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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G026810
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 6929905-6937650 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5746 bp · TkA08G026810|TK1151|cDNA

AAAACAAAAACCCACCGCATTAGGAAACGACGAAATAGTTACAGGAAACCACGAATTGCCCCTTCGGTAACAGTAAAAATAGTCGAAATTACACACACATAGACACATAGTCGCATACACATGCATATAAATCATCAAGGCTTCTCGAGTAAATCTTCTGTTCTTCCAATACTTGATTGTGGATGTGGAGGAAGAACAGAAAAGATACAGAAAAGATCAAAATTTTTCTTTCTATGTGTTGTGCCTTGTGGGTTACTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3114 bp · TkA08G026810|TK1151|CDS

ATGAGTTCTAGTGGCGGTGGCTCAGAGGGCGTTATACAAAGGGGAAAGCTTATAGTTCACATAGCCGAAAATGGCCATTCTTTTGATCTCAATTGTGACGAATATACCCTTGTTGAAGCTGTTCAAAGGTACCTGGAATCACTTTCAGGGATACCCTTAAACGACCAACTTCTTCTCTATCTGGACATGAAATTAGAACCCCAACAACCGCTTTCTGTATACAAACTCCCTTCAGATGATCGCGAAGTGTTCTTATTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1037 aa · TkA08G026810|TK1151|PROTEIN

MSSSGGGSEGVIQRGKLIVHIAENGHSFDLNCDEYTLVEAVQRYLESLSGIPLNDQLLLYLDMKLEPQQPLSVYKLPSDDREVFLFNRAKMRTNSTPPQPVDLQPPDHIHPDPPKPSSSSHEPHPLDEASDPALKALPSYEIQFRYHYQLGDSIYRRTLSKYEACERLSREQRVQEKALEIARGNLDHIYKMILHNYSDFVKRYSHQQRAHTNLLVNFWKDLERLRNIKLVPALQSDNRKCLSDFVKEENLRKMVEDCGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G026810
TK1151 IDTkA08G026810
OH-1004 IDLXL04_018100
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G026810
位置Chr08:6929905-6937650 (+)
描述Similar to ATG11: Autophagy-related protein 11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30790 参与自噬的辅助蛋白。
AUTOPHAGY-RELATED11 plays a critical role in general autophagy- and senescence-induced mitophagy in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.120014

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018100 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0000422 autophagy of mitochondrion 生物过程
GO:0000425 pexophagy 生物过程
GO:0006914 autophagy 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0034517 ribophagy 生物过程
GO:0034727 piecemeal microautophagy of the nucleus 生物过程
GO:0061709 reticulophagy 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005776 autophagosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G30790
mgr:MGG_04486
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.588
排名 1 · TkA08G026810 · TK1151
细胞核0.220
排名 2 · TkA08G026810 · TK1151
高尔基体0.205
排名 3 · TkA08G026810 · TK1151
细胞膜0.171
排名 4 · TkA08G026810 · TK1151
溶酶体／液泡0.126
排名 5 · TkA08G026810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00240ubiquitin23-79 aa
PF12179IKKbetaNEMObind37-49 aa
PF04108ATG17_like157-487 aa
PF29964NEJ1_C235-273 aa
PF10377ATG11302-329 aa
PF12179IKKbetaNEMObind302-317 aa
PF10377ATG11376-407 aa
PF29964NEJ1_C600-645 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G026810PF00240ubiquitin23790.01515.8
TkA08G026810PF12179IKKbetaNEMObind37499.66.8
TkA08G026810PF04108ATG17_like1574879.6e-2898.4
TkA08G026810PF29964NEJ1_C2352730.5510.6
TkA08G026810PF10377ATG113023294.6e-2382.5
TkA08G026810PF12179IKKbetaNEMObind3023179.66.8
TkA08G026810PF10377ATG113764074.6e-2382.5
TkA08G026810PF29964NEJ1_C6006450.5510.6
TkA08G026810PF12179IKKbetaNEMObind6186289.66.8
TkA08G026810PF12179IKKbetaNEMObind7417579.66.8
TkA08G026810PF12179IKKbetaNEMObind7768009.66.8
TkA08G026810PF04108ATG17_like8109179.6e-2898.4
TkA08G026810PF10377ATG1188810234.6e-2382.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUG7拟南芥sp|Q9SUG7|ATG11_ARATH Autophagy-related protein 1153.300%Swiss-Prot高置信

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