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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G410810
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 103746447-103748504 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1615 bp · TkA07G410810|TK1151|cDNA

TATAAAATAAATAATTATGTGTTATAATTATGATTAGTGATTAACCCCACAAATAAACACACCTCATTACTATAATTTAATTTCACCTACAAAAGTTGATCAATCGGCATGGTTGTGTGAATTTTAGTCGATCTACAATCAGCTCCAAATCTCCCATGATCTGTAATTACGTCGACAGACGGAAACTAACGAACCTTTTGATCTCGATCAGTAGACGTGGTAAGATTCAATCTTTTCTGAGAGCATAACAGAAAAAAGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1056 bp · TkA07G410810|TK1151|CDS

ATGGGGTGTTCTTTTTCGGGATTAAACGCCCTATACGACGCTGTTAACGGAGGCGCCGATGTTTGGATCAACGACAACCGCTTCAAAATCGTCCGTCAGCTCGGCGAGGGTGGTTTTGCCTATGTATTCCTTGTTAGGGAGGCCATCACCGATGATTCCGCCGGTGGCGTCTCGAAGAAATTCAAAGACCCCTCACACATCTCCGACGATGGAACTTATGCGATGAAGAAAGTTCTGATTCAGAATAGCGATCAGCTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

351 aa · TkA07G410810|TK1151|PROTEIN

MGCSFSGLNALYDAVNGGADVWINDNRFKIVRQLGEGGFAYVFLVREAITDDSAGGVSKKFKDPSHISDDGTYAMKKVLIQNSDQLELVKEEIRVSALFSHPNLLPLLDHAIIPVKRSCSVLQSTSEQPWTHEAYLLFPVHLDGTLLDNATTMKSKKLFYSTSDVLHIFRQLCAGLKHLHTLTPPFAHNDVKPGNVLLTHRKGQPPLAILMDFGSARPARRQIRSRSEALQLQEWASEHVSAPFRAPELWDCPSQTDIDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G410810
TK1151 IDTkA07G410810
OH-1004 IDLXL04_030551
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G410810
位置Chr07:103746447-103748504 (-)
描述Similar to Stk16: Serine/threonine-protein kinase 16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030551 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006624 vacuolar protein processing 生物过程
GO:0023052 signaling 生物过程
GO:0032889 regulation of vacuole fusion, non-autophagic 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0071560 cellular response to transforming growth factor beta stimulus 生物过程
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ddi:DDB_G0280111
hsa:8576
mmu:20872
rno:286927
spo:2543440
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.657
排名 1 · TkA07G410810 · TK1151
细胞核0.385
排名 2 · TkA07G410810 · TK1151
高尔基体0.073
排名 3 · TkA07G410810 · TK1151
内质网0.071
排名 4 · TkA07G410810 · TK1151
细胞膜0.069
排名 5 · TkA07G410810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr30-283 aa
PF00069Pkinase66-341 aa
PF03109ABC1143-225 aa
PF01636APH182-218 aa
PF01636APH216-251 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G410810PF07714PK_Tyr_Ser-Thr302832.1e-1144.3
TkA07G410810PF00069Pkinase663415.8e-29102.0
TkA07G410810PF03109ABC11432250.02414.5
TkA07G410810PF01636APH1822180.1412.6
TkA07G410810PF01636APH2162510.1412.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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