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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA08G051670
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 13187852-13189185 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

987 bp · TkA08G051670|TK1151|cDNA

ATGGCCATTCAAGGTCACTCCGGTCCAGGTGAGAAGCCATTGATTGCCGTAAACTACAAAGGCGAGGAAAAACAATTTGCTGCAGAAGAAATCTCCTCCATGGTTCTCATCAAAATGAAGGAAATTGCCGAAGCTTTTCTCGGATCAACGGTCAAAAACGCCGTGGTCACCGTCCCTGCTTATTTCAACGATTCTCAAAGACAAGCCACAAAGGACGCCGAATTCAAAAGAAAAAAAAAAAAGGACATCACCGGCAACCC...

987 bp · TkA08G051670|TK1151|CDS

ATGGCCATTCAAGGTCACTCCGGTCCAGGTGAGAAGCCATTGATTGCCGTAAACTACAAAGGCGAGGAAAAACAATTTGCTGCAGAAGAAATCTCCTCCATGGTTCTCATCAAAATGAAGGAAATTGCCGAAGCTTTTCTCGGATCAACGGTCAAAAACGCCGTGGTCACCGTCCCTGCTTATTTCAACGATTCTCAAAGACAAGCCACAAAGGACGCCGAATTCAAAAGAAAAAAAAAAAAGGACATCACCGGCAACCC...

328 aa · TkA08G051670|TK1151|PROTEIN

MAIQGHSGPGEKPLIAVNYKGEEKQFAAEEISSMVLIKMKEIAEAFLGSTVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAEFKRKKKKDITGNPRALRRLRTSCERAKRKLNMDLFRKCMEPVEKCLRDAKMDKATVHEVVLVGGSTRIPKVQQLLQDFFNGKELCKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGEGNEKVQDLLLLDVTPLSQGLETAGGVMTVLIPRNTTIPTKKEQVFSTYSDNQPGVLIQVYEGERTRTRDNNLLGKFEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G051670
TK1151 IDTkA08G051670
OH-1004 IDLXL04_017766
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)66.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.805 / OH-1004 59.527
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G051670
位置Chr08:13187852-13189185 (+)
描述Similar to HSP70: Heat shock cognate 70 kDa protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017766 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009266 response to temperature stimulus 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G12580
ath:AT5G02500
sly:101247772
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.571
排名 1 · TkA08G051670 · TK1151
细胞核0.326
排名 2 · TkA08G051670 · TK1151
线粒体0.131
排名 3 · TkA08G051670 · TK1151
细胞膜0.120
排名 4 · TkA08G051670 · TK1151
内质网0.102
排名 5 · TkA08G051670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012HSP709-73 aa
PF00012HSP7074-104 aa
PF07318DUF146499-189 aa
PF00012HSP70103-300 aa
PF02782FGGY_C110-178 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G051670PF00012HSP709738.6e-114381.6
TkA08G051670PF00012HSP70741048.6e-114381.6
TkA08G051670PF07318DUF1464991890.1212.2
TkA08G051670PF00012HSP701033008.6e-114381.6
TkA08G051670PF02782FGGY_C1101780.002718.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHA8拟南芥sp|Q9LHA8|HS704_ARATH Heat shock 70 kDa protein 467.600%Swiss-Prot高置信
P22953拟南芥sp|P22953|HS701_ARATH Heat shock 70 kDa protein 166.600%Swiss-Prot高置信

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