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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G390160
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 97869472-97872717 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3163 bp · TkA07G390160|TK1151|cDNA

AGAGGAGCTAATGCTAATAGGCATCTGATGCAGATTTTGCATTCGATGTTATTCTCTACAAGATTTAGTGGAAGCGTATTAAACTTAAAGACACTTTACATGAAATTCAATTACTACTCTTTTTATCTATATATCTCTTCACTTTCTCACTTCCTCTTAATTATCACCAAACATATCCCCTTTTTTAATCTTCACTTCCTCTCATGGGCTTTCACTATATTTTCATCTTTTATCTTGTATTATTACTTCCATTAATATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2814 bp · TkA07G390160|TK1151|CDS

ATGGGCTTTCACTATATTTTCATCTTTTATCTTGTATTATTACTTCCATTAATATCAAGCTCTTATGAAGCTTCAATGGCGGATCAAGCTGAGTTCTTCCCCCTCATGAAGAATTCTCTAACAGGATCTTTTTTAAACGATTGGGATGATAAACCAGTCTGCAATTATAAAGGTGTTATCTGTGATCAAGAAGGGTACGTAGTGAAGATTGATATTTCCGGGCAGGGGCTTTTCGGTCATTTCCCAGAAAACGTATGCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

937 aa · TkA07G390160|TK1151|PROTEIN

MGFHYIFIFYLVLLLPLISSSYEASMADQAEFFPLMKNSLTGSFLNDWDDKPVCNYKGVICDQEGYVVKIDISGQGLFGHFPENVCSFVPRLRSLSFGYNKIHGDFPQSITNCSFLEQLNITHTNLTGTLPDLSPMKSLKLLDLSSNFFTGAFPMSFINLVNLEIVNFNENAGFDMWRLPENITKLVKLKSMILSTCKVSGTIPKSIGNMTSLVDLELSGNYLVGPVPREIGLLKNLQSLELYYNQLVGGIPEELGNLTE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G390160
TK1151 IDTkA07G390160
OH-1004 IDLXL04_030254
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.613 / OH-1004 94.382
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G390160
位置Chr07:97869472-97872717 (+)
描述Similar to CEPR1: Receptor protein-tyrosine kinase CEPR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49660 受体激酶参与 C 末端编码的植物信号肽 的感知以及根和芽发育的后续调节。
XYLEM INTERMIXED WITH PHLOEM1, a leucine-rich repeat receptor-like kinase required for stem growth and vascular development in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1489-6
CEP5 and XIP1/CEPR1 regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw231
At1g09970 在病原体相关分子模式 诱导的模式触发免疫 信号传导中发挥作用。
RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4
The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献
At3g19700 通过负调控合胞体胚乳的细胞化来调节种子大小。
MINISEED3 (MINI3), a WRKY family gene, and HAIKU2 (IKU2), a leucine-rich repeat (LRR) KINASE gene, are regulators of seed size in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0508418102
At4g28490 具有双重特异性激酶活性作用于丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸底物的受体，控制花器官脱落。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030254 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009960 endosperm development 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0010555 response to mannitol 生物过程
GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09970
ath:AT1G28440
ath:AT1G72180
ath:AT3G19700
ath:AT5G49660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.876
排名 1 · TkA07G390160 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA07G390160 · TK1151
细胞质0.061
排名 3 · TkA07G390160 · TK1151
细胞核0.034
排名 4 · TkA07G390160 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA07G390160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_235-62 aa
PF00560LRR_169-87 aa
PF13855LRR_883-126 aa
PF12799LRR_490-134 aa
PF24048LRR_NXF1-590-145 aa
PF00560LRR_191-113 aa
PF23598LRR_1491-164 aa
PF23598LRR_1492-244 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G390160PF08263LRRNT_235620.0002621.9
TkA07G390160PF00560LRR_169875.1e-32103.7
TkA07G390160PF13855LRR_8831262.2e-2898.5
TkA07G390160PF12799LRR_4901343.6e-2381.8
TkA07G390160PF24048LRR_NXF1-5901450.212.0
TkA07G390160PF00560LRR_1911135.1e-32103.7
TkA07G390160PF23598LRR_14911641.6e-2177.2
TkA07G390160PF23598LRR_14922441.6e-2177.2
TkA07G390160PF24758LRR_At5g563701031459.7e-0522.8
TkA07G390160PF23286LRR_131051240.1712.2
TkA07G390160PF25019LRR_R13L1-DRL211061450.007416.9
TkA07G390160PF25013LRR_Zer-11101290.0001322.8
TkA07G390160PF00560LRR_11161325.1e-32103.7
TkA07G390160PF29252LRR_NLRC41241610.03414.1
TkA07G390160PF23598LRR_141303321.6e-2177.2
TkA07G390160PF25013LRR_Zer-11331970.0001322.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FGL5拟南芥sp|Q9FGL5|CEPR1_ARATH Receptor protein-tyrosine kinase CEPR169.100%Swiss-Prot高置信
F4I2N7拟南芥sp|F4I2N7|RLK7_ARATH Receptor-like protein kinase 746.500%Swiss-Prot低置信
Q9SGP2拟南芥sp|Q9SGP2|HSL1_ARATH Receptor-like protein kinase HSL141.300%Swiss-Prot低置信
Q9LJM4拟南芥sp|Q9LJM4|IKU2_ARATH Receptor-like protein kinase HAIKU239.800%Swiss-Prot低置信
P47735拟南芥sp|P47735|RLK5_ARATH Receptor-like protein kinase 542.100%Swiss-Prot低置信

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