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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G135350
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 35203924-35206396 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1911 bp · TkA08G135350|TK1151|cDNA

TTTTCACTGCACTTGTCATTTTATAGGCTGCTAAGAACTTTATACTAACCGGCACGTCACCCTAACCTTTATCTTCTACAAACATTGTCTTGCCTTCGAGAAAACCCCTTTTACACAAAAGCCCTAAAACCTCGAATTGAATCTATTACTCTAATCAGGATCGTAACCTGATCATCATTATGTCAGAAGAAGAAATCGCGATAGAAGCAATAAAGCATGCATTGAAGGCTCTTCGGAAGCGGCATCTGCTGGAAGAGGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1530 bp · TkA08G135350|TK1151|CDS

ATGTCAGAAGAAGAAATCGCGATAGAAGCAATAAAGCATGCATTGAAGGCTCTTCGGAAGCGGCATCTGCTGGAAGAGGGAGCTCATGGGCCTGCTATTATAGCTCTTTCTAAACCTATTGCTTCTCAGGGTTCAGAATGGAAGGATAAGGCAGAAACTCTCGAATTGGAGCTTCAACAATGTTATAAAGCTCAATCTCGATTATCAGAGCAACTTGTAGTGGAAGTAGCCGAATCTAGAGCCGCAAAATCTTTAGCTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

509 aa · TkA08G135350|TK1151|PROTEIN

MSEEEIAIEAIKHALKALRKRHLLEEGAHGPAIIALSKPIASQGSEWKDKAETLELELQQCYKAQSRLSEQLVVEVAESRAAKSLAQEKEALIPNLENDLTQARNECSRLSALLEENTKALELLIGENKDLKSQYEEMRSRAINAETENKTLIDRWMLQKMQDAERLNEANALYEDMLGKLKASGLEQLARQQIDGVVRQSEEGAEYYVESTIPTTCAHRIPAHEGGCASILFENTSGKLLTGGQDQTVKMWDTATGQLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G135350
TK1151 IDTkA08G135350
OH-1004 IDLXL04_009466
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)63.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 14.931 / OH-1004 76.768
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G135350
位置Chr08:35203924-35206396 (-)
描述Similar to ATG16: Autophagy-related protein 16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g50230 可能在自噬中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009466 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G50230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.572
排名 1 · TkA08G135350 · TK1151
细胞核0.334
排名 2 · TkA08G135350 · TK1151
高尔基体0.131
排名 3 · TkA08G135350 · TK1151
溶酶体／液泡0.128
排名 4 · TkA08G135350 · TK1151
细胞膜0.063
排名 5 · TkA08G135350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26095CC_Bre141-72 aa
PF08614ATG1643-168 aa
PF27879Mplasa_alph_rch54-171 aa
PF25450Rab11-FIP364-158 aa
PF16529Ge1_WD4065-115 aa
PF30381CEP135_N66-168 aa
PF26052BRE1B70-120 aa
PF07569Hira82-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G135350PF26095CC_Bre141723.18.8
TkA08G135350PF08614ATG16431681.6e-1455.3
TkA08G135350PF27879Mplasa_alph_rch541710.4310.2
TkA08G135350PF25450Rab11-FIP3641582.79.0
TkA08G135350PF16529Ge1_WD40651150.1112.1
TkA08G135350PF30381CEP135_N661680.0712.7
TkA08G135350PF26052BRE1B701204.27.9
TkA08G135350PF07569Hira821092.28.5
TkA08G135350PF26095CC_Bre1821473.18.8
TkA08G135350PF30907IPGA1_CC851500.511.4
TkA08G135350PF26052BRE1B1221814.27.9
TkA08G135350PF24506KNTC1_N1462970.006516.5
TkA08G135350PF23869Beta-prop_WDR75_1st2082642e-1557.6
TkA08G135350PF25168Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd2093721.4e-28100.8
TkA08G135350PF31099SHKBP1_KCTD3_C2102560.03313.5
TkA08G135350PF25173Beta-prop_WDR3_1st2132959.9e-44149.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6NNP0拟南芥sp|Q6NNP0|ATG16_ARATH Autophagy-related protein 1667.600%Swiss-Prot高置信

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