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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G044320
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 11295905-11298658 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1787 bp · TkA08G044320|TK1151|cDNA

AGTACGGCTTATCTCTAAACAAACTAAACACCCTCTCTACACACACCACACAACACACACAACAACATACACCATGGCGCCTGGCGTAATCAACGGTGGGAGTAGCTCCGGTGGCACCGGTGAGCACTTACCAGCCAAGCTCACCTTGCAAGTGCTTGTATGCTCCATCATTGCTGCCTTCGGTGGCCTCATGTTTGGTTATGACATCGGAATTTCAGGAGGTGTGACATCTATGGACGTGTTCTTGGAGAAGTTTTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1536 bp · TkA08G044320|TK1151|CDS

ATGGCGCCTGGCGTAATCAACGGTGGGAGTAGCTCCGGTGGCACCGGTGAGCACTTACCAGCCAAGCTCACCTTGCAAGTGCTTGTATGCTCCATCATTGCTGCCTTCGGTGGCCTCATGTTTGGTTATGACATCGGAATTTCAGGAGGTGTGACATCTATGGACGTGTTCTTGGAGAAGTTTTTTCCACATGTATACGTAAAAAAGCACCATGCAAGAGAAGATAATTACTGTAAATTCGATGATCAATTCCTCCAGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

511 aa · TkA08G044320|TK1151|PROTEIN

MAPGVINGGSSSGGTGEHLPAKLTLQVLVCSIIAAFGGLMFGYDIGISGGVTSMDVFLEKFFPHVYVKKHHAREDNYCKFDDQFLQLFTSSLYLAAVVCSLFASKCCKRFGRKVTIQLASLFFLGGVVLTACAVNLAMLIFGRLFLGAGVGFGNQAVPLFISEIAPAKYRGGLNVCFQLLVTVGILCASVVNYFTSTHPFGWRISLGGAAIPALFLAVGSLLIVETPTSLIERGQPEEGMRTLRKIRGVQDVQKEYDEIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G044320
TK1151 IDTkA08G044320
OH-1004 IDLXL04_017871
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G044320
位置Chr08:11295905-11298658 (+)
描述Similar to STP8: Sugar transport protein 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g26250 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。 暂无已核实直接文献
At3g05960 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。
AtSTP6, a new pollen-specific H+-monosaccharide symporter from Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1104/pp.012666
At1g07340 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。
A male gametophyte-specific monosaccharide transporter in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00372.x
At5g26340 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0218400 介导通过糖:质子共转运的果糖主动摄取（可能）。
Molecular cloning and expression analysis of a monosaccharide transporter gene OsMST4 from rice (Oryza sativa L.).2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9228-x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017871 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0015749 monosaccharide transmembrane transport 生物过程
GO:0034219 carbohydrate transmembrane transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07340
ath:AT3G05960
ath:AT5G26250
ath:AT5G26340
dosa:Os03g0218400
osa:4332079
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.848
排名 1 · TkA08G044320 · TK1151
细胞质0.114
排名 2 · TkA08G044320 · TK1151
内质网0.043
排名 3 · TkA08G044320 · TK1151
线粒体0.037
排名 4 · TkA08G044320 · TK1151
溶酶体／液泡0.031
排名 5 · TkA08G044320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11772EpuA26-65 aa
PF00083Sugar_tr31-485 aa
PF07690MFS_180-437 aa
PF13190PDGLE94-105 aa
PF11772EpuA138-153 aa
PF13190PDGLE180-203 aa
PF13190PDGLE316-346 aa
PF07690MFS_1433-473 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G044320PF11772EpuA26651.69.2
TkA08G044320PF00083Sugar_tr314851.1e-115387.9
TkA08G044320PF07690MFS_1804372.6e-2383.3
TkA08G044320PF13190PDGLE941052.58.7
TkA08G044320PF11772EpuA1381531.69.2
TkA08G044320PF13190PDGLE1802032.58.7
TkA08G044320PF13190PDGLE3163462.58.7
TkA08G044320PF07690MFS_14334732.6e-2383.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SBA7拟南芥sp|Q9SBA7|STP8_ARATH Sugar transport protein 866.300%Swiss-Prot高置信
Q9SFG0拟南芥sp|Q9SFG0|STP6_ARATH Sugar transport protein 666.300%Swiss-Prot高置信
Q9LNV3拟南芥sp|Q9LNV3|STP2_ARATH Sugar transport protein 261.800%Swiss-Prot高置信
Q94AZ2拟南芥sp|Q94AZ2|STP13_ARATH Sugar transport protein 1356.900%Swiss-Prot高置信
Q10PW9水稻sp|Q10PW9|MST4_ORYSJ Sugar transport protein MST459.200%Swiss-Prot高置信

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