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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G149510
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 38912785-38916708 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1389 bp · TkA08G149510|TK1151|cDNA

ATGGACTCTCGCTTTATATATATTTTATCTCCACTGCACCACCAAAGCATAGATTCTCTCCATCAAAATGTTGTAACATTTTAAATTCATTATAGCCCTTAAATCGCGATATGAAGCACATTGTGCAGCTGGTTCACTTTTGAATCTTGACATGTTTTATTCTCTTTGTAACCACACAAGCTGCCTATAAATTAAGGCCACACTACCAAAGGTGTCTCCTCAACACATAACAAGTTCTAGTGCAGTTTCTTTAAGATGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

759 bp · TkA08G149510|TK1151|CDS

ATGAGTTATACAAATGCTTCAGTTGGTTCTGGTAGTAGAAGTGGTAGGAGAAGTGTGGAGTTTGGTAGGACTTATGTTGTGAGGCCAAAAGGGAAGCACCAAGCTACGGTTGTTTGGTTGCATGGTCTTGGTGATAATGGCTCAAGTTGGTCTCAACTCTTGGATAACCTTCCTCTCCCAAACATTAAGTGGATATGCCCAACTGCTCCTACTCGCCCTGTGACCGTTCTTGGTGGATTTCCTTGCACTGCATGGTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

252 aa · TkA08G149510|TK1151|PROTEIN

MSYTNASVGSGSRSGRRSVEFGRTYVVRPKGKHQATVVWLHGLGDNGSSWSQLLDNLPLPNIKWICPTAPTRPVTVLGGFPCTAWFDEGELSEDGPNDVEGLDASVSHIANLLSTEPTDVKLGIGGFSMGAACALYSATCFAMGKYGNGSPYPVNLKAIVGLSGWLPGGRSLRNMIEGSQDGLRRAASLPIFLCHGRGDEVVPYKFGERSSQILSSAGFRYVAFKIYEGLGHYTVPKEMEEVCQWLNARLVG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G149510
TK1151 IDTkA08G149510
OH-1004 IDLXL04_008557
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.824
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G149510
位置Chr08:38912785-38916708 (-)
描述Similar to Lypla2: Acyl-protein thioesterase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008557 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002084 protein depalmitoylation 生物过程
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0015908 fatty acid transport 生物过程
GO:0042997 negative regulation of Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程
GO:0046464 acylglycerol catabolic process 生物过程
GO:1905336 negative regulation of aggrephagy 生物过程
GO:1905344 prostaglandin catabolic process 生物过程
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005795 Golgi stack 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
hsa:10434
hsa:11313
mmu:26394
pon:100172358
rno:83510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.640
排名 1 · TkA08G149510 · TK1151
细胞质0.367
排名 2 · TkA08G149510 · TK1151
质体0.084
排名 3 · TkA08G149510 · TK1151
细胞膜0.047
排名 4 · TkA08G149510 · TK1151
内质网0.041
排名 5 · TkA08G149510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02230Abhydrolase_225-248 aa
PF12146Hydrolase_432-62 aa
PF00561Abhydrolase_136-58 aa
PF12697Abhydrolase_637-155 aa
PF03959FSH181-205 aa
PF01738DLH108-232 aa
PF01764Lipase_3108-144 aa
PF12146Hydrolase_4113-136 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G149510PF02230Abhydrolase_2252481.4e-42146.7
TkA08G149510PF12146Hydrolase_432622.6e-0627.7
TkA08G149510PF00561Abhydrolase_136580.03814.4
TkA08G149510PF12697Abhydrolase_6371553.3e-0525.3
TkA08G149510PF03959FSH1812052.2e-0834.7
TkA08G149510PF01738DLH1082320.003717.6
TkA08G149510PF01764Lipase_31081440.1712.5
TkA08G149510PF12146Hydrolase_41131362.6e-0627.7
TkA08G149510PF03583LIP1181380.05413.5
TkA08G149510PF00326Peptidase_S91211370.01815.3
TkA08G149510PF00561Abhydrolase_11211370.03814.4
TkA08G149510PF12146Hydrolase_41722342.6e-0627.7
TkA08G149510PF00561Abhydrolase_11782330.03814.4
TkA08G149510PF12697Abhydrolase_61822423.3e-0525.3
TkA08G149510PF03583LIP1862510.05413.5
TkA08G149510PF00326Peptidase_S91882450.01815.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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