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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G067390
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 17302466-17304043 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

954 bp · TkA08G067390|TK1151|cDNA

TCTATCAGCACTTTTACGTTGTTACCGGGTTTTGCGATTTCTCCATTTCTTTTCGGCAAACCCTTCTCTCACTCTCAGCACCACCATGACTGCTCAAACACAAGAAGAACTCCTCGCGGCCCATCTCGAACAACAGAAGATCGATGATCAAGCACCACTGGTCGAAGATGAAGACGACGATGATGAAGACGATGACGATGAAGACGACGTTGAAGGCCAGGGAGATGCAAGCGGTAGATCAAAACAAAGCAGAAGCGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

603 bp · TkA08G067390|TK1151|CDS

ATGACTGCTCAAACACAAGAAGAACTCCTCGCGGCCCATCTCGAACAACAGAAGATCGATGATCAAGCACCACTGGTCGAAGATGAAGACGACGATGATGAAGACGATGACGATGAAGACGACGTTGAAGGCCAGGGAGATGCAAGCGGTAGATCAAAACAAAGCAGAAGCGAGAAAAAAAGTCGTAAGGCTATGTTAAAGCTCGGAATGAAGCCCATTCCTGGAGTCAGCCGTGTTACCGTAAAAAAAAGCAAAAACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

200 aa · TkA08G067390|TK1151|PROTEIN

MTAQTQEELLAAHLEQQKIDDQAPLVEDEDDDDEDDDDEDDVEGQGDASGRSKQSRSEKKSRKAMLKLGMKPIPGVSRVTVKKSKNILFVISKPDVFKSPASDTYVIFGEAKIEDLSSQLQSQAAEQFKAPNLSNVVSSMANEEATGVGHDEEDDVDESGVEPKDIDLVMTQAGVTRSKAVKALKAADGDIVSAIMELTN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G067390
TK1151 IDTkA08G067390
OH-1004 IDLXL04_018546
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G067390
位置Chr08:17302466-17304043 (-)
描述Similar to Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12390 可能促进核糖体-新生多肽复合体的适当定位。 暂无已核实直接文献
At5g13850 可能促进核糖体-新生多肽复合体的适当定位。 暂无已核实直接文献
At4g10480 可能促进核糖体-新生多肽复合体的适当定位。 暂无已核实直接文献
At3g49470 可能促进核糖体-新生多肽复合体的适当定位。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018546 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006612 protein targeting to membrane 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005854 nascent polypeptide-associated complex 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0051082 unfolded protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G12390
ath:AT3G49470
ath:AT4G10480
ath:AT5G13850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.771
排名 1 · TkA08G067390 · TK1151
细胞核0.426
排名 2 · TkA08G067390 · TK1151
内质网0.057
排名 3 · TkA08G067390 · TK1151
细胞膜0.048
排名 4 · TkA08G067390 · TK1151
高尔基体0.044
排名 5 · TkA08G067390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15387DUF46119-56 aa
PF07543PGA213-66 aa
PF27116YjiV_N18-83 aa
PF31277Damicornin22-63 aa
PF23048SH3-A_UBE2O27-63 aa
PF09026CENP-B_dimeris27-74 aa
PF14812PBP1_TM27-63 aa
PF01849NAC58-113 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G067390PF15387DUF46119562.09.3
TkA08G067390PF07543PGA213660.6210.8
TkA08G067390PF27116YjiV_N18831.010.8
TkA08G067390PF31277Damicornin22630.611.1
TkA08G067390PF23048SH3-A_UBE2O27630.01117.2
TkA08G067390PF09026CENP-B_dimeris27740.07314.3
TkA08G067390PF14812PBP1_TM27630.5611.2
TkA08G067390PF01849NAC581131.2e-2486.7
TkA08G067390PF07543PGA21321610.6210.8
TkA08G067390PF15387DUF46111381632.09.3
TkA08G067390PF23048SH3-A_UBE2O1391600.01117.2
TkA08G067390PF27116YjiV_N1441681.010.8
TkA08G067390PF09026CENP-B_dimeris1481600.07314.3
TkA08G067390PF14812PBP1_TM1511600.5611.2
TkA08G067390PF31277Damicornin1531580.611.1
TkA08G067390PF19026UBA_HYPK1611991.2e-1247.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHG9拟南芥sp|Q9LHG9|NACA1_ARATH Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 180.500%Swiss-Prot高置信
Q6ICZ8拟南芥sp|Q6ICZ8|NACA3_ARATH Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 377.500%Swiss-Prot高置信
Q9SZY1拟南芥sp|Q9SZY1|NACA4_ARATH Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 473.300%Swiss-Prot高置信
Q94JX9拟南芥sp|Q94JX9|NACA2_ARATH Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 272.400%Swiss-Prot高置信

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