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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G082720
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 21262526-21265838 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1814 bp · TkA08G082720|TK1151|cDNA

GTCTAGCTAACAGCCTTACCTTCAAACACCATTTACTTATCATCACTTCTGCGGCTGTGTACTCGTGTTCTTCTTCAACACCTACCAGTCCAACTTCTCACTCTCCTTAATCACAAATTCTGCATTTCCTTTCTCTCACTCATCAGTTGTTTCCGATCGTTCATCATCAATCTCGATTTAACTCAACTGGTAAGCACCATTTCTCGAATTTCTACTAATTGTCACGAATCCTAATTTCCTCATTCTGCATGTAACAATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1050 bp · TkA08G082720|TK1151|CDS

ATGGCTTCTTCAATGCTGTATGGAGCTGAGAATCTCGCAATGGTAAGAGGAAGAGTATCCCCAAAAGGATTGGGGTTTAACGGGTCCGATTTGCATGGGAGGAAATCCTTCCCCAAAATCAATTTCGCAAGCGCAAATTCAAAATCGAGAGGCAATTTGAGAGGCATAAGTAAAACCCTAATCGTACCCAAATGCAGTGTGTCTGTACCACGGCCAGCTTCACAGCCTAGATTCATCCAACACAAAAAAGAAGCATTTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

349 aa · TkA08G082720|TK1151|PROTEIN

MASSMLYGAENLAMVRGRVSPKGLGFNGSDLHGRKSFPKINFASANSKSRGNLRGISKTLIVPKCSVSVPRPASQPRFIQHKKEAFWFYRFLSIVYDHVINPGHWTEDMRDEALEPADLYSRNMIVVDVGGGTGFTTLGIVKHVDAKNVTILDQSPHQLAKAKQKEPLKECKIIEGDAEDLPFKTDYADRYISAGSIEYWPDPQRGIKEAYRVLKIGGKACLIGPVYPTYWLSRFFADVWMLFPKEEEYIEWFEKAGFKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G082720
TK1151 IDTkA08G082720
OH-1004 IDLXL04_018780
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 90.415
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G082720
位置Chr08:21262526-21265838 (-)
描述Similar to 2-methyl-6-phytyl-1,4-hydroquinone methyltransferase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g63410 参与生育酚和质体醌合成中的关键甲基化步骤。
Highly divergent methyltransferases catalyze a conserved reaction in tocopherol and plastoquinone synthesis in cyanobacteria and photosynthetic eukaryotes.2003 · DOI: 10.1105/tpc.013656

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0179300 参与生育酚（维生素 E）和质体醌合成中的关键甲基化步骤。 暂无已核实直接文献
Os12g0615400 参与生育酚（维生素 E）和质体醌合成中的关键甲基化步骤。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018780 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009060 aerobic respiration 生物过程
GO:0009234 menaquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0010189 vitamin E biosynthetic process 生物过程
GO:0010236 plastoquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0008425 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methyltransferase activity 分子功能
GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G63410
dosa:Os12g0615400
rhi:NGR_c37130
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.977
排名 1 · TkA08G082720 · TK1151
线粒体0.026
排名 2 · TkA08G082720 · TK1151
细胞膜0.012
排名 3 · TkA08G082720 · TK1151
细胞质0.011
排名 4 · TkA08G082720 · TK1151
细胞核0.011
排名 5 · TkA08G082720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02475TRM5-TYW2_MTfase109-192 aa
PF00891Methyltransf_2111-258 aa
PF00398RrnaAD111-197 aa
PF01728FtsJ112-183 aa
PF02527GidB113-181 aa
PF13489Methyltransf_23121-262 aa
PF13847Methyltransf_31122-226 aa
PF01209Ubie_methyltran123-223 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G082720PF02475TRM5-TYW2_MTfase1091920.01416.0
TkA08G082720PF00891Methyltransf_21112580.0004420.4
TkA08G082720PF00398RrnaAD1111970.002617.6
TkA08G082720PF01728FtsJ1121830.02815.1
TkA08G082720PF02527GidB1131810.0115.9
TkA08G082720PF13489Methyltransf_231212620.000122.7
TkA08G082720PF13847Methyltransf_311222261.2e-1248.5
TkA08G082720PF01209Ubie_methyltran1232231.4e-1454.7
TkA08G082720PF05175MTS1251770.03814.3
TkA08G082720PF13649Methyltransf_251262185.8e-1762.9
TkA08G082720PF08241Methyltransf_111272211.9e-1970.8
TkA08G082720PF08242Methyltransf_121272192.7e-1041.6
TkA08G082720PF05175MTS2052220.03814.3
TkA08G082720PF01209Ubie_methyltran2352651.4e-1454.7
TkA08G082720PF01728FtsJ2432630.02815.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LY74拟南芥sp|Q9LY74|BQMT_ARATH 2-methyl-6-phytyl-1,4-hydroquinone methyltransferase, chloroplastic76.600%Swiss-Prot高置信
Q6ZLD3水稻sp|Q6ZLD3|BQMT1_ORYSJ 2-methyl-6-phytyl-1,4-hydroquinone methyltransferase 1, chloroplastic74.200%Swiss-Prot高置信
Q2QM69水稻sp|Q2QM69|BQMT2_ORYSJ 2-methyl-6-phytyl-1,4-hydroquinone methyltransferase 2, chloroplastic82.800%Swiss-Prot高置信

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