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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G394760
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 99154770-99158966 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1827 bp · TkA07G394760|TK1151|cDNA

ATGGGGAAACGGCAGATCTTGTGTCTCATTTGTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCACTTTACATCGTGCAGCAAATTCTACTTCCTGTTCTACAGATTTCAGCTATGTCACCACCTTCCCATGGGACAACTCAGCCTGCCGGACCGCCACCACCAACGGCACCGCCACCCCAAACTGCTGTCAAACTCTCCGGAGCCTCTTCGGCATCGGACTCGCTCACCACCTCAAACAAACCTCGACTTTCTTGTTTCCAAACCT...

CDS

下载 CDS FASTA

3366 bp · TkA07G394760|TK1151|CDS

ATGGGGAAACGGCAGATCTTGTGTCTCATTTGTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCACTTTACATCGTGCAGCAAATTCTACTTCCTGTTCTACAGATTTCAGCTATGTCACCACCTTCCCATGGGACAACTCAGCCTGCCGGACCGCCACCACCAACGGCACCGCCACCCCAAACTGCTGTCAAACTCTCCGGAGCCTCTTCGGCATCGGACTCGCTCACCACCTCAAACAAACCTCGACTTTCTTGTTTCCAAACCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1121 aa · TkA07G394760|TK1151|PROTEIN

MGKRQILCLICVFFFFFFPTLHRAANSTSCSTDFSYVTTFPWDNSACRTATTNGTATPNCCQTLRSLFGIGLAHHLKQTSTFLFPNLQSSDSCLSDFQSNLSSISIPQIFSTCLTTTTEFVAVPSNCAEIVTVSDWVNKSGSTTALESSCNVDFAGFLRCSSCLDAGMAVNARLVSLSRNSSKCFTFTALYAAAIVNNFGPEDTRTADCILGITLAKPRSKSKSNKNTIFAIIGALIGTLLFLGAVFAYRRYKNKRKATQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G394760
TK1151 IDTkA07G394760
OH-1004 IDLXL04_030286
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G394760
位置Chr07:99154770-99158966 (+)
描述Similar to At1g77360: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77360, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11050 可能的受体样蛋白激酶At1g11050。 暂无已核实直接文献
At2g48010 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 RKF3。 暂无已核实直接文献
At1g77360 含五肽重复的蛋白 At1g77360，线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g01540 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。 暂无已核实直接文献
At4g34500 可能的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g34500。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030286 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11050
ath:AT1G52640
ath:AT1G71060
ath:AT1G77360
ath:AT2G48010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.476
排名 1 · TkA07G394760 · TK1151
质体0.236
排名 2 · TkA07G394760 · TK1151
内质网0.084
排名 3 · TkA07G394760 · TK1151
细胞质0.084
排名 4 · TkA07G394760 · TK1151
细胞核0.076
排名 5 · TkA07G394760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19160SPARK26-185 aa
PF17524CnrY131-198 aa
PF28574Transporter_N222-252 aa
PF00069Pkinase296-514 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr298-504 aa
PF03109ABC1300-322 aa
PF03109ABC1411-452 aa
PF17667Pkinase_fungal418-487 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G394760PF19160SPARK261851.3e-35123.8
TkA07G394760PF17524CnrY1311980.02915.4
TkA07G394760PF28574Transporter_N2222520.2612.0
TkA07G394760PF00069Pkinase2965144.8e-41141.6
TkA07G394760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2985047.5e-42144.1
TkA07G394760PF03109ABC13003220.0001821.5
TkA07G394760PF03109ABC14114520.0001821.5
TkA07G394760PF17667Pkinase_fungal4184870.006915.9
TkA07G394760PF31094DUF88076947540.1412.9
TkA07G394760PF05843Suf7098002.07.6
TkA07G394760PF06239ECSIT_N7258120.001318.8
TkA07G394760PF23914TPR_CcmH_CycH7317510.1113.0
TkA07G394760PF24760TPR_IF140_C7348370.0002522.2
TkA07G394760PF29070MSC6_N7369029.6e-2794.8
TkA07G394760PF23276TPR_247377729.7e-2587.7
TkA07G394760PF13041PPR_27417871.3e-72240.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04086拟南芥sp|O04086|Y1105_ARATH Probable receptor-like protein kinase At1g1105049.400%Swiss-Prot中等置信
P93050拟南芥sp|P93050|RKF3_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RKF339.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FVX2拟南芥sp|Q9FVX2|PP129_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77360, mitochondrial48.800%Swiss-Prot低置信
Q3EDL4拟南芥sp|Q3EDL4|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g0154043.300%Swiss-Prot低置信
Q6NKZ9拟南芥sp|Q6NKZ9|Y4345_ARATH Probable receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3450041.800%Swiss-Prot低置信

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