp|Q5N6V8|ORR26_ORYSJ Two-component response regulator ORR2658.900%Swiss-Prot低置信

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