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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G138220
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 35952400-35957582 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2706 bp · TkA08G138220|TK1151|cDNA

CGCAACTGCTCTGAGTTTCTGTGTAAAACCGTACTTCCGCCATGGCCGGCGTTAAAGTTAAGCAAGAATTCATGGAAGTACCGAACGGCAACGATAGTAACAATACGAAAACCAAGGATGTTTCGGGAGCTCCGGTGATTGATCTGGACAGTTCCGATGACGATTCCTGTTCATATGGGGACGGAATTAATAATAGCAAGAGACCTAGGGTTTCGAAAGACACCGATGAAGTTCATAACAACAAAAGGAATAAATCTGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1290 bp · TkA08G138220|TK1151|CDS

ATGCCGATAAACATGTTTGTGTTACTACAAATCAATGATATTCAAATCCGAGGTGTTAATCGTGATGAAAAAAGTATAGAAATGGCAATACAGTATCCCAACTCTAGACACTTCCTCACATACCGCCACTCTCTAAGGAGTTATGCATCGATCCTGTATCTTAGAGTGCCACCTAACTTCCGGATGATTCTACGGGGGGTGGATGTGCAACATCATAATATTGTGAATGATATGATGATGACAAATGAGGTTACTTATCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

429 aa · TkA08G138220|TK1151|PROTEIN

MPINMFVLLQINDIQIRGVNRDEKSIEMAIQYPNSRHFLTYRHSLRSYASILYLRVPPNFRMILRGVDVQHHNIVNDMMMTNEVTYRPQPGQDGVPKDLNMVATVTVGFVKDARAHIDVQGFNVYHKNRLIKPFWRLWNAAGSDGRGVIGVLEANFVEPAHDKQGFERTNVLSRLETRLVHMQKTYWSAYCHKIGYAPRQHKNKPEDSEPSPNYRDDVPSKNKNPSSEKKTPPVPNATDKYPSSDKHQKHGGIFGEKTHG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G138220
TK1151 IDTkA08G138220
OH-1004 IDLXL04_031957
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.436 / OH-1004 53.935
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G138220
位置Chr08:35952400-35957582 (+)
描述Similar to MORC4: Protein MICRORCHIDIA 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g50780 显示 ATP酶活性。
Arabidopsis AtMORC4 and AtMORC7 Form Nuclear Bodies and Repress a Large Number of Protein-Coding Genes.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005998
At4g24970 显示 ATP酶活性。
Arabidopsis AtMORC4 and AtMORC7 Form Nuclear Bodies and Repress a Large Number of Protein-Coding Genes.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005998
At5g13130 显示 ATP酶活性。 暂无已核实直接文献
At1g19100 作为 RdDM 机械的一部分参与 RNA 导向的 DNA 甲基化（RdDM），并且对基因沉默是必需的。
MORC family ATPases required for heterochromatin condensation and gene silencing.2012 · DOI: 10.1126/science.1221472
Involvement of a GHKL ATPase in RNA-directed DNA methylation in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1016/j.cub.2012.03.061
The stochastic silencing phenotype of Arabidopsis morc6 mutants reveals a role in efficient RNA-directed DNA methylation.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12246
Arabidopsis AtMORC4 and AtMORC7 Form Nuclear Bodies and Repress a Large Number of Protein-Coding Genes.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005998
Two Components of the RNA-Directed DNA Methylation Pathway Associate with MORC6 and Silence Loci Targeted by MORC6 in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1006026
At4g36290 由不同类别的 R 蛋白触发的防御信号传导介体。
MORC family ATPases required for heterochromatin condensation and gene silencing.2012 · DOI: 10.1126/science.1221472
Transcriptional gene silencing by Arabidopsis microrchidia homologues involves the formation of heteromers.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1406611111

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031957 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002230 positive regulation of defense response to virus by host 生物过程
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0006282 regulation of DNA repair 生物过程
GO:0006325 chromatin organization 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0031047 regulatory ncRNA-mediated gene silencing 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0034052 positive regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0060966 regulation of gene silencing by regulatory ncRNA 生物过程
GO:0080188 gene silencing by siRNA-directed DNA methylation 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G24970
ath:AT4G36290
ath:AT5G13130
ath:AT5G50780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.830
排名 1 · TkA08G138220 · TK1151
细胞质0.200
排名 2 · TkA08G138220 · TK1151
细胞膜0.036
排名 3 · TkA08G138220 · TK1151
线粒体0.035
排名 4 · TkA08G138220 · TK1151
内质网0.021
排名 5 · TkA08G138220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17942Morc6_S543-187 aa
PF28159CEP89198-371 aa
PF06810Phage_scaffold301-411 aa
PF24555CC4_CEP85336-416 aa
PF20461DUF6714357-394 aa
PF28159CEP89380-421 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G138220PF17942Morc6_S5431874.2e-60202.5
TkA08G138220PF28159CEP891983713.46.7
TkA08G138220PF06810Phage_scaffold3014113.68.2
TkA08G138220PF24555CC4_CEP853364164.28.6
TkA08G138220PF20461DUF67143573940.04714.4
TkA08G138220PF28159CEP893804213.46.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KAF2拟南芥sp|F4KAF2|MORC4_ARATH Protein MICRORCHIDIA 447.100%Swiss-Prot中等置信
F4JRS4拟南芥sp|F4JRS4|MORC7_ARATH Protein MICRORCHIDIA 747.600%Swiss-Prot中等置信
F4K2G3拟南芥sp|F4K2G3|MORC5_ARATH Protein MICRORCHIDIA 570.900%Swiss-Prot低置信
Q56Y74拟南芥sp|Q56Y74|MORC6_ARATH Protein MICRORCHIDIA 651.300%Swiss-Prot低置信
Q84WV6拟南芥sp|Q84WV6|MORC1_ARATH Protein MICRORCHIDIA 144.200%Swiss-Prot低置信

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