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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G061130
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 15660193-15662875 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1894 bp · TkA08G061130|TK1151|cDNA

GTCGTCTTATAAAGTTTTGTCCCTTTGTCCAAACAGAGCATATTTCTCTTTTGGCTTGCGAAAACGTGTGAAGTGTCCGTCAGTTCTCATTTGCGATTTTGGGTTTGTTGGGGTACAGTCCGATACGAACCTGATGGAGTTGGCCAACAGCGTCGGAATCGGAATCGGCATTGATATCGGAACAAATAGTCTCGGCTGCTGACCGACCTCTACTAGGTCCAATCCCTCAATAACCGCGAACAGAATCTTCTTCAGATTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1215 bp · TkA08G061130|TK1151|CDS

ATGACCACCACAGACGTCGAGAACTTTCCAGGTTTTCCAGACGGAATCTCCGGCCCAGACCTAATGGACAGGATGCGATCTCAAGCCTCACGTTGGGGATCAGAGCTTTTCCAAGAAGACGTCGAATCCATCAATCTCACCACCACTCCTTTCACTGTTCAAAGCACCGACCGCACAGTAAAATGCAACAGTATCATAATGGCTACAGGAGCCACCGCCAGAAGACTACACCTACCACGTGAAGAAGAATTCTGGAGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

404 aa · TkA08G061130|TK1151|PROTEIN

MTTTDVENFPGFPDGISGPDLMDRMRSQASRWGSELFQEDVESINLTTTPFTVQSTDRTVKCNSIIMATGATARRLHLPREEEFWSKGISACAICDGASPLFKNQILAVVGGGDTATDEAIYLTKYAQHVHLLVRRDHLRASRSMQDRVVDNPNITVHFNTETVDVVSNSKGQMCGVLTRRVDSGEDSVLEVKGLFYGIGHSPNSQLLVGQVKLDETGYILVEEGTAKSSVEGVFVAGDVQDNEWRQAVTAAGSGCIAAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G061130
TK1151 IDTkA08G061130
OH-1004 IDLXL04_000361
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)79.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 75.818
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G061130
位置Chr08:15660193-15662875 (+)
描述Similar to NTRC: NADPH-dependent thioredoxin reductase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g41680 硫氧还蛋白还原酶 ，同时具有 TR 和硫氧还蛋白 活性。
NADPH-dependent thioredoxin reductase and 2-Cys peroxiredoxins are needed for the protection of Mg-protoporphyrin monomethyl ester cyclase.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2008.07.006
NTRC links built-in thioredoxin to light and sucrose in regulating starch synthesis in chloroplasts and amyloplasts.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0903559106

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0657900 硫氧还蛋白还原酶 (TR)，同时具有 TR 和硫氧还蛋白 (Trx) 活性。 暂无已核实直接文献
Os06g0327300 具有硫氧还蛋白-二硫键还原酶活性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000361 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006909 phagocytosis 生物过程
GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0010581 regulation of starch biosynthetic process 生物过程
GO:0019430 removal of superoxide radicals 生物过程
GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程
GO:0043085 positive regulation of catalytic activity 生物过程
GO:0045454 cell redox homeostasis 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004791 thioredoxin-disulfide reductase (NADPH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41680
cpa:CP_0444
cpj:trxB
cpn:CPn_0314
cpt:CpB0322
ddi:DDB_G0280815
dosa:Os07g0657900
ncr:NCU08352
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.634
排名 1 · TkA08G061130 · TK1151
细胞核0.339
排名 2 · TkA08G061130 · TK1151
线粒体0.181
排名 3 · TkA08G061130 · TK1151
过氧化物酶体0.062
排名 4 · TkA08G061130 · TK1151
细胞膜0.057
排名 5 · TkA08G061130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01134GIDA35-74 aa
PF07992Pyr_redox_237-255 aa
PF13738Pyr_redox_338-238 aa
PF05768Glrx-like91-102 aa
PF00070Pyr_redox107-179 aa
PF29717AF_1314_N109-151 aa
PF07449HyaE124-169 aa
PF01134GIDA135-181 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G061130PF01134GIDA35740.06213.1
TkA08G061130PF07992Pyr_redox_2372554.3e-36125.5
TkA08G061130PF13738Pyr_redox_3382382.3e-1763.9
TkA08G061130PF05768Glrx-like911020.001919.2
TkA08G061130PF00070Pyr_redox1071792e-1351.3
TkA08G061130PF29717AF_1314_N1091510.02315.7
TkA08G061130PF07449HyaE1241690.212.5
TkA08G061130PF01134GIDA1351810.06213.1
TkA08G061130PF13905Thioredoxin_81942510.004818.0
TkA08G061130PF01134GIDA2302660.06213.1
TkA08G061130PF29717AF_1314_N3053660.02315.7
TkA08G061130PF00085Thioredoxin3164011e-1661.5
TkA08G061130PF13098Thioredoxin_23183990.0006820.6
TkA08G061130PF13905Thioredoxin_83193650.004818.0
TkA08G061130PF05768Glrx-like3213650.001919.2
TkA08G061130PF04756OST3_OST63213820.01215.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22229拟南芥sp|O22229|TRXB3_ARATH NADPH-dependent thioredoxin reductase 379.200%Swiss-Prot高置信
Q70G58水稻sp|Q70G58|NTRC_ORYSJ Thioredoxin reductase NTRC78.000%Swiss-Prot高置信
Q69PS6水稻sp|Q69PS6|NTRA_ORYSJ Thioredoxin reductase NTRA52.300%Swiss-Prot中等置信

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