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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G381440
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 95612850-95614389 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

678 bp · TkA07G381440|TK1151|cDNA

TATAAATAAAGGATTTTGCCCTAAATTTCAAAATTCACATCGTTTGAAAGGGGATCGACGACGAAGATTTTCTGATACAGAATCAAGATGGCTCGTACTAAGCAAACTGCTCGTAAGTCCACCGGAGGAAAGGCTCCCAGGAAGCAACTTGCCACCAAGGCTGCCCGCAAGTCTGCCCCAACAACCGGAGGAGTGAAGAAGCCTCACAGATACAGACCCGGAACTGTTGCCCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

411 bp · TkA07G381440|TK1151|CDS

ATGGCTCGTACTAAGCAAACTGCTCGTAAGTCCACCGGAGGAAAGGCTCCCAGGAAGCAACTTGCCACCAAGGCTGCCCGCAAGTCTGCCCCAACAACCGGAGGAGTGAAGAAGCCTCACAGATACAGACCCGGAACTGTTGCCCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAAAGTACGGAGCTTTTGATCCGGAAGCTTCCTTTCCAAAGGCTTGTTCGTGAGATTGCTCAGGACTTCAAGACGGATTTGCGATTCCAGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

136 aa · TkA07G381440|TK1151|PROTEIN

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPTTGGVKKPHRYRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSHAVLALQEAAEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G381440
TK1151 IDTkA07G381440
OH-1004 IDLXL04_030141
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G381440
位置Chr07:95612850-95614389 (+)
描述Similar to Histone H3.3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: P59169 变异组蛋白 H3，可在活跃基因的广泛核小体中取代常规 H3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030141 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0031507 heterochromatin formation 生物过程
GO:0000786 nucleosome 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0030527 structural constituent of chromatin 分子功能
GO:0031492 nucleosomal DNA binding 分子功能
GO:0046982 protein heterodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
dosa:Os03g0390600
dosa:Os04g0450800
dosa:Os06g0130900
nta:107801897
nta:107801898
nta:107810536
nta:107813079
nta:107818315
osa:4333019
osa:4340006
vvi:100248958
vvi:100257369
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.965
排名 1 · TkA07G381440 · TK1151
细胞质0.074
排名 2 · TkA07G381440 · TK1151
细胞外0.020
排名 3 · TkA07G381440 · TK1151
细胞膜0.009
排名 4 · TkA07G381440 · TK1151
线粒体0.007
排名 5 · TkA07G381440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15715PAF1-58 aa
PF02291TFIID-31kDa11-27 aa
PF15511CENP-T_C19-33 aa
PF00125Histone44-131 aa
PF21150YebU_pre-PUA_dom51-93 aa
PF14744WASH-7_mid55-130 aa
PF00808CBFD_NFYB_HMF65-128 aa
PF15511CENP-T_C69-130 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G381440PF15715PAF1580.0001423.3
TkA07G381440PF02291TFIID-31kDa11270.01616.0
TkA07G381440PF15511CENP-T_C19330.0001922.2
TkA07G381440PF00125Histone441318.2e-39132.6
TkA07G381440PF21150YebU_pre-PUA_dom51930.02615.1
TkA07G381440PF14744WASH-7_mid551300.1911.5
TkA07G381440PF00808CBFD_NFYB_HMF651280.006617.4
TkA07G381440PF15511CENP-T_C691300.0001922.2
TkA07G381440PF15630CENP-S711300.0005820.9
TkA07G381440PF02291TFIID-31kDa841300.01616.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P59169拟南芥sp|P59169|H33_ARATH Histone H3.3100.000%Swiss-Prot高置信

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