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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G065490
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 16762900-16782354 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3805 bp · TkA08G065490|TK1151|cDNA

AATCAATCTCATAATATGTTTGGAGCACATATTTTTACATAAACGACAACGATTTAACAATCTTCGATAAGTTATATTTCGTATAAATCAATGATCAATTATTTTTCGTATAAATCAATGATCAATCTTAGAGGTATTACCATTTGGGCCGACCCGTTACTATTAGTCCTAGAAAGCCCTGCTATTTGTTAAATTATCCTCATCCTTAGATGCAATCAGACCTGTGACTCTGTGAGAGAGATGTTCTTTGTGGACCTGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

3228 bp · TkA08G065490|TK1151|CDS

ATGACATTATTGCTGATCTTTGCTCGGCGGGACCTGGCAGTGCAGGTGCTAGTTGAAATGGAAGCCTATCTGACGGAGTTTGATTTGCCGGCGAAACATTGGTCTGAATCGGCGCTGGGCATATGGCGCAACGCCGTCTCTGTAGTCAAAAACCGACACCGACACGATGGCCTTTACAAATTCGAGGAGTGGCACACAACCACTTCCCTTGGTGTAACGCATCGCAGACGCTTCCGTCCTATACCTATACCTGTCCCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1075 aa · TkA08G065490|TK1151|PROTEIN

MTLLLIFARRDLAVQVLVEMEAYLTEFDLPAKHWSESALGIWRNAVSVVKNRHRHDGLYKFEEWHTTTSLGVTHRRRFRPIPIPVPETQSTKPILRHRLMELEENLRIVSLVKNAAFTFLHGASPPKMFHEHHQPRDVNVSEFRKNPDKLASMVHSHDLKTLRSMRGVDGIAEVVNVSTDEGVNSSDISTRQETYGINKYIEKPSKSFLMFVWEALHDLTLIILIVCAMVLISIGLTLTTKGRPYGRIFDGLAILLAILC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G065490
TK1151 IDTkA08G065490
OH-1004 IDLXL04_018506
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.442 / OH-1004 43.840
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G065490
位置Chr08:16762900-16782354 (-)
描述Similar to ACA4: Calcium-transporting ATPase 4, plasma membrane-type
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g41560 这种依赖镁的酶催化 ATP 水解，同时将钙从胞质转运到小液泡中。 暂无已核实直接文献
At3g57330 这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
At4g37640 这种镁依赖性酶催化ATP的水解，同时将钙从胞质转运到内质网。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0136900 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
Os11g0140400 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
Os01g0939100 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018506 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0043069 negative regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0051480 regulation of cytosolic calcium ion concentration 生物过程
GO:0055081 monoatomic anion homeostasis 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41560
ath:AT3G57330
dosa:Os12g0136900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.555
排名 1 · TkA08G065490 · TK1151
内质网0.182
排名 2 · TkA08G065490 · TK1151
溶酶体／液泡0.141
排名 3 · TkA08G065490 · TK1151
细胞质0.125
排名 4 · TkA08G065490 · TK1151
高尔基体0.103
排名 5 · TkA08G065490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12515CaATP_NAI26-54 aa
PF12515CaATP_NAI62-79 aa
PF12515CaATP_NAI108-116 aa
PF00690Cation_ATPase_N166-230 aa
PF09925DUF2157208-265 aa
PF00689Cation_ATPase_C235-235 aa
PF00122E1-E2_ATPase284-383 aa
PF01275Myelin_PLP354-459 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G065490PF12515CaATP_NAI26542.8e-0730.6
TkA08G065490PF12515CaATP_NAI62792.8e-0730.6
TkA08G065490PF12515CaATP_NAI1081162.8e-0730.6
TkA08G065490PF00690Cation_ATPase_N1662301.1e-1248.1
TkA08G065490PF09925DUF21572082652.98.3
TkA08G065490PF00689Cation_ATPase_C2352351.9e-43149.0
TkA08G065490PF00122E1-E2_ATPase2843834.8e-2278.4
TkA08G065490PF01275Myelin_PLP3544597.76.9
TkA08G065490PF09925DUF21574074282.98.3
TkA08G065490PF00689Cation_ATPase_C4084251.9e-43149.0
TkA08G065490PF13246Cation_ATPase5387002.4e-33116.2
TkA08G065490PF08282Hydrolase_36256601.1e-0629.3
TkA08G065490PF00702Hydrolase6858049e-1453.0
TkA08G065490PF12710HAD6988030.009717.0
TkA08G065490PF08282Hydrolase_37027361.1e-0629.3
TkA08G065490PF27097VirB4_TrbE_N7427700.1412.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22218拟南芥sp|O22218|ACA4_ARATH Calcium-transporting ATPase 4, plasma membrane-type67.300%Swiss-Prot高置信
Q9M2L4拟南芥sp|Q9M2L4|ACA11_ARATH Putative calcium-transporting ATPase 11, plasma membrane-type68.300%Swiss-Prot高置信
O81108拟南芥sp|O81108|ACA2_ARATH Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type57.300%Swiss-Prot高置信
Q2QY12水稻sp|Q2QY12|ACA9_ORYSJ Probable calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type64.500%Swiss-Prot高置信
Q2RAS0水稻sp|Q2RAS0|ACA8_ORYSJ Probable calcium-transporting ATPase 8, plasma membrane-type63.800%Swiss-Prot高置信
Q8RUN1水稻sp|Q8RUN1|ACA1_ORYSJ Calcium-transporting ATPase 1, plasma membrane-type63.000%Swiss-Prot高置信

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