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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G370790
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 92956942-92963127 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3848 bp · TkA07G370790|TK1151|cDNA

AAGAAGTGAGAGAAAGAACAGAAAGAAGTGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAGAGAGAGGAAAAAGCTCTCTACTATGTTCATGGGTTTCTTCAAGAGATTTGTCGTGTGAAGTGCGTTCTCTTAGATTTCCAAAAGTCTGTTTCTTTCAGTGTTTATGTGTTTAAGTTTGTGTGTATTTCGGTGATTCAATGGATACCAAAGGACGGCTTGTTGCGGGTTCACACAATCGGAATGAATTTGTTCTAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

3300 bp · TkA07G370790|TK1151|CDS

ATGGATACCAAAGGACGGCTTGTTGCGGGTTCACACAATCGGAATGAATTTGTTCTAATCAATGCGGATGAAGTTGGAAGAGTGACTTCTGTTAAAGAATTGAGTGGACAGATTTGTCAGATTTGTGGAGATGAGATTGAAATAACAGTCGATGGAGAGCCATTTGTTGCTTGCAATGAATGTGCTTTCCCGATTTGTAGGCCTTGCTATGAATATGAACGAAGGGAGGGAAATCAATCTTGTCCTCAATGCAAAACTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1099 aa · TkA07G370790|TK1151|PROTEIN

MDTKGRLVAGSHNRNEFVLINADEVGRVTSVKELSGQICQICGDEIEITVDGEPFVACNECAFPICRPCYEYERREGNQSCPQCKTRYKRIKGSPRVDGDEDEEGFDDLDNEFDLANYSGRDPHNVADMAFSSRLNIGRGNSNASGFATPSEVDGATLNPEIPLLTFGQEDDGISADKHALIIPPFMNRTKRVHPMPFSDTASQVSMPPRPMDPKKDLAVYGYGTVAWKDRMEEWRKRQNDKLQMVKHEGGGGGHNDGDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G370790
TK1151 IDTkA07G370790
OH-1004 IDLXL04_030016
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G370790
位置Chr07:92956942-92963127 (+)
描述Similar to CESA6: Cellulose synthase A catalytic subunit 6 [UDP-forming]
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g39350 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
Functional analysis of the cellulose synthase genes CesA1, CesA2, and CesA3 in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.010931
Knockout of the AtCESA2 gene affects microtubule orientation and causes abnormal cell expansion in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.088393
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104
At5g64740 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
PROCUSTE1 encodes a cellulose synthase required for normal cell elongation specifically in roots and dark-grown hypocotyls of Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.12.2409
Resistance against herbicide isoxaben and cellulose deficiency caused by distinct mutations in same cellulose synthase isoform CESA6.2002 · DOI: 10.1104/pp.010822
Genetic evidence for three unique components in primary cell-wall cellulose synthase complexes in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706592104
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104
At2g21770 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
At5g09870 纤维素合酶末端复合物（“玫瑰花结”）的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶（细胞壁形成的主要机制）所需的。
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0424400 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030016 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010192 mucilage biosynthetic process 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21770
ath:AT4G39350
ath:AT5G09870
ath:AT5G64740
dosa:Os07g0424400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.563
排名 1 · TkA07G370790 · TK1151
内质网0.189
排名 2 · TkA07G370790 · TK1151
高尔基体0.158
排名 3 · TkA07G370790 · TK1151
细胞质0.143
排名 4 · TkA07G370790 · TK1151
溶酶体／液泡0.104
排名 5 · TkA07G370790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14569zf-UDP30-104 aa
PF02318FYVE_230-87 aa
PF14446Prok-RING_137-73 aa
PF14570zf-RING_439-89 aa
PF00097zf-C3HC439-84 aa
PF14446Prok-RING_181-90 aa
PF03552Cellulose_synt369-1086 aa
PF13641Glyco_tranf_2_3385-409 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G370790PF14569zf-UDP301042.7e-41140.2
TkA07G370790PF02318FYVE_230870.01216.5
TkA07G370790PF14446Prok-RING_137730.01915.8
TkA07G370790PF14570zf-RING_439891.4e-0525.4
TkA07G370790PF00097zf-C3HC439840.8610.2
TkA07G370790PF14446Prok-RING_181900.01915.8
TkA07G370790PF03552Cellulose_synt36910861345.4
TkA07G370790PF13641Glyco_tranf_2_33854090.1312.7
TkA07G370790PF13632Glyco_trans_2_35876561.9e-0628.6
TkA07G370790PF20322DUF66176867290.310.9
TkA07G370790PF13632Glyco_trans_2_37898941.9e-0628.6
TkA07G370790PF13641Glyco_tranf_2_37948420.1312.7
TkA07G370790PF13632Glyco_trans_2_3102510741.9e-0628.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O48947拟南芥sp|O48947|CESA2_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 2 [UDP-forming]78.800%Swiss-Prot高置信
Q94JQ6拟南芥sp|Q94JQ6|CESA6_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 6 [UDP-forming]77.000%Swiss-Prot高置信
Q9SJ22拟南芥sp|Q9SJ22|CESA9_ARATH Probable cellulose synthase A catalytic subunit 9 [UDP-forming]75.700%Swiss-Prot高置信
Q8L778拟南芥sp|Q8L778|CESA5_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]77.200%Swiss-Prot高置信
Q69V23水稻sp|Q69V23|CESA3_ORYSJ Probable cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]72.200%Swiss-Prot高置信

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