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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G025890
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 6616593-6624910 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1435 bp · TkA08G025890|TK1151|cDNA

CTAGAATCTCTAGTAGTTAGCTGGGCTTCTGAATTATATGTTGCATTTACCCAAAGGACAAAGACTTTCACTCTTACCAAAGAGTCCCACCAAAATTCCATTTTCTCACTGCTTATCTACTTGATCACACATACGCACTCGATTCCCAAATTCCGCCATGGATGATGACAGCGATCGGAGCTCTGAAGCAACTCAACTGGAAGGACATTCAACAGCGGAGGATACGACGATGCACCCTCATTTCGACGATGGCGCTACTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1059 bp · TkA08G025890|TK1151|CDS

ATGGATGATGACAGCGATCGGAGCTCTGAAGCAACTCAACTGGAAGGACATTCAACAGCGGAGGATACGACGATGCACCCTCATTTCGACGATGGCGCTACTCCATTACATACTTCTCCTACGTCACCCGAGGAAGATTCAACTACTTCCCAACCTTTAACCCTAGTAGTATCCGATTTATCAGACGTACCGGTAAAATACGAGATGCAACGCGATGAGTTGGAGCGCTTGAAGAATCAGCTTCAAGGGAGTCACCAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

352 aa · TkA08G025890|TK1151|PROTEIN

MDDDSDRSSEATQLEGHSTAEDTTMHPHFDDGATPLHTSPTSPEEDSTTSQPLTLVVSDLSDVPVKYEMQRDELERLKNQLQGSHQEALATVIAQAARSQISSLKCSNPQAQNHSQKNTTDYPKSSSPSHHVKIPTDGYNWRKYGQKQVKSPQGSRSYYKCTSTECDAKKIESCDQNNYVTKVVYKGHHKHDPPKKVFSGGKILSSPKSLKRKPISTPPLKEHRLCDQRVKNSVPKKPKFIVHAADDVGISADGYRWRKY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G025890
TK1151 IDTkA08G025890
OH-1004 IDLXL04_018125
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G025890
位置Chr08:6616593-6624910 (+)
描述Similar to WRKY32: Probable WRKY transcription factor 32
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30935 转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g13960 特异性结合W盒（5′-(T)TGAC[CT]-3′）的转录因子；W盒是一类常见的激发子应答顺式作用元件。
Roles of Arabidopsis WRKY3 and WRKY4 transcription factors in plant responses to pathogens.2008 · DOI: 10.1186/1471-2229-8-68
Structural basis for sequence-specific DNA recognition by an Arabidopsis WRKY transcription factor.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.279844
At5g07100 转录因子。
Arabidopsis thaliana WRKY25, WRKY26, and WRKY33 coordinate induction of plant thermotolerance.2011 · DOI: 10.1007/s00425-011-1375-2
At3g01080 转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0826400 可能参与脱落酸和赤霉素信号的转录调控。
Annotations and functional analyses of the rice WRKY gene superfamily reveal positive and negative regulators of abscisic acid signaling in aleurone cells.2005 · DOI: 10.1104/pp.104.054312
A negative regulator encoded by a rice WRKY gene represses both abscisic acid and gibberellins signaling in aleurone cells.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9463-4
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018125 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0070370 cellular heat acclimation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G30935
ath:AT5G07100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.936
排名 1 · TkA08G025890 · TK1151
细胞质0.168
排名 2 · TkA08G025890 · TK1151
线粒体0.024
排名 3 · TkA08G025890 · TK1151
细胞膜0.018
排名 4 · TkA08G025890 · TK1151
内质网0.007
排名 5 · TkA08G025890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19677DUF617966-121 aa
PF21524SAMD1_WH70-92 aa
PF11776RcnB129-147 aa
PF03106WRKY137-192 aa
PF07828PA-IL140-160 aa
PF23549Zn_ribbon_GRF_2154-167 aa
PF21524SAMD1_WH159-188 aa
PF07828PA-IL239-278 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G025890PF19677DUF6179661210.01415.3
TkA08G025890PF21524SAMD1_WH70920.05614.3
TkA08G025890PF11776RcnB1291470.1712.5
TkA08G025890PF03106WRKY1371922.2e-41140.6
TkA08G025890PF07828PA-IL1401600.2312.2
TkA08G025890PF23549Zn_ribbon_GRF_21541670.9810.0
TkA08G025890PF21524SAMD1_WH1591880.05614.3
TkA08G025890PF07828PA-IL2392780.2312.2
TkA08G025890PF03106WRKY2533092.2e-41140.6
TkA08G025890PF11776RcnB2532650.1712.5
TkA08G025890PF23549Zn_ribbon_GRF_22722800.9810.0
TkA08G025890PF21524SAMD1_WH2843040.05614.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P59583拟南芥sp|P59583|WRK32_ARATH Probable WRKY transcription factor 3245.600%Swiss-Prot中等置信
Q9XI90拟南芥sp|Q9XI90|WRKY4_ARATH Probable WRKY transcription factor 432.500%Swiss-Prot中等置信
Q9C5T3拟南芥sp|Q9C5T3|WRK26_ARATH Probable WRKY transcription factor 2643.600%Swiss-Prot中等置信
Q93WU7拟南芥sp|Q93WU7|WRK58_ARATH Probable WRKY transcription factor 5836.700%Swiss-Prot中等置信
Q6IEQ7水稻sp|Q6IEQ7|WRK24_ORYSJ WRKY transcription factor WRKY2435.200%Swiss-Prot中等置信

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