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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G134490
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 34986813-34988552 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1740 bp · TkA08G134490|TK1151|cDNA

ATGGCGGACTCCTTGATCACTTTGCTTCTCATCCTTCTCTTCTTCTCCCTCACAAAACCCACAATTTCTCAACAGCAATACGACCATACTCCATGCAACACCACCGCCCCTCTCCTCAACGTCTCCACTTACACCTGCAACTCCGACACCAAAACCTGCAACACCTTCATCGTCTACCGACCTCAATTCCACCAAACACTTTCCGCCATCGCCACCCTTTTCAACGTCAATGAATCGCAGCTAAACTCAACAACCCGTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1740 bp · TkA08G134490|TK1151|CDS

ATGGCGGACTCCTTGATCACTTTGCTTCTCATCCTTCTCTTCTTCTCCCTCACAAAACCCACAATTTCTCAACAGCAATACGACCATACTCCATGCAACACCACCGCCCCTCTCCTCAACGTCTCCACTTACACCTGCAACTCCGACACCAAAACCTGCAACACCTTCATCGTCTACCGACCTCAATTCCACCAAACACTTTCCGCCATCGCCACCCTTTTCAACGTCAATGAATCGCAGCTAAACTCAACAACCCGTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

579 aa · TkA08G134490|TK1151|PROTEIN

MADSLITLLLILLFFSLTKPTISQQQYDHTPCNTTAPLLNVSTYTCNSDTKTCNTFIVYRPQFHQTLSAIATLFNVNESQLNSTTRLQDREVVVPITCNCPDSSSRAIINFSNVNSFAFPDIACGVYQGLVKPFVLAQQNGNLQLQGIPFVQVPVKCACVNSSNGSGYLVTYPIMENDTIKKIARKFGVTVGSIYKANEMDPRQTIFGGTTLLVPTTDVPVLNLDHLIDNPSSQDTIPVTGNVNRRTGMRFSFLFIIVFA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G134490
TK1151 IDTkA08G134490
OH-1004 IDLXL04_033048
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)32.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.273 / OH-1004 99.161
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G134490
位置Chr08:34986813-34988552 (+)
描述Similar to LYK4: LysM domain receptor-like kinase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23770 赖氨酸基序 受体激酶，在几丁质激发子信号传导中充当细胞表面受体，导致先天免疫。
LYK4, a lysin motif receptor-like kinase, is important for chitin signaling and plant innate immunity in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201699
At2g33580 可能识别来源于微生物的含N-乙酰葡萄糖胺（NAG）配体。 暂无已核实直接文献
At1g16120 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g19390 推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为细胞外基质组分的信号受体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033048 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002752 cell surface pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0032491 detection of molecule of fungal origin 生物过程
GO:0032499 detection of peptidoglycan 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G23770
ath:AT2G33580
ath:AT3G01840
ath:AT3G21630
mtr:11410973
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.779
排名 1 · TkA08G134490 · TK1151
内质网0.113
排名 2 · TkA08G134490 · TK1151
细胞质0.084
排名 3 · TkA08G134490 · TK1151
细胞核0.055
排名 4 · TkA08G134490 · TK1151
溶酶体／液泡0.051
排名 5 · TkA08G134490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23446LysM1_NFP_LYK52-100 aa
PF12633Adenyl_cycl_N57-84 aa
PF23473LysM3_LYK4_559-97 aa
PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_565-95 aa
PF13518HTH_2865-81 aa
PF23577LysM_RLK65-78 aa
PF13384HTH_2365-82 aa
PF01476LysM66-81 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G134490PF23446LysM1_NFP_LYK521007.5e-1556.3
TkA08G134490PF12633Adenyl_cycl_N57840.09813.3
TkA08G134490PF23473LysM3_LYK4_559971.3e-1661.1
TkA08G134490PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_565958.5e-0523.1
TkA08G134490PF13518HTH_2865810.008916.8
TkA08G134490PF23577LysM_RLK65780.0215.7
TkA08G134490PF13384HTH_2365820.1812.4
TkA08G134490PF01476LysM66811.1e-0938.7
TkA08G134490PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_51191428.5e-0523.1
TkA08G134490PF23446LysM1_NFP_LYK1511597.5e-1556.3
TkA08G134490PF23473LysM3_LYK4_51682151.3e-1661.1
TkA08G134490PF23462LysM3_NFP1682000.09913.9
TkA08G134490PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_51702158.5e-0523.1
TkA08G134490PF23577LysM_RLK1701900.0215.7
TkA08G134490PF13518HTH_281751960.008916.8
TkA08G134490PF01476LysM1762151.1e-0938.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64825拟南芥sp|O64825|LYK4_ARATH LysM domain receptor-like kinase 429.100%Swiss-Prot低置信
O22808拟南芥sp|O22808|LYK5_ARATH Protein LYK530.800%Swiss-Prot中等置信
Q9S9M5拟南芥sp|Q9S9M5|WAKLA_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 134.700%Swiss-Prot低置信
Q9LN59拟南芥sp|Q9LN59|WAKLK_ARATH Putative wall-associated receptor kinase-like 1134.300%Swiss-Prot低置信

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