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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G041480
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 10558609-10564660 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3789 bp · TkA08G041480|TK1151|cDNA

TAGTTCAAAAATTATACTATTAAAAAATTAAACTCGATACAGAAATGGGTCTCCTTTCATCTCTTATCCTGAAAAAGCTGTCAGCCGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAAAAGTTAACGAGAGGAGGGGAAAACAATAGCTGTAAAATTGTGCAGGGTTTTATAACACAGTTGCAGCTATAGGCTTGGCACTATACTGTGTGTACTATTTCATTTCTTGACTTTATCTTCTCCAATCCCTTCCCTACCCTCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

2943 bp · TkA08G041480|TK1151|CDS

ATGGCGTCTTTGAGAATGATGGGGGTTCTGTCGTTTCTTCTGGTTTTTTCAAGCTTCTTCGTCCTCTTCGTTAACTCCGATGACGGGGGGACATTGTTGGAGATAAAAAAGTCGTTTAGAGATGTGAATAATGTGCTTTATGACTGGACTGCTTCACCTTCTTCCGACTACTGTTCATGGCGAGGTGTTTCTTGTGATAATGTCACCTTCAATGTCGTTGCCCTTAATCTTTCAGGCTTGAATCTTGATGGGGAACTGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

980 aa · TkA08G041480|TK1151|PROTEIN

MASLRMMGVLSFLLVFSSFFVLFVNSDDGGTLLEIKKSFRDVNNVLYDWTASPSSDYCSWRGVSCDNVTFNVVALNLSGLNLDGELSPSIGELKGLLSIDLRANRLSGQIPDEIGDCSALTNLDLSFNMLTGDIPFSISKLKQLELLILKNNQLIGPIPSTLSQIPNLKILDLAQNRLNGEIPRLIYWNEVLQYLGLRSNNLVGEISPDVCQLTGLWYFDVRNNSLTGTIPSNIGNCTGFQVLDLSYNQLTGEIPFNIGF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G041480
TK1151 IDTkA08G041480
OH-1004 IDLXL04_017905
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G041480
位置Chr08:10558609-10564660 (-)
描述Similar to ERECTA: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26330 可能作为受体激酶，与 ERL1 和 ERL2 共同调节地上部株型及气孔分布。
KNAT1 and ERECTA regulate inflorescence architecture in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.010391
Novel as1 and as2 defects in leaf adaxial-abaxial polarity reveal the requirement for ASYMMETRIC LEAVES1 and 2 and ERECTA functions in specifying leaf adaxial identity.2003 · DOI: 10.1242/dev.00622
ERECTA, an LRR receptor-like kinase protein controlling development pleiotropically affects resistance to bacterial wilt.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01877.x
Synergistic interaction of three ERECTA-family receptor-like kinases controls Arabidopsis organ growth and flower development by promoting cell proliferation.2004 · DOI: 10.1242/dev.01028
ERECTA is required for protection against heat-stress in the AS1/ AS2 pathway to regulate adaxial-abaxial leaf polarity in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1248-z
ERECTA receptor-like kinase and heterotrimeric G protein from Arabidopsis are required for resistance to the necrotrophic fungus Plectosphaerella cucumerina.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02440.x
The ERECTA gene regulates plant transpiration efficiency in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1038/nature03835
Pedicel development in Arabidopsis thaliana: contribution of vascular positioning and the role of the BREVIPEDICELLUS and ERECTA genes.2005 · DOI: 10.1016/j.ydbio.2005.06.011
Interaction of auxin and ERECTA in elaborating Arabidopsis inflorescence architecture revealed by the activation tagging of a new member of the YUCCA family putative flavin monooxygenases.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.063495
ABA is an essential signal for plant resistance to pathogens affecting JA biosynthesis and the activation of defenses in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048041
Haploinsufficiency after successive loss of signaling reveals a role for ERECTA-family genes in Arabidopsis ovule development.2007 · DOI: 10.1242/dev.004788
Genetics of microenvironmental canalization in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0701936104
A strong effect of growth medium and organ type on the identification of QTLs for phytate and mineral concentrations in three Arabidopsis thaliana RIL populations.2009 · DOI: 10.1093/jxb/erp084
Polymorphic genes of major effect: consequences for variation, selection and evolution in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1534/genetics.108.097030
The ERECTA Receptor-Like Kinase Regulates Cell Wall-Mediated Resistance to Pathogens in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1094/mpmi-22-8-0953
Direct interaction of ligand-receptor pairs specifying stomatal patterning.2012 · DOI: 10.1101/gad.179895.111
Regulation of inflorescence architecture by intertissue layer ligand-receptor communication between endodermis and phloem.2012 · DOI: 10.1073/pnas.1117537109
Regulation of plant vascular stem cells by endodermis-derived EPFL-family peptide hormones and phloem-expressed ERECTA-family receptor kinases.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert196
A receptor-like protein acts as a specificity switch for the regulation of stomatal development.2017 · DOI: 10.1101/gad.297580.117
The Arabidopsis ERECTA gene encodes a putative receptor protein kinase with extracellular leucine-rich repeats.1996 · DOI: 10.1105/tpc.8.4.735
At5g62230 受体激酶，与 ER 和 ERL2 一起调节花序结构和器官形状以及气孔图案，包括密度和聚类。
Synergistic interaction of three ERECTA-family receptor-like kinases controls Arabidopsis organ growth and flower development by promoting cell proliferation.2004 · DOI: 10.1242/dev.01028
Haploinsufficiency after successive loss of signaling reveals a role for ERECTA-family genes in Arabidopsis ovule development.2007 · DOI: 10.1242/dev.004788
Direct interaction of ligand-receptor pairs specifying stomatal patterning.2012 · DOI: 10.1101/gad.179895.111
Regulation of plant vascular stem cells by endodermis-derived EPFL-family peptide hormones and phloem-expressed ERECTA-family receptor kinases.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert196
A receptor-like protein acts as a specificity switch for the regulation of stomatal development.2017 · DOI: 10.1101/gad.297580.117

