TkA08G080190 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G080190

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 20583002-20587351 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2171 bp · TkA08G080190|TK1151|cDNA

TTGGAAGCGGGGGGTTAAAATCAAGAAGAAGAAAAACGAAGGTATATATACAGATGCAGAGGGCCGAGAATCATTCGAGAAGAATTCTAAGAGAGAGAAACCAACGACCAAAATTGCGTATTACCTCTATACGTATACGAATTTCGCAGCGCCTTTTTTCAATTTCTTCAACCTCCCCATTTCTTCCCTTTTTGCTTCTTCCGATTGATTTTCTTTCGTCAATGCAAGTTTAAGTTTTTCAGAGAATCATATTCTTCGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1590 bp · TkA08G080190|TK1151|CDS

ATGGATTCAGCAAGAAGTTGGCTGCATAAATTTCAACCTAGAGAACGGTTGAGATCAAACACCAGAAGACGAGATTCAAATAGCGATGGCGAAGATTCAAATCACCCAATCATGGACGAAGAAGCCTCAAATATCACAAAACAAAAAGTCGCTGCAGCTAAACAGTACATCGAGAACCATTACAAGGAACAAATGAAGAATTTACAGGAAAGAAGAGAACGGCGAATCTTACTCGAGCAGAAATTAGCCGACGGCGATGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

529 aa · TkA08G080190|TK1151|PROTEIN

MDSARSWLHKFQPRERLRSNTRRRDSNSDGEDSNHPIMDEEASNITKQKVAAAKQYIENHYKEQMKNLQERRERRILLEQKLADGDVSEEDQNNLLRFLEKKETEYMRLQRHKMGVDDFELLTMIGKGAFGEVRICREKTTGTVYAMKKLKKSEMLRRGQVEHVKAERNLLAEVDSNCIVKLYCSFQDNEYLYLIMEYLPGGDMMTLLMRKDTLTENEAQFYVAETVLAIESIHKHNYVHRDIKPDNLLLDKYGHLRLSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G080190`
TK1151 ID	TkA08G080190
OH-1004 ID	LXL04_018736
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 94.633 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA08G080190`
位置	Chr08:20583002-20587351 (-)
描述	Similar to STK38L: Serine/threonine-protein kinase 38-like
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_018736` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000077 DNA damage checkpoint signaling 生物过程 GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0006974 DNA damage response 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0010507 negative regulation of autophagy 生物过程 GO:0010508 positive regulation of autophagy 生物过程 GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程 GO:0036211 protein modification process 生物过程 GO:0043407 negative regulation of MAP kinase activity 生物过程 GO:0051012 microtubule sliding 生物过程 GO:0051128 regulation of cellular component organization 生物过程 GO:0099173 postsynapse organization 生物过程
KEGG 基因交叉引用	dpo:4813412 hsa:11329 hsa:23012 mmu:232533 pon:100173048 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.595

排名 1 · TkA08G080190 · TK1151

细胞核0.474

排名 2 · TkA08G080190 · TK1151

细胞膜0.125

排名 3 · TkA08G080190 · TK1151

线粒体0.048

排名 4 · TkA08G080190 · TK1151

内质网0.034

排名 5 · TkA08G080190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase23-264 aa

PF00069Pkinase43-78 aa

PF00069Pkinase120-271 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr120-267 aa

PF01636APH166-236 aa

PF03109ABC1193-269 aa

PF14531Kinase-like230-262 aa

PF07387Seadorna_VP7230-260 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G080190	`PF12330`	Haspin_kinase	23	264	0.0053	16.6
TkA08G080190	`PF00069`	Pkinase	43	78	1.5e-64	218.6
TkA08G080190	`PF00069`	Pkinase	120	271	1.5e-64	218.6
TkA08G080190	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	120	267	9.4e-30	104.5
TkA08G080190	`PF01636`	APH	166	236	0.0045	17.5
TkA08G080190	`PF03109`	ABC1	193	269	1.8e-06	28.0
TkA08G080190	`PF14531`	Kinase-like	230	262	0.024	14.6
TkA08G080190	`PF07387`	Seadorna_VP7	230	260	0.034	13.9
TkA08G080190	`PF01636`	APH	239	256	0.0045	17.5
TkA08G080190	`PF00069`	Pkinase	314	417	1.5e-64	218.6
TkA08G080190	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	320	382	9.4e-30	104.5
TkA08G080190	`PF14531`	Kinase-like	335	353	0.024	14.6
TkA08G080190	`PF12330`	Haspin_kinase	373	421	0.0053	16.6
TkA08G080190	`PF00433`	Pkinase_C	436	480	3.4e-09	38.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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