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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G170730
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44637401-44648691 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2462 bp · TkA08G170730|TK1151|cDNA

CGAGCGCCCACTCGCTGCCCAGTGCCCAGATCGCTAGAATCTGACAGATAGAAGAGAGGGCGCGGTCGAACGGTGCTCTCTCACACCAAAGATCAGGCCTTGAGTGGGCCCATTAAGAATATGGCAAGCAATCATGGTGGTAAGGATGTTATGGATTGTGGAAGCAGCGAGAGTAACACTTCTGAAACCACAGTTGAAATAAAGATAAAGACTTTGGATTCTCAAACATACACTCTGCGAGTAGACAAATGCGTACCTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

4272 bp · TkA08G170730|TK1151|CDS

ATGGATAATCCGTGGCAGCTGAGCAAATGTGGTTCGACCTGCCATTCATCGGCGGAGCAGGCTGCGGTAGTGGCTCAGTCTCCGGTTTCTCAAGTTCAGTCACACGATTCTACTAGGAATTCGATGATGAATCCAAGTCATTACTATAATCCACATATCTCGCAAGAACCATGTTCATCAACCCATAAACTGATGCCCGATCCATTGTTTCAAGCTACAAACATCAATTTATACAACTCAAGCCTCTCAGTGATGGGAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1423 aa · TkA08G170730|TK1151|PROTEIN

MDNPWQLSKCGSTCHSSAEQAAVVAQSPVSQVQSHDSTRNSMMNPSHYYNPHISQEPCSSTHKLMPDPLFQATNINLYNSSLSVMGTSFFTLLSGPPASFSKYDSQQVLSSKPSNPSSKIHVYSTSSFVGPTQCETSFATPKVSPHNIDNRYLKSKIDVFPVSDSGNTTGLHDILQARKVNGFSSLKPAPICGASASATPVPSPIKSGLPRVFCLYASGDLFLSSSGLLGVVCSCHGFRMSISKFSEHAGLQDINPGDAV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G170730
TK1151 IDTkA08G170730
OH-1004 IDLXL04_003523
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)28.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 31.413 / OH-1004 39.748
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G170730
位置Chr08:44637401-44648691 (+)
描述Similar to ATX2: Histone-lysine N-methyltransferase ATX2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g05830 组蛋白甲基转移酶。
The highly similar Arabidopsis homologs of trithorax ATX1 and ATX2 encode proteins with divergent biochemical functions.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.056614
Combinatorial functions of diverse histone methylations in Arabidopsis thaliana flowering time regulation.2014 · DOI: 10.1111/nph.12493
At4g27910 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At5g53430 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At3g61740 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0134500 体外具有组蛋白H3甲基转移酶活性。
Trithorax group protein Oryza sativa Trithorax1 controls flowering time in rice via interaction with early heading date3.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.228049
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003523 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程
GO:0010093 specification of floral organ identity 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05830
ath:AT2G31650
ath:AT4G27910
ath:AT5G53430
dosa:Os09g0134500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.947
排名 1 · TkA08G170730 · TK1151
细胞质0.118
排名 2 · TkA08G170730 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA08G170730 · TK1151
线粒体0.013
排名 4 · TkA08G170730 · TK1151
内质网0.009
排名 5 · TkA08G170730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16135TDBD229-273 aa
PF00856SET470-488 aa
PF13771zf-HC5HC2H619-659 aa
PF13832zf-HC5HC2H_2622-660 aa
PF00856SET898-939 aa
PF13832zf-HC5HC2H_2963-1016 aa
PF13771zf-HC5HC2H969-1015 aa
PF23011PHD-1st_NSD982-1028 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G170730PF16135TDBD2292738.6e-1452.0
TkA08G170730PF00856SET4704881.3e-2384.2
TkA08G170730PF13771zf-HC5HC2H6196592.4e-1144.4
TkA08G170730PF13832zf-HC5HC2H_26226601.2e-1351.9
TkA08G170730PF00856SET8989391.3e-2384.2
TkA08G170730PF13832zf-HC5HC2H_296310161.2e-1351.9
TkA08G170730PF13771zf-HC5HC2H96910152.4e-1144.4
TkA08G170730PF23011PHD-1st_NSD98210281.89.5
TkA08G170730PF00628PHD98310270.004117.8
TkA08G170730PF13831PHD_299510276.7e-0935.8
TkA08G170730PF13771zf-HC5HC2H102910452.4e-1144.4
TkA08G170730PF13832zf-HC5HC2H_2103510521.2e-1351.9
TkA08G170730PF13832zf-HC5HC2H_2108711611.2e-1351.9
TkA08G170730PF00628PHD108710940.004117.8
TkA08G170730PF13771zf-HC5HC2H109111812.4e-1144.4
TkA08G170730PF23011PHD-1st_NSD112211531.89.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0CB22拟南芥sp|P0CB22|ATX2_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX229.900%Swiss-Prot低置信
Q9SUE7拟南芥sp|Q9SUE7|ATX4_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX428.000%Swiss-Prot低置信
Q8GZ42拟南芥sp|Q8GZ42|ATX5_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX527.300%Swiss-Prot低置信
Q9M364拟南芥sp|Q9M364|ATX3_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX327.100%Swiss-Prot低置信
Q6K431水稻sp|Q6K431|TRX1_ORYSJ Histone-lysine N-methyltransferase TRX128.900%Swiss-Prot低置信

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