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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G100020
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 25910050-25914381 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2918 bp · TkA08G100020|TK1151|cDNA

TAGATAAAGCAGTCGGTGCGATTTACACTCGTCTGGATCTACTCCGCTCTTTTGGCCTCTATATTTCCCCATCACATTCTCATTAAATTCCACCAATCCGCGTTCTCTCTGAGTACCACCACTCTCCCTCTCCACCGGGGCTCTGCCATTTTCTTGAAGCCGATGAACCTTAAAGCTTAACATTTCTGTCAGATCTTCAAGAACAATCACAAAGGTTCATACAAAAACAGGATTAAATTTCAGTCATGGCTCAGGGAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2325 bp · TkA08G100020|TK1151|CDS

ATGGCTCAGGGAAAATATTCCCGAGTCGATGGGAAGAAGTCATCGTGTTCCACAGCTACAATTGTGGTTGTTGTCGGTGTTTGTCTAGTTGCAGTATGGATGTTCATGTCATCATCAGCTGCCCCCGGTCAGACTCCCGATCTGCCCGCTGTCACAGATTCAAACCAAAAAGTGTCCGCAAACCCTTCTTCCCAATTTGAAGACAATTCCGGTGACCTACCGGATGATGCAGTGAAAGAAACGACCCAAAATGGAGGCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

774 aa · TkA08G100020|TK1151|PROTEIN

MAQGKYSRVDGKKSSCSTATIVVVVGVCLVAVWMFMSSSAAPGQTPDLPAVTDSNQKVSANPSSQFEDNSGDLPDDAVKETTQNGGDSNSEESNSTTNDVEINTGDDSTPSEEKSTSEESNTNSDSNEGEKSDFGNNSDSNETETSNSGDTDSNSSSNSDSNESGKTDSEEEKTKSDEKIQKEEEKQTEESSSDNKTVDFSAATQSEISKETNTQNGAFSTQAAESASEKEAQTPSSSKSYKWKTCNVTAGPDYIPCLDN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G100020
TK1151 IDTkA08G100020
OH-1004 IDLXL04_031288
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G100020
位置Chr08:25910050-25914381 (-)
描述Similar to At1g29470: Probable methyltransferase PMT24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g64030 可能的甲基转移酶PMT26。 暂无已核实直接文献
At1g29470 可能的甲基转移酶 PMT24。 暂无已核实直接文献
At2g34300 可能的甲基转移酶 PMT25。 暂无已核实直接文献
At3g51070 可能的甲基转移酶 PMT27。 暂无已核实直接文献
At2g40280 可能的甲基转移酶 PMT23。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031288 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005797 Golgi medial cisterna 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G29470
ath:AT2G34300
ath:AT2G40280
ath:AT3G51070
ath:AT5G64030
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.689
排名 1 · TkA08G100020 · TK1151
细胞膜0.116
排名 2 · TkA08G100020 · TK1151
内质网0.080
排名 3 · TkA08G100020 · TK1151
细胞外0.075
排名 4 · TkA08G100020 · TK1151
细胞质0.053
排名 5 · TkA08G100020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19168DUF585021-96 aa
PF19168DUF5850138-184 aa
PF19168DUF5850183-225 aa
PF08242Methyltransf_12220-265 aa
PF03141Methyltransf_29253-757 aa
PF13847Methyltransf_31370-496 aa
PF13649Methyltransf_25371-463 aa
PF08241Methyltransf_11372-466 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G100020PF19168DUF585021960.1313.4
TkA08G100020PF19168DUF58501381840.1313.4
TkA08G100020PF19168DUF58501832250.1313.4
TkA08G100020PF08242Methyltransf_122202650.009617.3
TkA08G100020PF03141Methyltransf_292537572.6e-234779.2
TkA08G100020PF13847Methyltransf_313704961.5e-0732.0
TkA08G100020PF13649Methyltransf_253714631e-0733.3
TkA08G100020PF08241Methyltransf_113724662.7e-1144.7
TkA08G100020PF08242Methyltransf_123724650.009617.3
TkA08G100020PF20922Anamorsin_N4284750.0007719.9
TkA08G100020PF13649Methyltransf_256757171e-0733.3
TkA08G100020PF08242Methyltransf_126787190.009617.3
TkA08G100020PF13847Methyltransf_316827461.5e-0732.0
TkA08G100020PF08241Methyltransf_116837212.7e-1144.7
TkA08G100020PF20922Anamorsin_N7037330.0007719.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7V3拟南芥sp|Q8L7V3|PMTQ_ARATH Probable methyltransferase PMT2674.700%Swiss-Prot高置信
Q6NPR7拟南芥sp|Q6NPR7|PMTO_ARATH Probable methyltransferase PMT2466.800%Swiss-Prot高置信
Q0WT31拟南芥sp|Q0WT31|PMTP_ARATH Probable methyltransferase PMT2564.300%Swiss-Prot高置信
Q9SD39拟南芥sp|Q9SD39|PMTR_ARATH Probable methyltransferase PMT2773.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SIZ3拟南芥sp|Q9SIZ3|PMTN_ARATH Probable methyltransferase PMT2353.800%Swiss-Prot中等置信

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