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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G354320
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 88630264-88633177 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2786 bp · TkA07G354320|TK1151|cDNA

TTTATACTGGCATGTTTTACTTGATGTTTTGTTTTCCTGTAAAAGCCATCCCGTCTATCATCACAGATTCATTTCATGGGTTCTTTTTCCACGTTGACGTGGGTATTGTATAATTTTCATTGCTGATATTTATTTCGTAGTATTATTGGGGACCATGATTATGAATCAACGTTAGCAACTTCAAATTTTTTCCACACGCTTTCAAGACCTCAATGAATTCCACAATGGTAGTAAATGACTAAATGTATTTAGTGGTCCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1962 bp · TkA07G354320|TK1151|CDS

ATGGTTGGTTGCTTCTCCACACTAATGGCGGTAAGGATAAAAACATCACAGGTCAGATATCTCAAGCGACTTCTGCTTCTATCCTTGATTCGGCACTACGCGACTGGAAAATTCATTCTGAAAATGATGCTCCAAGGATACCTTTCGGCTTTCCCGATAATTGGGTCTTCCGATGATACTTATAGCAGATACTGGTCAACTGACACGTTATCTACGGATACAGAGTCGTTATACCTCAGCCCTAATGGGTCTCTGATTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

653 aa · TkA07G354320|TK1151|PROTEIN

MVGCFSTLMAVRIKTSQVRYLKRLLLLSLIRHYATGKFILKMMLQGYLSAFPIIGSSDDTYSRYWSTDTLSTDTESLYLSPNGSLILVQYNGTRMVVNKPTSSESGMDYEAVIFRATLDWDGNFVLYSHRFTNSSSVMKIEWKALQDPCQAKGICGFNSYCTSIDGEFQCHCLPGFVDLNDTRDVKYYGCYRNFTDEEACNRKGLELSYNVTELDNMDLLAYKSYSVMKLSKDDCRRSCFDDCNCWASLYYGDGNCKKLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G354320
TK1151 IDTkA07G354320
OH-1004 IDLXL04_029855
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.406 / OH-1004 81.332
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G354320
位置Chr07:88630264-88633177 (-)
描述Similar to LECRK1: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0201900 参与先天免疫。 暂无已核实直接文献
UniProt: A0A075F7E9 参与先天免疫。 暂无已核实直接文献
Os04g0202500 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q25AG3 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q25AG2 似乎不参与对食草昆虫褐飞虱（N.lugens，BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029855 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
dosa:Os04g0201900
dosa:Os04g0202500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.843
排名 1 · TkA07G354320 · TK1151
内质网0.092
排名 2 · TkA07G354320 · TK1151
细胞质0.077
排名 3 · TkA07G354320 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA07G354320 · TK1151
溶酶体／液泡0.034
排名 5 · TkA07G354320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00954S_locus_glycop111-177 aa
PF00008EGF146-177 aa
PF07645EGF_CA149-177 aa
PF12947EGF_3152-177 aa
PF25478EGF_Mua-3154-183 aa
PF12661hEGF155-176 aa
PF08276PAN_2212-247 aa
PF08277PAN_3222-257 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G354320PF00954S_locus_glycop1111773.7e-0524.9
TkA07G354320PF00008EGF1461770.08313.9
TkA07G354320PF07645EGF_CA1491770.9710.4
TkA07G354320PF12947EGF_31521770.01516.3
TkA07G354320PF25478EGF_Mua-31541830.04214.6
TkA07G354320PF12661hEGF1551760.2612.5
TkA07G354320PF08276PAN_22122470.002718.5
TkA07G354320PF08277PAN_32222570.02415.2
TkA07G354320PF12947EGF_32432550.01516.3
TkA07G354320PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3736326.4e-41141.1
TkA07G354320PF00069Pkinase3746313.3e-37129.0
TkA07G354320PF03109ABC13754030.05813.2
TkA07G354320PF03109ABC14805290.05813.2
TkA07G354320PF07645EGF_CA4844930.9710.4
TkA07G354320PF14531Kinase-like4885710.1512.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q7FAZ3水稻sp|Q7FAZ3|LERK1_ORYSJ G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK137.100%Swiss-Prot中等置信
A0A075F7E9水稻sp|A0A075F7E9|LERK1_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK136.900%Swiss-Prot中等置信
Q0JEU6水稻sp|Q0JEU6|LERK3_ORYSJ G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK336.700%Swiss-Prot中等置信
Q25AG3水稻sp|Q25AG3|LERK3_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK336.600%Swiss-Prot中等置信
Q25AG2水稻sp|Q25AG2|LERK4_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK437.100%Swiss-Prot中等置信

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