TkA08G131050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G131050

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 34006834-34009048 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1704 bp · TkA08G131050|TK1151|cDNA

ATAAACTTTACCAAACAAACTAACAAACTCACCGACAATAGAAATATTCCTAATTTCCAAGCTTCGAACTGTCCTTGATATTGTAATGGGATTCTTCTTTTCGGCGGAACACCTTTTTCTCAAGCTCAGCCAAAAGAGCGTGCCCCACAAGAACTACAATTCAGAGAAGACGGTGAAAATCAACCATTAATTCGGTCGCAAATTCAGCTGCTTGCGTGGACCTTTTTCTGATTATTTATCCCATTAAATTCTCACTGTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1062 bp · TkA08G131050|TK1151|CDS

ATGGGCAATCGATTTAGTTGCAAGACGAAGAATAATACTAATAACGGGTCGAAAAGTAGTCGAAGATTCGGCGGTGGGAATCGATCACAGCGGAAATTGCAATCAGATGAGGAGTTATTACACATGCAAGCTCTGTCTCTCGCAATTCAACACCATCAATCGTCTCAACGATTCGAAGGTTCTTTGTCTAGACGGATTGGATCCACCAGTTCGCGCCGCCGCAATAACCCCATCTCCGATCCAACCTTAACTAATCCCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

353 aa · TkA08G131050|TK1151|PROTEIN

MGNRFSCKTKNNTNNGSKSSRRFGGGNRSQRKLQSDEELLHMQALSLAIQHHQSSQRFEGSLSRRIGSTSSRRRNNPISDPTLTNPKQQKQSPEFLENLETKKIVLIHGEGFGAWCWYKTIALLEESGMLPTALDLTGSGIDLKDTNNVTTLEDYSKPLSDYLQNLPEDEKVILVGHSIGGACVSYALEHFQNKISKAVFLCGTMVSDGRKPFDVFSEELGSAEMFMKESKFLIHGNGEENPATGFMFEKQQMRGLYFNQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G131050`
TK1151 ID	TkA08G131050
OH-1004 ID	LXL04_006507
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	48.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 92.068 / OH-1004 89.034 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G131050

位置 Chr08:34006834-34009048 (+)

描述 Similar to MES11: Putative methylesterase 11, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q940H7`	推定甲基酯酶。	暂无已核实直接文献
`At1g33990`	推定甲基酯酶。	暂无已核实直接文献
`At3g29770`	推定甲基酯酶。	暂无已核实直接文献
`At1g26360`	推定甲基酯酶。	暂无已核实直接文献
`At1g69240`	推定甲基酯酶。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006507 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程

GO:0009696 salicylic acid metabolic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0080030 methyl indole-3-acetate esterase activity 分子功能

GO:0080031 methyl salicylate esterase activity 分子功能

GO:0080032 methyl jasmonate esterase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G26360

ath:AT1G33990

ath:AT1G69240

ath:AT3G29770

ath:AT4G09900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.367

排名 1 · TkA08G131050 · TK1151

细胞膜0.284

排名 2 · TkA08G131050 · TK1151

细胞核0.274

排名 3 · TkA08G131050 · TK1151

内质网0.084

排名 4 · TkA08G131050 · TK1151

质体0.078

排名 5 · TkA08G131050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12146Hydrolase_4102-211 aa

PF12697Abhydrolase_6104-341 aa

PF00561Abhydrolase_1104-210 aa

PF08538DUF1749145-212 aa

PF10230LIDHydrolase149-207 aa

PF06821Ser_hydrolase151-207 aa

PF01764Lipase_3152-186 aa

PF11288DUF3089153-185 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G131050	`PF12146`	Hydrolase_4	102	211	9.8e-09	35.6
TkA08G131050	`PF12697`	Abhydrolase_6	104	341	2.5e-17	64.9
TkA08G131050	`PF00561`	Abhydrolase_1	104	210	1.6e-14	54.9
TkA08G131050	`PF08538`	DUF1749	145	212	0.075	12.9
TkA08G131050	`PF10230`	LIDHydrolase	149	207	5e-05	23.9
TkA08G131050	`PF06821`	Ser_hydrolase	151	207	0.018	15.6
TkA08G131050	`PF01764`	Lipase_3	152	186	0.05	14.2
TkA08G131050	`PF11288`	DUF3089	153	185	0.26	11.5
TkA08G131050	`PF05990`	DUF900	158	196	0.25	11.5
TkA08G131050	`PF07819`	PGAP1	159	193	0.018	15.5
TkA08G131050	`PF05057`	DUF676	161	195	0.097	12.9
TkA08G131050	`PF11187`	Mbeg1-like	162	199	0.017	15.2
TkA08G131050	`PF12695`	Abhydrolase_5	163	202	0.095	13.2
TkA08G131050	`PF02450`	LCAT	165	195	0.016	15.1
TkA08G131050	`PF00561`	Abhydrolase_1	288	340	1.6e-14	54.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q940H7`	拟南芥	sp\|Q940H7\|MES12_ARATH Putative methylesterase 12, chloroplastic	70.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FVW3`	拟南芥	sp\|Q9FVW3\|MES14_ARATH Putative methylesterase 14, chloroplastic	72.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FW03`	拟南芥	sp\|Q9FW03\|MES11_ARATH Putative methylesterase 11, chloroplastic	51.700%	Swiss-Prot	高置信
`F4IE65`	拟南芥	sp\|F4IE65\|MES13_ARATH Putative methylesterase 13, chloroplastic	49.300%	Swiss-Prot	中等置信
`F4I0K9`	拟南芥	sp\|F4I0K9\|MES15_ARATH Putative methylesterase 15, chloroplastic	48.100%	Swiss-Prot	中等置信

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