TkA08G143990 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G143990

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 37542384-37547768 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2625 bp · TkA08G143990|TK1151|cDNA

ATGAAGTCATATGATTCCACAGTGGACCATTTTCTCCCTACCTGGGTTGATTATGGTGGTGGCGACTGTTGTGATTGGGAGAGGGTCACCTGCAACACAACCACAGGGCATGTCACGGAGCTTTATTTGTACTATTTGAGAGAGAAAGACGATAACATAAAGTTTTGGAGCAAGTTGTGGCCATTGAATGCTTCCTTGTTTCTTCATTTTAAAGAGTTGAGACTTCTCAATTTGTCAAATGATTTTCTTGATAAAGAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2625 bp · TkA08G143990|TK1151|CDS

ATGAAGTCATATGATTCCACAGTGGACCATTTTCTCCCTACCTGGGTTGATTATGGTGGTGGCGACTGTTGTGATTGGGAGAGGGTCACCTGCAACACAACCACAGGGCATGTCACGGAGCTTTATTTGTACTATTTGAGAGAGAAAGACGATAACATAAAGTTTTGGAGCAAGTTGTGGCCATTGAATGCTTCCTTGTTTCTTCATTTTAAAGAGTTGAGACTTCTCAATTTGTCAAATGATTTTCTTGATAAAGAGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

874 aa · TkA08G143990|TK1151|PROTEIN

MKSYDSTVDHFLPTWVDYGGGDCCDWERVTCNTTTGHVTELYLYYLREKDDNIKFWSKLWPLNASLFLHFKELRLLNLSNDFLDKETMYTGFERWSSLKKLEVLDLSWNDDIDNDILPSLRNLTSLKILDLSGTSLNGNFSISEFATLENLELLDLSNCNFNGFESISVLRKLKLLNHGYNRFNESIVTSLNTLSSLKNLDLSYNPLFRPFPAQVLAHLTNLETLDLSFAQLNDTPDIEACKSLSGLKRLVSIYLSGNNF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G143990`
TK1151 ID	TkA08G143990
OH-1004 ID	LXL04_032039
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	48.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 95.554 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G143990

位置 Chr08:37542384-37547768 (+)

描述 Similar to RLP13: Receptor-like protein 13

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g74170`	受体样蛋白 13。	暂无已核实直接文献
`At1g74190`	受体样蛋白 15。	暂无已核实直接文献
`At1g07390`	参与植物防御。	The receptor-like protein ReMAX of Arabidopsis detects the microbe-associated molecular pattern eMax from Xanthomonas.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110833 Perception of the novel MAMP eMax from different Xanthomonas species requires the Arabidopsis receptor-like protein ReMAX and the receptor kinase SOBIR.2013 · DOI: 10.4161/psb.27408
`At5g49290`	类受体蛋白56。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032039 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009791 post-embryonic development 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G07390

ath:AT1G74170

ath:AT1G74190

ath:AT5G49290

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.838

排名 1 · TkA08G143990 · TK1151

内质网0.101

排名 2 · TkA08G143990 · TK1151

细胞质0.064

排名 3 · TkA08G143990 · TK1151

细胞核0.047

排名 4 · TkA08G143990 · TK1151

溶酶体／液泡0.030

排名 5 · TkA08G143990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_29-32 aa

PF13855LRR_859-110 aa

PF12799LRR_469-80 aa

PF00560LRR_173-83 aa

PF25013LRR_Zer-184-139 aa

PF23952LRR_EndoS89-158 aa

PF29594LRR_SKP291-133 aa

PF12799LRR_493-113 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G143990	`PF08263`	LRRNT_2	9	32	0.0029	18.6
TkA08G143990	`PF13855`	LRR_8	59	110	3.3e-37	126.8
TkA08G143990	`PF12799`	LRR_4	69	80	7e-26	90.4
TkA08G143990	`PF00560`	LRR_1	73	83	5.8e-38	121.4
TkA08G143990	`PF25013`	LRR_Zer-1	84	139	8.1e-13	49.4
TkA08G143990	`PF23952`	LRR_EndoS	89	158	0.35	11.8
TkA08G143990	`PF29594`	LRR_SKP2	91	133	0.00076	19.5
TkA08G143990	`PF12799`	LRR_4	93	113	7e-26	90.4
TkA08G143990	`PF25372`	LRR_FBXL15	93	135	3.9e-06	26.2
TkA08G143990	`PF23598`	LRR_14	95	280	2e-21	76.9
TkA08G143990	`PF23211`	LRR_LRWD1	95	153	5.3e-06	27.0
TkA08G143990	`PF24758`	LRR_At5g56370	98	161	0.023	15.1
TkA08G143990	`PF23247`	LRR_RPS2	98	160	0.17	12.6
TkA08G143990	`PF12799`	LRR_4	99	136	7e-26	90.4
TkA08G143990	`PF13516`	LRR_6	99	115	8.1e-08	32.5
TkA08G143990	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	99	176	0.00021	21.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C6A6`	拟南芥	sp\|Q9C6A6\|RLP13_ARATH Receptor-like protein 13	37.200%	Swiss-Prot	低置信
`Q9C6A8`	拟南芥	sp\|Q9C6A8\|RLP15_ARATH Receptor-like protein 15	32.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LNV9`	拟南芥	sp\|Q9LNV9\|RLP1_ARATH Receptor-like protein 1	35.800%	Swiss-Prot	低置信
`F4K4T3`	拟南芥	sp\|F4K4T3\|RLP56_ARATH Receptor-like protein 56	44.000%	Swiss-Prot	低置信

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