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0203800 参与调节耐热性的受体激酶。 暂无已核实直接文献
Os02g0777400 可能参与细胞增殖和细胞生长调控的受体激酶。 暂无已核实直接文献
Os06g0130100 参与盐碱干旱应激反应的受体激酶。
Receptor-like kinase OsSIK1 improves drought and salt stress tolerance in rice (Oryza sativa) plants.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04146.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017905 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001558 regulation of cell growth 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程
GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程
GO:0010148 transpiration 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0030155 regulation of cell adhesion 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26330
ath:AT5G62230
dosa:Os02g0777400
dosa:Os06g0130100
dosa:Os06g0203800
osa:4340000
osa:4340427
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · TkA08G041480 · TK1151
内质网0.084
排名 2 · TkA08G041480 · TK1151
细胞质0.067
排名 3 · TkA08G041480 · TK1151
细胞核0.046
排名 4 · TkA08G041480 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA08G041480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_226-66 aa
PF29594LRR_SKP265-80 aa
PF00560LRR_173-93 aa
PF12799LRR_475-108 aa
PF24141LRR_ComC87-153 aa
PF23598LRR_1488-173 aa
PF13855LRR_890-130 aa
PF00560LRR_196-117 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G041480PF08263LRRNT_226662e-1144.7
TkA08G041480PF29594LRR_SKP265800.001618.4
TkA08G041480PF00560LRR_173933.5e-52163.7
TkA08G041480PF12799LRR_4751082.2e-2898.3
TkA08G041480PF24141LRR_ComC871532e-0835.0
TkA08G041480PF23598LRR_14881739.3e-2794.4
TkA08G041480PF13855LRR_8901303.4e-40136.3
TkA08G041480PF00560LRR_1961173.5e-52163.7
TkA08G041480PF29594LRR_SKP21141720.001618.4
TkA08G041480PF25013LRR_Zer-11181780.001519.4
TkA08G041480PF13855LRR_81191783.4e-40136.3
TkA08G041480PF00560LRR_11201413.5e-52163.7
TkA08G041480PF12799LRR_41201582.2e-2898.3
TkA08G041480PF24141LRR_ComC1202122e-0835.0
TkA08G041480PF13516LRR_61201310.006517.1
TkA08G041480PF00560LRR_11431643.5e-52163.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42371拟南芥sp|Q42371|ERECT_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA85.100%Swiss-Prot高置信
C0LGW6拟南芥sp|C0LGW6|ERL1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERL162.100%Swiss-Prot低置信
Q69SP5水稻sp|Q69SP5|EREC1_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER174.800%Swiss-Prot低置信
I1Z695水稻sp|I1Z695|EREC2_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER272.200%Swiss-Prot低置信
Q658G7水稻sp|Q658G7|SIK1_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase SIK163.000%Swiss-Prot低置信

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