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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G030970
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 7896395-7904109 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1168 bp · TkA08G030970|TK1151|cDNA

CACATCTCCCGATTACAGATCCTGAAGAATCAATTTGGAAAACTTGGTGAATTCCCGTCAGAGGAGATCGGGACGAACACCTTCTCACCTCCTTCTATCTTGAAATCCTACTCGGAGAATATCATCCCTTTCTCCATCAATCCTCGGAACCCATCAGAATTATCTCTAGGCAGATTCTCCGCTTCAAAGATTGAAATCATTTTGTTTTTTTGGACGGAAGATTTGGGATTCTGCCTTTGAAAGCGAAACGATCTGATCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2115 bp · TkA08G030970|TK1151|CDS

ATGACAAATATGAAAGCTGGAAAGTTCTTGCTGTTATTTCTCTGCTTCAATGTGATCTCTAACACAGTGATCTGCGAACCACATACATGCCCCGCTAATCTTGATGGCGATTGTGGTTTGGAAAGTTCGTCAGAATGGGAAGGGGAATTTTTCCCTGGTATTCCCAAAATTAAGTACGAGGGACCCACAAGCAAGAATCCACTTGCATTCAAATGGTACAATGCCAATGAAGAGATTCTCGGCAAGAATATGAAGGATTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

704 aa · TkA08G030970|TK1151|PROTEIN

MTNMKAGKFLLLFLCFNVISNTVICEPHTCPANLDGDCGLESSSEWEGEFFPGIPKIKYEGPTSKNPLAFKWYNANEEILGKNMKDWMRFSVAFWHTFRGTGGDPFGAATKMWPWEDGTNSLNMAKRRMRANFEFLEKLGVDRWCFHDRDIAPDGKTLEESNANLDEIVALAKELQGTKIRPLWGTAQLFLHPRYMHGGATSSEIGVYAYAAAQVKKAIEVTHYLGGENYVFWGGREGYQTLLNTDMERELVHMARFFEA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G030970
TK1151 IDTkA08G030970
OH-1004 IDLXL04_023734
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 36.080 / OH-1004 98.885
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G030970
位置Chr08:7896395-7904109 (-)
描述Similar to XYLA: Xylose isomerase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57655 木糖异构酶。 暂无已核实直接文献
At2g24765 参与蛋白质运输的GTP结合蛋白；可能调节高尔基体内囊泡的出芽和脱壳。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023734 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042732 D-xylose metabolic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0099503 secretory vesicle 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0009045 xylose isomerase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ate:Athe_0603
ath:AT5G57655
tex:Teth514_0153
tpd:Teth39_2060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.268
排名 1 · TkA08G030970 · TK1151
细胞质0.221
排名 2 · TkA08G030970 · TK1151
高尔基体0.140
排名 3 · TkA08G030970 · TK1151
质体0.133
排名 4 · TkA08G030970 · TK1151
溶酶体／液泡0.105
排名 5 · TkA08G030970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01261AP_endonuc_2137-327 aa
PF27526XylA2_C154-175 aa
PF27526XylA2_C420-465 aa
PF00025Arf528-698 aa
PF00503G-alpha538-561 aa
PF09439SRPRB538-673 aa
PF08477Roc541-651 aa
PF00071Ras541-691 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G030970PF01261AP_endonuc_21373271.2e-0629.2
TkA08G030970PF27526XylA2_C1541758.8e-1142.6
TkA08G030970PF27526XylA2_C4204658.8e-1142.6
TkA08G030970PF00025Arf5286981.5e-77259.7
TkA08G030970PF00503G-alpha5385611.8e-1144.5
TkA08G030970PF09439SRPRB5386738.1e-1142.3
TkA08G030970PF08477Roc5416519e-1349.2
TkA08G030970PF00071Ras5416918.5e-1039.2
TkA08G030970PF04670Gtr1_RagA5416526.6e-0833.0
TkA08G030970PF01926MMR_HSR15416450.0004221.1
TkA08G030970PF02421FeoB_N5415990.1112.7
TkA08G030970PF00503G-alpha5676521.8e-1144.5
TkA08G030970PF17234MPM15876340.3311.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKK7拟南芥sp|Q9FKK7|XYLA_ARATH Xylose isomerase79.500%Swiss-Prot中等置信
P40940拟南芥sp|P40940|ARF3_ARATH ADP-ribosylation factor 391.200%Swiss-Prot高置信

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